New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2773866 | 52 (0.990) | 3 (0.060) | 3/234 | NT | 6.0% | coding (827/1053 nt) | calA | coniferyl alcohol dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 2773912 | 45 (0.900) | coding (873/1053 nt) | calA | coniferyl alcohol dehydrogenase |
GACACCATTCCGGTGCAGCACGACCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTAC > NC_002947/2773769‑2774056 | gACACCATTCCGGTGCAGCACGACCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGgggtcg < 1:931096‑M2/150‑7 (MQ=255) acCATTCCGGTGCAGCACGACCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTg > 2:270156/1‑150 (MQ=255) cATTCCGGTGCAGCACGACCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGAt > 2:192120/1‑150 (MQ=255) cATTCCGGTGCAGCACGACCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGAt > 2:266051/1‑150 (MQ=255) ttCCGGTGCAGCACGACCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCg < 1:192120/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCAGCACGACCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCggg < 1:874297/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCAGCACGACCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCggg < 2:884786/150‑1 (MQ=255) gcagcaCGACCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGAt > 2:583776/1‑150 (MQ=255) aCCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCgaga < 2:958289/150‑1 (MQ=255) aaCCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAg < 2:1274187/150‑1 (MQ=255) cccGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGa > 2:1227392/1‑150 (MQ=255) gtagAAACGCTGAAGTTCGACGGTGGGCACTTCCTGGTCGGGCGGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGTGTCGTTGATCGGGGTGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTg < 2:579496/147‑1 (MQ=255) tGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTgg > 1:1273474/1‑150 (MQ=255) gAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTg > 1:1189484/1‑147 (MQ=255) gAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTg < 2:1189484/147‑1 (MQ=255) gAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGAc > 1:1001108/1‑150 (MQ=255) cTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTgc < 1:77966/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTgcg > 1:481771/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTgcg > 2:1327888/1‑150 (MQ=255) gTTCGACTGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGa < 2:931096/150‑1 (MQ=255) ttCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAg > 1:1070563/1‑150 (MQ=255) ttCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAg > 1:794957/1‑150 (MQ=255) cGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCggggg > 2:196588/1‑108 (MQ=255) cGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCggggg < 1:196588/108‑1 (MQ=255) gACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATc < 2:380307/102‑1 (MQ=255) gACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATc > 1:380307/1‑102 (MQ=255) acaTCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGtt < 2:846489/150‑1 (MQ=255) aTCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTg < 1:1358271/117‑1 (MQ=255) aTCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTg > 2:1358271/1‑117 (MQ=255) tCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTgg < 1:266051/150‑1 (MQ=255) aaCCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCAc < 2:479019/119‑1 (MQ=255) aaCCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCAc > 1:479019/1‑119 (MQ=255) cGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATcc < 2:1273474/150‑1 (MQ=255) gATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGgggtcgatcggttcgatcaggccgaccaggatgtgcacaccgtcgaacttcagcgtttccaggtacaggttgaggtcgtgctgcaccggaatggt < 1:543039‑M2/150‑96 (MQ=255) aTCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGgggtcgatcggttcgatcaggccgaccaggatgtgcacaccgtcgaacttcagcgtttccaggtacgggttgaggtcgtgctgcaccggaatggtg < 1:555876‑M2/150‑97 (MQ=255) aTCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCCGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGc > 1:224068/1‑150 (MQ=255) aTCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGc > 1:475553/1‑150 (MQ=255) cGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCaa < 2:1001108/150‑1 (MQ=255) ccGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCa > 1:851616/1‑80 (MQ=255) ccGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCa < 2:851616/80‑1 (MQ=255) ccGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGGGTCATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATc < 1:1327888/150‑1 (MQ=255) cGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGgggtcgatcggttcgatcaggccgaccaggatgtgcacaccgtcgaacttcagcgtttccaggtacgggttgaggtcgtgctgcaccggaatggtgtcgagca > 2:555876‑M2/1‑47 (MQ=255) cGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCa > 2:965504/1‑150 (MQ=255) gCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGc < 2:929824/150‑1 (MQ=255) gCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTAt < 2:1070563/150‑1 (MQ=255) aaTCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCgg < 1:843419/150‑1 (MQ=255) aTCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTg < 2:36354/116‑1 (MQ=255) aTCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTg > 1:36354/1‑116 (MQ=255) gaAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCgg < 2:481771/150‑1 (MQ=255) gcgcCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGa > 1:1343027/1‑150 (MQ=255) cgcCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGTCTGGGCTAGACTCAGGAAGTGGTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGAt < 2:113961/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTAc < 1:1227392/150‑1 (MQ=255) ggggTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTgg > 2:1268066/1‑89 (MQ=255) ggggTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTgg < 1:1268066/89‑1 (MQ=255) | GACACCATTCCGGTGCAGCACGACCTCAACCCGTACCTGGAAACGCTGAAGTTCGACGGTGTGCACATCCTGGTCGGCCTGATCGAACCGATCGACCCGGCATTGCATGCGGCCAATCTGGTGATGAAGCGCCGGGTGCTGGCGGGGTCGTTGATCGGGGGGATTGCCGAGACTCAGGAAGTGCTGGACTTCTGCGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTAC > NC_002947/2773769‑2774056 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |