New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2526004 = | 50 (0.950) | 4 (0.080) | 4/236 | NT | 7.9% | coding (205/1194 nt) | PP_2215 | acetyl‑CoA acetyltransferase |
? | NC_002947 | 2526033 = | 45 (0.890) | coding (234/1194 nt) | PP_2215 | acetyl‑CoA acetyltransferase |
TGCGCCGCAACTGGGCAGCGCCGCCATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCATGGAAAGCATGACCAACGCGCC > NC_002947/2525886‑2526176 | tGCGCCGCAACTGGGCAGCGCCGCCATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCt > 1:681173/1‑150 (MQ=255) gcAACTGGGCAGCGCCGCCATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTTTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACaa < 1:451282/150‑1 (MQ=255) gcAACTGGGCAGCGCCGCCATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACaa < 1:561187/150‑1 (MQ=255) tGGGCAGCGCCGCCATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGcaca < 1:495348/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGCCATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACaccacc < 1:29493/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGCCATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACaccacc < 1:939471/150‑1 (MQ=255) cgccgcCATTCGTGGTGCCGTGGAACGCGCGGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTAGCACAGCACACCACCTg < 2:1063485/150‑1 (MQ=255) cgccATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGcac > 2:882719/1‑150 (MQ=255) ccATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCTGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCAGCGCTGGACGCCGTGCTGGACAAGCACACCACCTGcacca > 2:308769/1‑150 (MQ=255) ccATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGcacca < 1:818931/150‑1 (MQ=255) aTTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCaccacc > 1:272387/1‑150 (MQ=255) aTTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCCGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACaccacc > 2:175520/1‑141 (MQ=255) aTTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCCGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCACGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACaccacc < 1:175520/141‑1 (MQ=255) tgctgcCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGaa < 2:681173/150‑1 (MQ=255) tgctgcCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGaa < 1:881486/150‑1 (MQ=255) gggactggCCGGCAGCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGAtgtg < 2:154635/144‑1 (MQ=255) ggAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGAtgtg < 2:1081489/150‑1 (MQ=255) gAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGc < 2:272387/150‑1 (MQ=255) catgggccatgatcgcggcttgcatacccgagccgcacatcttgttcagggtggtgcaggtggtgtgcttgtccagcCCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCggg > 2:586938‑M1/78‑107 (MQ=255) catgggccatgatcgcggcttgcatacccgagccgcacatcttgttcagggtggtgcaggtggtgtgcttgtccagcCCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCggg < 1:586938‑M1/30‑1 (MQ=255) cATCGATGCCGCCGGTGTCGAGAAGGAACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCAGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCACTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTAt > 2:199552/1‑150 (MQ=255) gATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCaa > 2:941099/1‑150 (MQ=255) gcttgcatacccgagccgcacatcttgttcagggtggtgcaggtggtgtgcttgtccagcCCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCt < 2:1133546‑M1/32‑1 (MQ=255) gcttgcatacccgagccgcacatcttgttcagggtggtgcaggtggtgtgcttgtccagcCCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCt > 1:1133546‑M1/61‑92 (MQ=255) cgccgGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTg > 1:361713/1‑108 (MQ=255) cgccgGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTg < 2:361713/108‑1 (MQ=255) gccgGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCcgcg > 2:222047/1‑150 (MQ=255) aGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTACCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGCACAAGGTGTGCGGCGCGGGTATGCAAGCCGCGATCGTGGccc > 1:536878/1‑150 (MQ=255) ttCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGcaca > 2:149287/1‑79 (MQ=255) ttCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGcaca < 1:149287/79‑1 (MQ=255) ttCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACctgctg > 2:56281/1‑150 (MQ=255) ggCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACctgctgctg > 1:508503/1‑150 (MQ=255) tGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGcc < 1:1137615/150‑1 (MQ=255) tGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTACGGTATCCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGcc > 1:537254/1‑150 (MQ=255) ggccggccAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGa > 1:427697/1‑86 (MQ=255) ggccggccAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGa < 2:427697/86‑1 (MQ=255) ccggtgcctggccctggCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATg < 2:1190150/98‑1 (MQ=255) cggccAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGt < 1:989999/150‑1 (MQ=255) cggccAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGt < 1:882719/150‑1 (MQ=255) cggccAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGt < 1:308769/150‑1 (MQ=255) ggcgagggccagGCACCGGCACGCCCGGCCGCGCTGGGCGCCGGCCTGGGCAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTCCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGACCCATGACCTGCTGCTTGCCTGCCCCGCAGACCTg > 2:290411/1‑150 (MQ=255) gccagggccaggCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTgg > 1:106052/1‑150 (MQ=255) aggCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCgg > 2:65127/1‑150 (MQ=255) gCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGt > 2:123789/1‑150 (MQ=255) agcccggcgcccagcgcggcctggcgtgccggGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGc > 1:1133546‑M2/33‑92 (MQ=255) agcccggcgcccagcgcggcctggcgtgccggGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGc < 2:1133546‑M2/60‑1 (MQ=255) cACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTg < 1:56281/150‑1 (MQ=255) cccggcgcccagcgcggcctggcgtgccggGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATg < 1:586938‑M2/77‑1 (MQ=255) cccggcgcccagcgcggcctggcgtgccggGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATg > 2:586938‑M2/31‑107 (MQ=255) GGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCAt > 1:277743‑M1/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGGGGCATGGaaa > 1:1363563/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCATGGAAAg > 2:286677/1‑150 (MQ=255) cgcTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCATGGAAAGCATGACCa > 2:477262/1‑150 (MQ=255) gcTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCATGGAAAGCATGACCaa > 1:1238678/1‑150 (MQ=255) gcTGGACGCAGTGCTGGACAAGCACAACACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCGCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCATGGAAAGCATGACCaa < 2:537254/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATg < 1:889281/80‑1 (MQ=255) tGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATg > 2:889281/1‑80 (MQ=255) tGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCATGGAAAGCATGACCAAcg > 2:446269/1‑150 (MQ=255) tGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCAGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCATGGAAAGCATGACCAAcg > 2:872181/1‑150 (MQ=255) gggCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGc < 2:511718/123‑1 (MQ=255) gggCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGc > 1:511718/1‑123 (MQ=255) gggCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCATGGAAAGCATGACCAAcgc < 2:508503/150‑1 (MQ=255) cgcCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGACGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCATGGAAAGCATGACCAACGCGcc < 1:866586/150‑1 (MQ=255) | TGCGCCGCAACTGGGCAGCGCCGCCATTCGTGCTGCCGTGGAACGGGCCGGCATCGATGCCGCCGGTGTCGAGCAGGTACTGTTCGGCTGCGTGCTGCCGGCCGGCCAGGGCCAGGCACCGGCACGCCAGGCCGCGCTGGGCGCCGGGCTGGACAAGCACACCACCTGCACCACCCTGAACAAGATGTGCGGCTCGGGTATGCAAGCCGCGATCATGGCCCATGACCTGCTGCTGGCCGGCACCGCAGACGTGGTAGTGGCGGGTGGCATGGAAAGCATGACCAACGCGCC > NC_002947/2525886‑2526176 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |