New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4668856 = | 53 (1.010) | 5 (0.100) | 5/240 | NT | 9.2% | coding (682/1533 nt) | nuoM | NADH‑quinone oxidoreductase subunit M |
? | NC_002947 | 4668888 = | 47 (0.920) | coding (714/1533 nt) | nuoM | NADH‑quinone oxidoreductase subunit M |
GCGATCCTGGGCCTGGTGCTGGTCAACTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGT > NC_002947/4668742‑4669015 | gCGATCCTGGGCCTGGTGCTGGTCAACTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAgtg < 2:490268/150‑1 (MQ=255) gcaggccgtaggccgcggtcttcagcaagatacccgccaggtccaccgagcctgcggtcggtgcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAgt < 2:193004‑M1/35‑1 (MQ=255) gcaggccgtaggccgcggtcttcagcaagatacccgccaggtccaccgagcctgcggtcggtgcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAgt > 1:193004‑M1/108‑142 (MQ=255) gTGCTGGTCAACTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTcc > 2:652236/1‑150 (MQ=255) gTCAACTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTg > 1:1030804/1‑150 (MQ=255) tCAACTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGc > 1:582796/1‑150 (MQ=255) tCAACTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGc > 2:1282065/1‑150 (MQ=255) tCAACTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGc > 1:270901/1‑150 (MQ=255) aaCTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAgtg > 1:172701/1‑126 (MQ=255) aaCTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAgtg < 2:172701/126‑1 (MQ=255) cTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGa < 2:190141/150‑1 (MQ=255) tACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGCGGCAGATCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGAAGTTCCACTCCTGGCTGCCTGAc > 1:448915/1‑150 (MQ=255) acacCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCGGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTc > 1:1455/1‑150 (MQ=255) caccacTGGCGTGGTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGTTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTTGCTGCCTGACGCTCa < 2:148810/150‑1 (MQ=255) accacTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTTCCTGACGCTc > 1:1360404/1‑148 (MQ=255) accacTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTc < 2:1360404/148‑1 (MQ=255) acTGGCGTGCTCACCTTCAACTACCGCGACCTGCTCAAGGCCGCGTTGCGGGCTGGT‑ATCGAGCACCTGCTGTTTTGCGGCTTCTGCATCGCTGTCGCGGTGAATCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGcc < 2:871253/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCa < 1:1411214/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAAGCCGCGTT‑CAGTCCGATCAGCGAGTACTTGCTGATGCTGGGCGTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAgg < 1:673726/150‑1 (MQ=255) tCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCaccga < 1:652236/150‑1 (MQ=255) aCCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCt < 2:438307/118‑1 (MQ=255) aCCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCt > 1:438307/1‑118 (MQ=255) cTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCGCCGACCGc > 1:680271/1‑150 (MQ=255) cTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGc > 2:838252/1‑150 (MQ=255) cAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCt < 2:268246/107‑1 (MQ=255) cAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCt > 1:268246/1‑107 (MQ=255) aCCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGcc < 1:302759/91‑1 (MQ=255) aCCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGcc > 2:302759/1‑91 (MQ=255) aCCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTc < 1:399810/95‑1 (MQ=255) aCCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTc > 2:399810/1‑95 (MQ=255) ccTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCt < 2:864086/150‑1 (MQ=255) gCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGATGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTgga > 1:1208271/1‑149 (MQ=255) aatgCCGATTTGGCTGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCGTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGt > 2:1124621/4‑150 (MQ=255) aaGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGt < 1:1282065/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCCCGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGGCCTGGCGGGAAt > 2:644501/1‑150 (MQ=255) gCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGACTGAGGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATc > 1:1379961/1‑150 (MQ=255) gccggccgGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGaa < 1:838252/150‑1 (MQ=255) ccggccggT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATTTTGCTGAAg < 2:448915/150‑1 (MQ=255) cggccggT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCAAGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGa > 2:139400/1‑150 (MQ=255) cggT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACcgc < 2:1338287/150‑1 (MQ=255) tCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCt > 2:329014/1‑150 (MQ=255) gAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTAc > 2:908711/1‑150 (MQ=255) aGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACg > 2:623787/1‑150 (MQ=255) tACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGc < 2:1311949/150‑1 (MQ=255) tGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGGCCGCGGCCTACGGCctgc > 1:1209510/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGAGGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCctgct > 1:217561/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCtt < 2:1455/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCACAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCtt < 2:829295/150‑1 (MQ=255) actggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagccAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCctgc > 1:193004‑M2/36‑142 (MQ=255) actggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagccAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCctgc < 2:193004‑M2/107‑1 (MQ=255) gcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagccAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCt > 2:1415912‑M2/32‑100 (MQ=255) gcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagccAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCt < 1:1415912‑M2/69‑1 (MQ=255) CTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGctct < 2:1121107‑M1/150‑1 (MQ=255) ttcaccgcgaaggcgatgaagctgccAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGAGCTTCGCTCTGCCg > 1:652065‑M2/27‑150 (MQ=255) ttcATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCg < 1:1121107/150‑1 (MQ=255) tcATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGATGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCAGCGACCGCAGCCCCGGTGGACCCGGCGAGTCTCTTGCTGAAGCCCCCGGCTTACCGACCGCTGCGCTTCACTCAGCCgg > 2:619553/1‑149 (MQ=255) aTCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTg > 2:238744/1‑150 (MQ=255) tCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGt > 1:58091/1‑150 (MQ=255) gCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGccc < 2:617339/47‑1 (MQ=255) gCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGccc > 1:617339/1‑47 (MQ=255) tGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGc < 2:816749/107‑1 (MQ=255) tGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGc > 1:816749/1‑107 (MQ=255) | GCGATCCTGGGCCTGGTGCTGGTCAACTACAACACCACTGGCGTGCTCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGT‑ATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGT > NC_002947/4668742‑4669015 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |