New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3665840 | 49 (0.930) | 5 (0.100) | 3/238 | NT | 9.3% | coding (705/957 nt) | PP_3229 | aliphatic sulfonate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 3665854 | 50 (0.980) | coding (719/957 nt) | PP_3229 | aliphatic sulfonate‑binding protein |
GGCCAGCGCCCAGCGTCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTGGACAACCTGGCCGAGCAGCA > NC_002947/3665705‑3666001 | ggCCAGCGCCCAGCGTCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCgg < 2:953259/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCCAGCGTCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGt > 2:523494‑M2/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCCCAGCGTCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGt > 1:192877‑M2/1‑149 (MQ=255) gcgcCCAGCGTCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCt > 1:480953/1‑150 (MQ=255) cccAGCGTCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACCGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCTGTGCCTGGa < 1:859244/150‑1 (MQ=255) ccAGCGTCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGAc > 1:1232782/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAg < 2:757249/150‑1 (MQ=255) gTCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAgg < 1:91424/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGc < 1:1368996/150‑1 (MQ=255) cGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGa < 1:258265/150‑1 (MQ=255) gCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGc > 2:845716/1‑140 (MQ=255) gCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGc < 1:845716/140‑1 (MQ=255) aCGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGc > 2:719489/1‑150 (MQ=255) gATCCTGGTCGACGGCACCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGATCAAGGCCAACCCCGAGGCCGc > 2:729862/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGc < 2:1004177/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGcc > 1:79267/1‑150 (MQ=255) tGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGccc > 2:1365003/1‑150 (MQ=255) gggTCGACGGGAGCGAACTGGCCAGTGACCAGCGCTATTATCTCGCCGGCAGCGATTACGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGTATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGGCGCTGccc < 2:208431/149‑1 (MQ=255) tCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCa > 2:1198968/1‑150 (MQ=255) aaCTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGc > 2:908931/1‑150 (MQ=255) cAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTgggg > 1:487703/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCACGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCt > 1:766622/1‑150 (MQ=255) cAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTg < 1:908931/150‑1 (MQ=255) aGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTgg > 2:942444/1‑150 (MQ=255) gcgcTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGa < 1:408417/150‑1 (MQ=255) gcgcTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGa > 2:696165/1‑150 (MQ=255) gcTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTgg < 1:785558/127‑1 (MQ=255) gcTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTgg > 2:785558/1‑127 (MQ=255) tATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAgc < 1:696165/150‑1 (MQ=255) tATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAgc < 2:480953/150‑1 (MQ=255) aCCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCa < 1:1365003/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCAGTGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAg > 2:524006/1‑86 (MQ=255) tCGCCGGCAGTGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAg < 1:524006/86‑1 (MQ=255) cAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCg < 2:1232782/150‑1 (MQ=255) gcATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGcc < 1:914968/136‑1 (MQ=255) gcATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGcc > 2:914968/1‑136 (MQ=255) cATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGCCCACTGCTCCGACTGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGt < 1:1315224/150‑1 (MQ=255) aTCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGtt > 1:406738/1‑150 (MQ=255) ccTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCACCCCCTGGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTAc < 2:44499/150‑1 (MQ=255) tGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTgc < 2:338275/122‑1 (MQ=255) tGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTgc > 1:338275/1‑122 (MQ=255) tGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGa < 1:719489/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGAt < 2:333899/144‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGAt > 1:333899/1‑144 (MQ=255) gtgtACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGa < 1:835470/50‑1 (MQ=255) gtgtACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGa > 2:835470/1‑50 (MQ=255) tgtACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGtgccaggtacacctgctgcaatacctcaggatgcgccttggcataatcgctgccggcgaggtaatagcgct < 2:1180038‑M2/96‑72 (MQ=255) tgtACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGtgccaggtacacctgctgcaatacctcaggatgcgccttggcataatcgctgccggcgaggtaatagcgct > 1:1180038‑M2/1‑25 (MQ=255) gtACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCTAACCCCGAGCGCGCTGCCCGCATCCTTGTCCCGCTTTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGTAGGCAAAGGTCCCGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCt > 1:1078132/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTgg > 1:1369081/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTgg < 1:942444/150‑1 (MQ=255) ccTGGCATTGCGTGAAGCCGGtgcctggtacacctgctgcaatacctcaggatgcgccttggcataatcgctgccggcgaggtaatagcgctggtaactggccagttcgctgccgtcgaccaggatccgtgcgttctgctgacgctgggc < 1:1172828‑M2/150‑130 (MQ=255) ccTGGCATTGCGTGAAGCCGGtgccaggtacacctgctgcaatacctcaggatgcgccttggcataatcgctgccggcgaggtaatagcgct > 1:1367406‑M2/1‑21 (MQ=255) ccTGGCATTGCGTGAAGCCGGtgccaggtacacctgctgcaatacctcaggatgcgccttggcataatcgctgccggcgaggtaatagcgct < 2:1367406‑M2/92‑72 (MQ=255) cTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTGGAc > 1:928336/1‑150 (MQ=255) tGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTGGACa > 2:450240/1‑150 (MQ=255) tGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTGGACa > 1:1346310/1‑150 (MQ=255) gCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTGGACAACCTGGc < 2:406738/150‑1 (MQ=255) gTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTgg < 1:964512/65‑1 (MQ=255) gTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTgg > 2:964512/1‑65 (MQ=255) aGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTGGACAACCTGGCCGagca < 2:1346310/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCTCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTGGACAACCTGGCCGagcagc > 1:101995/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTGGACAACCTGGCCGAgcagca > 2:721324/1‑150 (MQ=255) | GGCCAGCGCCCAGCGTCAGCAGAACGCACGGATCCTGGTCGACGGCAGCGAACTGGCCAGTTACCAGCGCTATTACCTCGCCGGCAGCGATTATGCCAAGGCGCATCCTGAGGTATTGCAGCAGGTGTACCTGGCATTGCGTGAAGCCGGTGCCTGGACCAAGGCCAACCCCGAGGCCGCTGCCCGCATCCTTGGCCCGCTGTGGGGTAATCTGGACAGCGCCACGGTGCAGCAGGCCAACGCCCGGCGCAGTTACGATGTGCAGCCGGTGAAGCTGGACAACCTGGCCGAGCAGCA > NC_002947/3665705‑3666001 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |