New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3514136 = | 58 (1.100) | 6 (0.120) | 4/238 | NT | 9.7% | coding (2761/4158 nt) | PP_3108 | rhs family protein |
? | NC_002947 | 3514155 = | 55 (1.080) | coding (2780/4158 nt) | PP_3108 | rhs family protein |
GAGTACGACCCGCTCAGCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTGGTCGAGCA > NC_002947/3514007‑3514302 | tattgatgccggtgttgtgcacctgcgaaagcttgtcggccggcaaggtcgaggcaaactgccaggccttgcgccccatggcgtcataaccgaagcaactggtgagcttgccctgggtccggtacacctCGCGATGACCTGCACCGCGAg > 1:121510‑M1/130‑150 (MQ=255) gAGTACGACCCGCTCAGCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAg > 2:541672/1‑150 (MQ=255) gTACGACCCGCTCAGCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGgt < 1:541672/150‑1 (MQ=255) gACCCGCTCAGCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCCCCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCATCGACAGGGAGCGCGCTGACCTGCACCCCGAGGTGTAc > 1:1394323/1‑150 (MQ=39) aCCCGCTCAGCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTAcc > 1:990384/1‑150 (MQ=255) cccGCTCAGCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCg > 2:1120809/1‑150 (MQ=255) ccGCTCAGCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCgg > 1:342125/1‑150 (MQ=255) cGCTCAGCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGa > 1:195618/1‑150 (MQ=255) cAGCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCa < 2:195618/150‑1 (MQ=255) gCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAgg < 1:1120809/150‑1 (MQ=255) tGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGc > 2:30434/1‑150 (MQ=255) gACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGcg < 2:977543/150‑2 (MQ=255) cACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCAc > 1:1309137/1‑150 (MQ=255) aCGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACGTGCAGCTCTATGATCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCAcc < 1:27655/150‑1 (MQ=25) cGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCa < 1:803362/150‑1 (MQ=255) cGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCa < 1:30434/150‑1 (MQ=255) aCCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGc > 2:364051/1‑150 (MQ=255) cTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTc < 2:1309137/150‑1 (MQ=255) ccGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCCGCCACCTTGACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGt > 1:684212/1‑150 (MQ=255) ggATGGCCGCAGGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCGCCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTa < 2:1394323/150‑1 (MQ=255) agggCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATg < 2:1146278/148‑1 (MQ=255) aGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTCCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATgg < 2:114551/150‑1 (MQ=255) tCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGgc > 1:1134684/1‑150 (MQ=255) tCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCACGTTTGGGAGCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGgc < 2:126647/150‑1 (MQ=37) tCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCaa > 1:385109/1‑150 (MQ=255) tCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCAACAGCTGCACCTGGATGGACAGGTGATCCGAGACATGGAGCACGATAACCTGCACCGCGAGGGGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCaa > 2:519655/1‑150 (MQ=255) ccTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGc > 2:1250353/1‑150 (MQ=255) cTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGATATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGcc > 1:1246268/1‑150 (MQ=255) cTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCg < 2:1352772/95‑1 (MQ=255) cTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCg > 1:1352772/1‑95 (MQ=255) tGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGGGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCt > 1:1178038/1‑150 (MQ=255) actacGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGc > 1:370706/1‑150 (MQ=255) ctacGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCa < 1:364051/150‑1 (MQ=255) ctacGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCa < 1:222575/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGtt > 1:395842/1‑150 (MQ=255) cccatggcgtcataaccgaagcaactggtgagcttgccctgggtccggtacacctCGCGATGACCTGCACCGCGAg < 2:336553‑M1/21‑1 (MQ=255) cccatggcgtcataaccgaagcaactggngagcttgccctgggtccggtacacctCGCGATGACCTGCACCGCGAg > 1:336553‑M1/56‑76 (MQ=255) cAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGc < 1:1250353/150‑1 (MQ=255) ccatggcgtcataaccgaagcaactggtgagcttgccctgggtccggtacacctCGCGATGACCTGCACCGCGAg > 2:953742‑M1/55‑75 (MQ=255) ccatggcgtcataaccgaagcaactggtgagcttgccctgggtccggtacacctCGCGATGACCTGCACCGCGAg < 1:953742‑M1/21‑1 (MQ=255) aGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGcc < 2:314845/150‑1 (MQ=255) cGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTc < 1:109320/150‑1 (MQ=255) cACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATggg < 1:107686/122‑1 (MQ=255) cACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATggg > 2:107686/1‑122 (MQ=255) cTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTg < 2:342125/150‑1 (MQ=255) gCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGt > 1:1248967/1‑103 (MQ=255) gCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGt < 2:1248967/103‑1 (MQ=255) ccTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCt > 1:1306541/1‑150 (MQ=255) cTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCtt < 2:1306541/150‑1 (MQ=255) cTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCAACGCGACGTGTGCCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCtt > 1:885492/1‑150 (MQ=255) tGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCttt < 2:370706/150‑1 (MQ=255) tCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGt > 1:187694/1‑150 (MQ=255) aGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGTATGTGc > 2:198585/1‑150 (MQ=255) aGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGc > 1:794839/1‑150 (MQ=255) ggTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGca > 1:368491/1‑150 (MQ=255) ggTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCAAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGca > 1:875880/1‑150 (MQ=255) aGCGACATGGAGCGCTATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACAcc < 2:990384/150‑1 (MQ=255) cATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGAAGCCTGTGTTGACCGGTTCTTCCGACAAGCTTTCTCATTTGCACAACACAGGCAt > 2:727315/1‑150 (MQ=255) ctcgcggtgcaggtcatcgcgAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCNCCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATggg > 1:336553‑M2/22‑76 (MQ=255) ctcgcggtgcaggtcatcgcgAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATggg < 2:336553‑M2/55‑1 (MQ=255) ctcgcggtgcaggtcatcgcgAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATgg > 2:953742‑M2/22‑75 (MQ=255) ctcgcggtgcaggtcatcgcgAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATgg < 1:953742‑M2/54‑1 (MQ=255) ctcgcggtgcaggtcatcgcgAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATa > 1:121510‑M2/22‑150 (MQ=255) GATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTg > 1:999869‑M1/1‑83 (MQ=255) GATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTg < 2:999869‑M1/83‑1 (MQ=255) aCCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAg > 2:598169/1‑119 (MQ=255) aCCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAg < 1:598169/119‑1 (MQ=255) ccTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCt > 2:1417947/1‑150 (MQ=255) aggtcatcgcgAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCt < 2:121510‑M2/139‑1 (MQ=255) cTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTg > 2:656090/1‑150 (MQ=255) cACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTGGTc > 1:548143/1‑150 (MQ=255) cACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTGGTc < 1:519655/150‑1 (MQ=255) ccGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCATGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTGGTCGa > 1:1261672/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTGGTCGa < 2:1178038/150‑1 (MQ=255) ccGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGACTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTGGTCGa > 2:1341594/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTACTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTGGTCGa < 1:727315/150‑1 (MQ=255) cgcgAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTGGTCGAg > 2:548167‑M2/5‑150 (MQ=255) cgAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTGGTCGAGCa < 2:548143‑M2/148‑1 (MQ=255) | GAGTACGACCCGCTCAGCAACCTGACCACGCTGACCCTGCCGGATGGCCGCAAGGTCAATCACCTGTACTACGGCAGCGGCCACCTGCACCAGCTGAACCTGGATGGTCAGGTGATCAGCGACATGGAGCGCGATGACCTGCACCGCGAGGTGTACCGGACCCAGGGCAAGCTCACCAGTTGCTTCGGTTATGACGCCATGGGGCGCAAGGCCTGGCAGTTTGCCTCGACCTTGCCGGCCGACAAGCTTTCGCAGGTGCACAACACCGGCATCAATACCTCGTTGCTGGTCGAGCA > NC_002947/3514007‑3514302 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |