New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5130870 | 48 (0.910) | 3 (0.060) | 3/236 | NT | 5.7% | coding (582/2148 nt) | recQ | ATP‑dependent DNA 3'‑5' helicase |
? | NC_002947 | = 5130890 | 53 (1.050) | coding (562/2148 nt) | recQ | ATP‑dependent DNA 3'‑5' helicase |
CGACAGGCAGTAGACGATGCCAGCGTTGCCACGACGTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAATCGTGCCCCCATTGCGAAACGCAGTGGGC > NC_002947/5130741‑5131034 | cgACAGGCAGTAGACGATGCCAGCGTTGCCACGACGTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTtgcaggtgcag < 1:227136/150‑1 (MQ=255) gACAGGCAGTAGACGATGCCAGCGTTGCCACGACGTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGg > 2:1117813‑M2/1‑149 (MQ=255) gACGATGCCAGCGTTGCCACGACGTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGAt < 2:1335164/150‑1 (MQ=255) cAGCGTTGCCACGACGTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTcgc > 1:271237/1‑150 (MQ=255) gCGTTGCCACGACGTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCgg < 2:682920/150‑1 (MQ=255) gCGTTGCCACGACGTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCgg > 2:111709/1‑150 (MQ=255) tGCCACGACGTTCGCCGAGGAAGGCCATAAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTc < 1:1047463/150‑1 (MQ=255) gCCACGACGTTTGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCg < 1:574781/150‑1 (MQ=255) gacgTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTc > 1:1167202/1‑144 (MQ=255) gacgTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTc < 2:1167202/144‑1 (MQ=255) acgTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGC‑CTGCACCTGCAAGGCGCCGagcgcttcctgtcgagtttcgaccggcccaacat > 2:164264‑M2/1‑116 (MQ=255) gTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCgg > 1:781546/1‑150 (MQ=255) cGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCg < 2:386172/150‑1 (MQ=255) ccGAGGAAGGCCATCAACTGCTGGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGCCAGGAAGCGATCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTa < 2:72960/150‑1 (MQ=255) cGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGAGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAg < 2:497822/150‑1 (MQ=255) aGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTaa < 1:111709/150‑1 (MQ=255) cAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAAt < 1:1397247/150‑1 (MQ=255) aCTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAATCGCGACAGGTAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATgc > 1:1243588/1‑150 (MQ=255) cTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATgcg > 1:815264/1‑150 (MQ=255) tGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATgcgc < 1:201197/150‑1 (MQ=255) gTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCg < 2:898839/150‑1 (MQ=255) cctcctTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCaa > 1:484324/1‑132 (MQ=255) cctcctTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCaa < 2:484324/132‑1 (MQ=255) cctcctTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGaa > 1:695925/1‑150 (MQ=255) tcctTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAAc > 2:321649/1‑150 (MQ=255) gggCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTc < 1:1171345/150‑1 (MQ=255) gATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAg > 2:821281/1‑150 (MQ=255) gTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGcc > 2:407934/1‑150 (MQ=255) ggTTGGGCCGGTCGAAACTAGACCGGCAGAGCCTGGCGCTTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCa < 2:1302148/149‑1 (MQ=255) gTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAg < 1:42431/150‑1 (MQ=255) ttGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAgg > 1:708226/1‑150 (MQ=255) ttGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAgg < 2:695925/150‑1 (MQ=255) gCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGaaa < 2:223196/118‑1 (MQ=255) gCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGaaa > 1:223196/1‑118 (MQ=255) gAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCCGGTACCCTggggg < 2:708226/150‑3 (MQ=255) aaCTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGc < 1:1392803/104‑1 (MQ=255) aaCTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGc > 2:1392803/1‑104 (MQ=255) tCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCgg > 2:24779/1‑56 (MQ=255) tCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCgg < 1:24779/56‑1 (MQ=255) tCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAAt > 2:1334760/1‑150 (MQ=255) tCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAAt > 2:1166253/1‑150 (MQ=255) gAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTAct < 1:1113123/131‑1 (MQ=255) gAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTAct > 2:1113123/1‑131 (MQ=255) gAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAATCGTGccc < 2:1243588/150‑1 (MQ=255) cgcTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATTGCGGCCGTAGCGGTAAGAACATCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAGATCGTGCCCCCAt > 1:1033367/1‑150 (MQ=255) cgcTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAATCGTGCCCCCAt > 2:189082/1‑150 (MQ=255) gcTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGgcgcttcctgtcgagtttcgaccggcccaacatcttttaccgcatcgtgcccaagga > 1:899696‑M2/1‑22 (MQ=255) gcTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGgcgcttcctgtcgagtttcgaccggcccaacatcttttaccgcatcgtgcccaagga < 2:899696‑M2/79‑58 (MQ=255) gcTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAAc > 1:729783/1‑95 (MQ=255) gcTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAAc < 2:729783/95‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAg > 2:1000240/1‑68 (MQ=255) tCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAg < 1:1000240/68‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAATCGTGCCCCCATTGc > 2:361347/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCgg > 2:612675/1‑92 (MQ=255) ttGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCgg < 1:612675/92‑1 (MQ=255) ccagttcaggCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGTGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAATCGTGCCCCCATTGCGAAACGCAGTg > 2:1422404/7‑150 (MQ=255) caggtgcaggCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAATCGTGCCCCCATTGCGAAACGCAGTg < 2:271237/150‑1 (MQ=255) gtgcaggCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAATCGTGCCCCCATTGCGAAACGCAGTGGGc > 2:33371/1‑150 (MQ=255) gtgcaggCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCCGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAATCGTGCCCCCATTGCGAAACGCAGTGGGc > 1:456042/1‑150 (MQ=255) | CGACAGGCAGTAGACGATGCCAGCGTTGCCACGACGTTCGCCGAGGAAGGCCATCAACTGCTTGCGCGGTGCCTCCTTGGGCACGATGCGGTAAAAGATGTTGGGCCGGTCGAAACTCGACAGGAAGCGCTCGGCGCCTTGCAGGTGCAGGCGCTGAACGATCTCCTCGCGGGTTCGCATGTCGGCCGTAGCGGTAAGCGCAATGCGCGGCACATGCGGAAACAGTTCGGCCAGCTGGCCCAGCTGCAGGTACTCTGGGCGGAAATCGTGCCCCCATTGCGAAACGCAGTGGGC > NC_002947/5130741‑5131034 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |