New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1928307 | 53 (1.010) | 4 (0.080) | 4/236 | NT | 7.6% | coding (1827/2154 nt) | PP_1728 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 1928327 | 46 (0.910) | coding (1807/2154 nt) | PP_1728 | membrane protein |
CCCTGCAGCTCGAGCGGCGACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGCCGCCGACATCCACATAGTCGTCGATGGCCAGC > NC_002947/1928182‑1928475 | cccTGCAGCTCGAGCGGCGACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCccgc > 2:362992‑M2/1‑146 (MQ=255) ccTGCAGCTCGAGCGGCGACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCccgcg < 1:795735‑M2/150‑6 (MQ=255) cTGCAGCTCGAGCGGCGACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGa > 1:841029/1‑150 (MQ=255) cTGCAGCTCGAGCGGCGACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGAGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGa < 2:573966/150‑1 (MQ=255) aGCTCGAGCGGCGACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTCGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGagtag < 1:155031/150‑1 (MQ=255) aGCTCGAGCGGCGACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGGTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGagtag > 2:487110/1‑150 (MQ=255) tCGAGCGGCGACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTc < 2:118096/150‑1 (MQ=255) cGAGCGGCGACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCt < 1:745507/150‑1 (MQ=255) ggcgACAAGATATTACGGCGCATCAGCGTGTCGTTGCTCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATg < 2:1375009/150‑1 (MQ=255) gACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCt < 2:224241/142‑1 (MQ=255) gACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCt > 1:224241/1‑142 (MQ=255) gACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGctc > 1:1075346/1‑150 (MQ=255) aCCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGGAGTTCGGCTACGCGATCTTccgcgtggcaatcccgcacagca > 2:997012‑M2/1‑127 (MQ=255) tatTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGAttt < 1:199228/150‑1 (MQ=255) tACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGc < 1:1387859/150‑1 (MQ=255) aCGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCt > 1:1249624/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGAt < 2:1052082/150‑1 (MQ=255) gcAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGc > 1:534580/1‑150 (MQ=255) tCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGa < 2:1063670/150‑1 (MQ=255) ccccACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTc > 1:1225771/1‑150 (MQ=255) ccccACTTCGCGAAACAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGAt < 2:850376/126‑1 (MQ=255) ccccACTTCGCGAAACAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGAt > 1:850376/1‑126 (MQ=255) ccACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTcgc > 1:237506/1‑150 (MQ=255) ccACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTcgc < 1:988057/150‑1 (MQ=255) tCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑gg < 2:623321/150‑1 (MQ=255) ccAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACgg > 1:85944/1‑150 (MQ=255) aGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTa > 2:1344488/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGAACGGTACGAATGGTCa > 1:241561/1‑150 (MQ=255) tCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCt > 1:981019/1‑150 (MQ=255) gcctGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCtt > 2:1285909/4‑150 (MQ=255) gATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTc < 1:1117914/150‑1 (MQ=255) gATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGCAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTc > 1:1266667/1‑150 (MQ=255) tgtgCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGTCGa < 2:1225771/150‑1 (MQ=255) gtgCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAg < 1:1277537/150‑1 (MQ=255) tgCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAgg < 2:795735/150‑1 (MQ=255) gCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAg > 1:687417/1‑148 (MQ=255) gCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAg < 2:687417/148‑1 (MQ=255) gCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGt < 2:1075346/150‑1 (MQ=255) cGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGAGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTg < 1:1355896/150‑1 (MQ=255) gCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGccgccg > 2:40737/1‑150 (MQ=255) gCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGccgccg < 1:40737/150‑1 (MQ=255) ccACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGa < 2:763924/138‑1 (MQ=255) ccACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGa > 1:763924/1‑138 (MQ=255) cACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGCCGCCGAc > 2:1982/1‑150 (MQ=255) aCGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCccgcgtggcaatcccgcacagcatgaacatcgaccaggcgatctcgctggttcgcgaagtggggcagaagctgc > 2:215801‑M2/1‑26 (MQ=255) aCGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCccgcgtggcaatcccgcacagcatgaacatcgaccaggcgatctcgctggttcgcgaagtggggcagaagctgc < 1:215801‑M2/100‑75 (MQ=255) aCGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGAt > 1:1099737/1‑89 (MQ=255) aCGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGAt < 2:1099737/89‑1 (MQ=255) aCGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTcgc < 2:467427/94‑1 (MQ=255) aCGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTcgc > 1:467427/1‑94 (MQ=255) gcgGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGCCGCCGACATc < 1:487110/150‑1 (MQ=255) gcgGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTCCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCG‑GGCGGACGGTACGTATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGCCGCCGACATc < 2:761053/150‑1 (MQ=255) cgGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCCCGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGCCGCCGACATcc < 2:123876/150‑1 (MQ=255) cgGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGCCGCCGACATcc < 2:1266667/150‑1 (MQ=255) gTAGCCGAACTCccgcgtggcaatcccgcacagcatgaacatcgaccaggcgatctcgctggttcgcgaagtggggcagaagctgcgcaacgacccgctgatgcgccgtaatatctggtcgccgctcgagctgcagggggtggagagctt > 1:997012‑M2/1‑12 (MQ=255) ccGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGTTCAGGCTGGACGGGATTGTATGCACGATGCCGTCGTTGTAGAAAATAGCG‑GCTGGAGGAACGGAGAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGCCGCCGCCATCCACATAGTCGTCGATg > 1:679102/1‑150 (MQ=255) tCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGCCGCCGACATCCACATAGTCGTCGATGGCCAGc < 1:544841/150‑1 (MQ=255) | CCCTGCAGCTCGAGCGGCGACCAGATATTACGGCGCATCAGCGGGTCGTTGCGCAGCTTCTGCCCCACTTCGCGAACCAGCGAGATCGCCTGGTCGATGTTCATGCTGTGCGGGATTGCCACGCGGAAGATCGCGTAGCCGAACTCCCGCGAGTAGTTCTTGATGCTCTTGATTTCGCTGAACGGGATGGTATGCACGATGCCGTCGATGTCGCGCA‑GGCGCACGGTACGAATGGTCAACCCTTCCACCGTGCCGAGGTGGCCGCCGACATCCACATAGTCGTCGATGGCCAGC > NC_002947/1928182‑1928475 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |