New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4246911 = | 74 (1.410) | 4 (0.080) | 4/238 | NT | 5.3% | coding (1050/1608 nt) | aruI | 2‑ketoarginine decarboxylase AruI |
? | NC_002947 | 4246945 = | 72 (1.420) | coding (1016/1608 nt) | aruI | 2‑ketoarginine decarboxylase AruI |
TAGGCCAGCTGGGTCATGTCGCTGCTGATGAAGGCATCGTCAGGCAGTACGGCGGCGATACGGTCCAGAATGGCCTGGTGCGTGGCCTGCAACGGGGCATG‑CCCATTGCGGATGGCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGATGTCGACGCGCAGCAGCTCGCCGCGGATCGGC > NC_002947/4246798‑4247094 | cccgcgcaagttcaacgatttctacccctgtgccattgccctgcagggtgatgcccggcaaaccttggacggtttgctcgaacacctgcccgcacttcagcgtgacccggcccaGGCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTg > 1:1082151‑M1/115‑150 (MQ=255) ccgcgcaagttcaacgatttctacccctgtgccattgccctgcagggtgatgcccggcaaaccttggacggtttgctcgaacacctgcccgcacttcagcgtgacccggcccaGGCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTgg > 2:613303‑M1/114‑150 (MQ=255) aGGCCAGCTGGGTCATGTCGCTGCTGATGAAGGCATCGTCAGGCAGTACGGCGGCGATACGGTCCAGAATGGCCTGGTGCGTGGCCTGCAACGGGGCATG‑CCCATTGCGGATGGCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTggg > 2:25642/1‑150 (MQ=255) aGGCCAGCTGGGTCATGTCGCTGCTGATGAAGGCATCGTCAGGCAGTACGGCGGCGATACGGTCCAGAATGGCCTGGTGCGTGGCCTGCAACGGGGCATG‑CCCATTGCGGAAGGCCTGGGGAAG‑GGTTGCCACGGCCGCGCT‑TGCGTggg > 1:668962/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGGTCATGTCGCTGCTGATGAAGGCATCGTCAGGCAGTACGGCGGCGATACGGTCCAGAATGGCCTGGTGCGTGGCCTGCAACGGGGCATG‑CCCATTGCGGATGGCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCgg < 2:934488/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGGTCATGTCGCTGCTGATGAAGGCATCGTCAGGCAGTACGGCGGCGATACGGTCCAGAATGGCCTGGTGCGTGGCCTGCAACGGGGCATG‑CCCATTGCGGATGGCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCgg < 1:751561/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGTCATGTCGCTGCTGATGAAGGCATCGTCAGGCAGTACGGCGGCGATACGGTCCAGAATGGCCTGGTGCGTGGCCTGCAACGGGGCATG‑CCCATTGCGGATGGCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCggg > 2:430798/1‑150 (MQ=255) caagttcaacgatttctacccctgtgccattgccctgcagggtgatgcccggcaaaccttggacggtttgctcgaacacctgcccgcacttcagcgtgacccggcccaggcctggcgcagggtggccaccgccgcgctggccTGGGCCgg < 2:319871‑M2/8‑1 (MQ=255) 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ccaggccagcgcggcggtggccaccctgcgccaggccTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCgg > 2:613303‑M2/38‑150 (MQ=255) caggccagcgcggcggtggccaccctgcgccaggccTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCggg > 1:1082151‑M2/37‑150 (MQ=255) GGCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTc > 2:395769‑M1/1‑150 (MQ=255) GCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAgg < 1:147129‑M1/121‑1 (MQ=255) GCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAgg > 2:147129‑M1/1‑121 (MQ=255) CTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGAGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGAt > 1:478991‑M1/1‑150 (MQ=255) ggCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGATGt < 1:430798/150‑1 (MQ=255) cagcgcggcggtggccaccctgcgccaggccTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAACCCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGAt < 1:319871‑M2/119‑1 (MQ=255) gTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGCGTCGACATCGACccgc < 2:565412/150‑1 (MQ=255) cACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTATAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGATGTCGACGCgcagca < 1:1360955/149‑1 (MQ=255) cACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGATGTCGACGCgcagca > 2:1360955/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGATGTCGACGCgcagca < 1:605650/148‑1 (MQ=255) aCCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGATGTCGACGCgcagca > 2:605650/1‑148 (MQ=255) t‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGt > 2:1098786/1‑120 (MQ=255) t‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGt < 1:1098786/120‑1 (MQ=255) gccTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAAt < 1:505240‑M2/80‑1 (MQ=255) gccTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAAt > 2:505240‑M2/4‑83 (MQ=255) gccTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGATGt > 2:98911‑M2/4‑124 (MQ=255) gccTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGATGt < 1:98911‑M2/121‑1 (MQ=255) cTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCggg > 2:1019713‑M2/2‑115 (MQ=255) cTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCggg < 1:1019713‑M2/114‑1 (MQ=255) tGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGATGTCGACGCGCAGCAGCTCGCCGCGGATCGGc > 2:362724/1‑150 (MQ=255) | TAGGCCAGCTGGGTCATGTCGCTGCTGATGAAGGCATCGTCAGGCAGTACGGCGGCGATACGGTCCAGAATGGCCTGGTGCGTGGCCTGCAACGGGGCATG‑CCCATTGCGGATGGCCTGGCGCAG‑GGTGGCCACCGCCGCGCT‑GGCCTGGGCCGGGTCACGCTGAAGTGCGGGCAGGTGTTCGAGCAAACCGTCCAAGGTTTGCCGGGCATCACCCTGCAGGGCAATGGCACAGGGGTAGAAATCGTTGAACTTGCGCGGGTCGATGTCGACGCGCAGCAGCTCGCCGCGGATCGGC > NC_002947/4246798‑4247094 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |