New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5510261 | 46 (0.880) | 5 (0.100) | 5/238 | NT | 10.6% | coding (412/1488 nt) | urtB | urea ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 5510304 | 40 (0.790) | coding (455/1488 nt) | urtB | urea ABC transporter permease |
GAAAAGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGCGAACTGCTCGGCC > NC_002947/5510155‑5510453 | gAAAAGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCct < 2:269280/150‑1 (MQ=255) aGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTgctg > 1:1369761‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgcACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCGTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTgg < 2:533246/150‑1 (MQ=255) gcgcACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTgg < 1:39241/150‑1 (MQ=255) gcgcACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTgg < 1:364504/150‑1 (MQ=255) caACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGaa > 2:326503/1‑150 (MQ=255) ccGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCg > 2:1412101/1‑150 (MQ=255) cgcgCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCgg < 1:436686/150‑1 (MQ=255) gcgcAAATGGCCTTCTTCGACGGGCGCTCCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCAGTAGAGGCCGCCGCCGGTCTCGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTTCGGTACGCCCGGGCGCCGTGGGCCTGCTGGGTGAAACCGGc < 2:41555/150‑1 (MQ=255) gcgcAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGc > 1:1177885/1‑150 (MQ=255) aaaTGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGAcc > 2:1346472/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTg < 1:1412101/150‑1 (MQ=255) tCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGccc < 2:1177885/150‑1 (MQ=255) tCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGccc < 1:70719/150‑1 (MQ=255) tCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGccc < 2:650496/150‑1 (MQ=255) tCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCa > 1:1282012/1‑150 (MQ=255) tCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGACTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGcc > 2:111370/1‑149 (MQ=255) gctcgcTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGc > 2:860910/4‑150 (MQ=255) gcgcTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGACAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGccc > 2:832485/1‑149 (MQ=255) cgAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCctgct < 1:1173774/150‑1 (MQ=255) ggACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGcc > 2:407325/1‑150 (MQ=255) gccgccGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGAt < 2:839962/150‑1 (MQ=255) cgTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGa > 1:1323293/1‑150 (MQ=255) gTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGaa < 1:1301386/150‑1 (MQ=255) tACAGTCCTCCCTCGTTCTGGCCCTGACCACACTGCAGCTGGGCGCCAGCGTTATTTCTGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAAc < 2:691128/150‑1 (MQ=255) gccgccCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGaa < 1:1332291/120‑1 (MQ=255) gccgccCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGaa > 2:1332291/1‑120 (MQ=255) cccTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCCACGTGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCgg < 1:1084636/150‑1 (MQ=255) cccTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCgg < 2:847346/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCGGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCggg > 1:1154718/1‑150 (MQ=255) cTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGc > 2:180510/1‑150 (MQ=255) tCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAg > 2:1143872/1‑131 (MQ=255) tCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAg < 1:1143872/131‑1 (MQ=255) ccctggccAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAg < 2:1282012/150‑1 (MQ=255) cctggccAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAAGTAGACCCGGGCGTGCGCACAgc > 2:331207/1‑150 (MQ=255) ctggccAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTgctgcaggttggccagggccagaccgagggcggcctgtacggcggcgtccggctcggcggcgaagcgccggtcgaggaag > 2:1420044‑M2/1‑59 (MQ=255) ctggccAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTgctgcaggttggccagggccagaccgagggcggcctgtacggcggcgtccggctcggcggcgaagcgccggtcgaggaag < 1:1420044‑M2/139‑81 (MQ=255) cAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGTCCGCCGTGCTCCGGCGGGGTGAAACGGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGGAGCCCTGCTGCGGCCCGATGCAGAACTATACCCGAGCGTGCGCACAGCCGCCGa > 2:696005/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAAc < 2:1196137/150‑1 (MQ=255) gCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCCagctgcaggttggccagggccagaccgagggcggcctgtacggcggcgtccggctcggcggcgaagcgccggtcga < 2:1262229‑M2/124‑77 (MQ=255) gCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCCagctgcaggttggccagggccagaccgagggcggcctgtacggcggcgtccggctcggcggcgaagcgccggtcga > 1:1262229‑M2/1‑48 (MQ=255) cAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGc < 1:860910/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGcc > 1:867519/1‑150 (MQ=255) tGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTgctgcaggttggccagggccagaccgagggcggcctgtacggcggcgtccggctcggcggcgaagcgccggtcgaggaaggccatttgcgcgggttgtgcgcttttc < 2:1276410‑M2/150‑108 (MQ=255) ggCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGcc < 2:958442/150‑1 (MQ=255) cgcCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCa < 2:1154718/150‑1 (MQ=255) gTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAActg < 1:180510/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGCCCAGGACCTGCTCGGTGAAACCGGCGCCACGCTGGCCCGCACCCGCCTCGATGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACtgctgc > 2:728879/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGTGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACtgctgc > 2:715007/1‑150 (MQ=255) gccgTGCCCCTTCTGGGTTAACCCGGAGACCAGCTGGCCCGCCCACGCCTAGACGCTCGGCCACAGCACCATGCAGCACAAGACCCGGGCCTGCGCACAGCCGCCGAACCGAGCCGGGACCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGCGaa < 2:204758/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGCGAACTGCTCgg > 2:425819/1‑150 (MQ=255) ctgctgGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGCGAACTGCTCGGc > 1:1017796/1‑150 (MQ=255) tgctgGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCGGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGCGAACTGCTCGGcc > 2:125206/1‑150 (MQ=255) | GAAAAGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGCGAACTGCTCGGCC > NC_002947/5510155‑5510453 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |