New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3135695 | 40 (0.760) | 4 (0.080) | 3/236 | NT | 10.0% | coding (305/1335 nt) | PP_2752 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3135723 | 34 (0.670) | coding (333/1335 nt) | PP_2752 | hypothetical protein |
ACGAAGTCGAAGGCGGCATCAATGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTACAGCGAGG > NC_002947/3135578‑3135865 | aCGAAGTCGAAGGCGGCATCAATGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTgcgc > 2:1425521‑M2/1‑146 (MQ=255) gAAGTCGAAGGCGGCATCAATGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCg > 2:1034784/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGCGGCATCAATGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTg > 1:1340952/1‑150 (MQ=255) gctgcATCAATGGCGTCAAGCTGGTCGGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGTACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCGGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATg < 2:648419/147‑1 (MQ=255) gcggcATCAATGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATg > 2:810091/1‑150 (MQ=255) cATCAATGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCt > 1:660485/1‑150 (MQ=255) ggCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGAc < 2:322762/150‑1 (MQ=255) cGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACaa < 1:810091/150‑1 (MQ=255) cTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCCGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAaggccgag < 2:236639/150‑1 (MQ=255) ggCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGAcc < 1:613418/150‑1 (MQ=255) aGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGa < 1:1321585/150‑1 (MQ=255) aGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGa > 1:421628/1‑150 (MQ=255) tgtgAGACCGAGTGGACGGCCGAGAACGGCATCGAGTGCTACGAGAGCTTGCAGCACAGACTAAATACCGCCACGGTGGCGGTCTACCAGCCCACTGGCGCGCCGGCTGCCTATGCACTGGCGGCAACGGCCGAGGCCGGCCGGACTccc > 2:97588/1‑149 (MQ=255) tgAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCt > 2:862262/1‑150 (MQ=255) gagaCCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTg > 1:1399725/1‑150 (MQ=255) cGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGGTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTCGCGGACAACGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCAc < 2:690134/150‑1 (MQ=255) aCGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGc < 2:1399725/150‑1 (MQ=255) ccGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGa > 1:122354/1‑126 (MQ=255) ccGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGa < 2:122354/126‑1 (MQ=255) ccGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATg < 1:790870/150‑1 (MQ=255) gggCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTAc < 1:944780/150‑1 (MQ=255) gggCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATCGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTAc < 1:1012667/150‑1 (MQ=255) cATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGa < 2:1346926/150‑1 (MQ=255) aGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTTGGCCCTGGGGGCCAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATGGcc > 1:1168486/1‑150 (MQ=255) ttCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGa < 2:1277649/131‑1 (MQ=255) ttCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGa > 1:1277649/1‑131 (MQ=255) ttCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATGGCCGCGTc > 1:323027/1‑150 (MQ=255) cTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTgcgccattgaggccgttcttgaagcgctcgtagcactcgatgcccttctcggccgtccactcggtctcacattcctgccagaccagcttgacgccattgatgccgccttcg < 2:280974‑M2/150‑112 (MQ=255) ggCGCCCCGGTGGCGTTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATCCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCCCCGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCt < 2:1168486/150‑1 (MQ=255) cgcTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCtgt < 2:1340952/150‑1 (MQ=255) gcTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTgcgccattgaggccgttcttgaagcgctcgtagcactcgatgcccttctcggccgtccactcggtctcacattcctgccagaccagcttgacgccattgatgccgccttcgacttcgttg < 1:279470‑M2/150‑121 (MQ=255) gcTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTgcgccattgaggccgttcttgaagcgctcgtagcac > 1:364457‑M2/1‑30 (MQ=255) gcTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTgcgccattgaggccgttcttgaagcgctcgtagcac < 2:364457‑M2/66‑37 (MQ=255) gcTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGc < 2:186735/82‑1 (MQ=255) gcTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGc > 1:186735/1‑82 (MQ=255) tCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGAt > 1:679640/1‑150 (MQ=255) ggTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGAGCCCAGATCG‑CTCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGtt > 2:1404138/1‑150 (MQ=255) ggTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCAGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCtt > 2:991212/1‑150 (MQ=255) cAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTGTGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGa < 2:1073056/133‑1 (MQ=255) cAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTGTGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGa > 1:1073056/1‑133 (MQ=255) ccAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATTGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTACAGCGAgg < 1:1034784/150‑1 (MQ=255) | ACGAAGTCGAAGGCGGCATCAATGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGG‑CCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTACAGCGAGG > NC_002947/3135578‑3135865 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |