New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3039864 | 38 (0.720) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 7.5% | coding (906/1344 nt) | PP_2651 | MFS transporter |
? | NC_002947 | = 3039918 | 37 (0.720) | coding (960/1344 nt) | PP_2651 | MFS transporter |
CTGCACCTGACCTGGCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTGTTCAGCGTGA > NC_002947/3039769‑3040054 | cTGCACCTGACCTGGCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGt < 2:526740/150‑1 (MQ=255) cACCTGACCTGGCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTAAAAGACCGCCTGGGTGGTCTAGCGGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTgcc < 1:173685‑M2/150‑4 (MQ=255) ctgacctgGCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAgt < 1:509220/150‑1 (MQ=255) cctgGCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGc < 2:947499/150‑1 (MQ=255) ctgGCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCt > 1:1061957/1‑150 (MQ=255) ggCTGCCGGGCTCCTACGCACGAGACTTTGGATCGAGCTTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTgg < 2:1142976/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTgg < 2:1040334/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTggg > 1:558519/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAg > 2:910063/1‑150 (MQ=255) cGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAgtgt < 2:42287/139‑1 (MQ=255) cGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAgtgt > 1:42287/1‑139 (MQ=255) gggCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCg > 1:342513/1‑150 (MQ=255) cTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGAAAGTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCaa > 1:86974/1‑150 (MQ=255) ttCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCgg < 1:910063/150‑1 (MQ=255) cgAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCCCCCTTGTAGCAGCACACTTCCGCGATCGGCTAGTGCGGCAAGGGCGCAGTGGGCGGTGTAGGCGTGAGCGGGTTGTCGt < 2:375208/150‑1 (MQ=255) tGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGc > 1:280980/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGt < 2:778987/150‑1 (MQ=255) gCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGt < 1:605484/150‑1 (MQ=255) gCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTcg > 2:1120487/1‑150 (MQ=255) cAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGAc > 1:880159/1‑131 (MQ=255) cAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGAc < 2:880159/131‑1 (MQ=255) aGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCgg < 2:202339/119‑1 (MQ=255) aGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCgg > 1:202339/1‑119 (MQ=255) gtggtTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGtt > 1:1286914/1‑150 (MQ=255) gtTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTccc > 2:859024/1‑150 (MQ=255) tttCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCgg < 2:1389230/104‑1 (MQ=255) tttCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCgg > 1:1389230/1‑104 (MQ=255) tGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGt > 2:1253369/1‑150 (MQ=255) ccTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTgccgaacacataggccagcgaaaccacccaggcggtctggtacaggctcaagccatgctcgcgttcgaa > 1:508201‑M2/1‑68 (MQ=255) ccTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTgccgaacacataggccagcgaaaccacccaggcggtctggtacaggctcaagccatgctcgcgttcgaa < 2:508201‑M2/137‑70 (MQ=255) cTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCgg > 1:1239588/1‑150 (MQ=255) tgtTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTgccgaacacataggccagcgaaaccacccaggcggtctggtacaggctcaagccatgctcgcgttcgaagtagcccggcagccaggtc < 2:427392‑M2/150‑89 (MQ=255) ggCGCGCTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCACGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTc < 2:342513/150‑1 (MQ=255) cgTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGc < 2:1215098/150‑1 (MQ=255) gTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCgg < 2:1252290/141‑1 (MQ=255) gTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCgg > 1:1252290/1‑141 (MQ=255) ggCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAgt < 2:1286914/150‑1 (MQ=255) gcgGGCCGCATCTGTGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTTGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGctgctg < 1:773461/150‑1 (MQ=255) gCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGtt < 1:1120487/150‑1 (MQ=255) gCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGtt < 2:1061957/150‑1 (MQ=255) cATCTGCGACGGCGTGGTGAAGTAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTTGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTgcgc < 2:173685/150‑1 (MQ=255) tGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGTGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTg > 1:207989/1‑150 (MQ=255) tGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTGTTCAGCGTGa < 2:1239588/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTc > 1:963473/1‑88 (MQ=255) gCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTc < 2:963473/88‑1 (MQ=255) | CTGCACCTGACCTGGCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTGTTCAGCGTGA > NC_002947/3039769‑3040054 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |