New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5647443 | 53 (1.010) | 5 (0.100) | 4/228 | NT | 7.6% | coding (196/738 nt) | PP_4955 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5647478 | 72 (1.480) | coding (161/738 nt) | PP_4955 | hypothetical protein |
TGGAGAATTGCCCGATATTGGCGCGCGAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGTTGCCAGCAATCCCAGAAC > NC_002947/5647341‑5647620 | tGGAGAATTGCCCGATATTGGCGCGCGAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTaa < 1:308369/150‑1 (MQ=255) ggAGAATTGCCCGATATTGGCGCGCGAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAAc < 1:510860/150‑1 (MQ=255) aTTGCCCGATATTGGCGCGCGAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGc < 1:1144812/150‑1 (MQ=255) tGCCCGATATTGGCGCGCGAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTg < 2:95363/150‑1 (MQ=255) cccGATATTGGCGCGCGAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCCTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGGTGCTGGt > 1:105363/1‑150 (MQ=255) ccGATATTGGCGCGCGAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTc > 1:350875/1‑150 (MQ=255) tatTGGCGCGCGAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCaa < 2:721542/150‑1 (MQ=255) gcgcccGAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCACCGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCa < 1:1273498/150‑1 (MQ=255) gcgcgAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCCTTTAATGGCAGCTGCCGGATCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCAcc > 1:526038/1‑150 (MQ=255) gTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTaa > 2:643725/1‑122 (MQ=255) gTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTaa < 1:643725/122‑1 (MQ=255) gTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGAAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCAt > 1:969873/1‑150 (MQ=255) tACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATCACCCCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTg < 1:323910/150‑1 (MQ=255) cAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTg > 1:961528/1‑147 (MQ=255) cAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTg < 2:961528/147‑1 (MQ=255) ggCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATc > 2:1010002/1‑150 (MQ=255) gCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCa < 1:8852/147‑1 (MQ=255) gCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCa > 2:8852/1‑147 (MQ=255) aTTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTgg < 2:1235211/116‑1 (MQ=255) aTTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTgg > 1:1235211/1‑116 (MQ=255) ttGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAgt > 1:139678‑M2/1‑94 (MQ=255) ttGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAgt < 2:139678‑M2/96‑3 (MQ=255) tCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACg > 2:896793/1‑150 (MQ=255) tCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCACCTGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACg < 2:969873/150‑1 (MQ=255) gCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTg < 1:79635/150‑1 (MQ=255) gCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTg < 2:601561/150‑1 (MQ=255) gCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTg > 1:601561/1‑150 (MQ=255) aCGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGc < 2:1321098/150‑1 (MQ=255) cTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCGCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGcca > 2:820946/1‑150 (MQ=255) aCCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAg > 2:358634/1‑150 (MQ=255) cTACCCCCAGCAGCGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGc < 2:897354/150‑1 (MQ=255) cTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCg < 1:1381408/105‑1 (MQ=255) cTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCg > 2:1381408/1‑105 (MQ=255) cTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAg > 1:836815/1‑148 (MQ=255) cTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAg < 2:836815/148‑1 (MQ=255) cccccAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGt > 1:1254092/1‑118 (MQ=255) cccccAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGt < 2:1254092/118‑1 (MQ=255) ccccAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAg > 1:1183471/1‑150 (MQ=255) cccAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGACCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGc > 2:892927/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCt > 1:1314159/1‑150 (MQ=255) aGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCt > 1:283156/1‑103 (MQ=255) aGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCt < 2:283156/103‑1 (MQ=255) cAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGc < 1:181204/150‑1 (MQ=255) acgcGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAgtgccgtgggcgcgtgcgttgctgggggtaggtgaagggcgctacgacgtgctgatcaatgcctggtacaacgactcgcgcgccaatatcgggcaattct < 1:199622‑M2/150‑101 (MQ=255) acgcGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGAcc > 1:408476/1‑150 (MQ=255) 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ggCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGAGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGgt < 2:105363/150‑1 (MQ=255) aCCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGtt < 2:593040/150‑1 (MQ=255) aCCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGtt > 1:1017638/1‑150 (MQ=255) ctctTCATAGCAGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGc < 2:526038/150‑1 (MQ=255) ctTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAg > 2:730567/1‑121 (MQ=255) ctTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAg < 1:730567/121‑1 (MQ=255) ctTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCa < 1:1059627/150‑1 (MQ=255) aTAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCAt > 2:229944/1‑150 (MQ=255) tAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCgg > 1:376402/1‑82 (MQ=255) tAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCgg < 2:376402/82‑1 (MQ=255) tAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATc > 2:309454/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTg > 2:1264330/1‑90 (MQ=255) aGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTg < 1:1264330/90‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGtt < 2:350875/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGtt < 1:136129/150‑1 (MQ=255) tGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGTTGCCa < 1:245403/150‑1 (MQ=255) ggCGTAGCCGGCACGCGCCAacgacctgggcgcgtgccttgccgagagtagttatagggcgctacgacgtgctgatcaatccctggtacaacgactcgcgcgccaatatcgggcaattctccagcgcctacctgcgtaatcgtattcgcc > 2:665493‑M2/1‑20 (MQ=255) ggCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGTTGCCAGCAATCCCAg > 1:1208963/1‑150 (MQ=255) gCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGgt < 2:149528/120‑1 (MQ=255) gCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGgt > 1:149528/1‑120 (MQ=255) cACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGTTGCCAGCAATCCCAGaa < 2:408476/150‑1 (MQ=255) cACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGTTGCCAGCAATCCCAGaa < 2:1183471/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCAGTGCCGTGGTAACTATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCAGCGTTGCCAGCAATCCCAGAac > 2:448039/1‑150 (MQ=255) aCGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCa > 1:1271634/1‑75 (MQ=255) aCGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCa < 2:1271634/75‑1 (MQ=255) aCGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGTTGCCa < 1:368324/137‑1 (MQ=255) aCGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGTTGCCa > 2:368324/1‑137 (MQ=255) aCGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGTTGCCAGCAATCCCAGAac > 2:411834/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCgg > 2:1065570/1‑60 (MQ=255) gcgcCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCgg < 1:1065570/60‑1 (MQ=255) gcgcCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGgt > 1:626547/1‑116 (MQ=255) gcgcCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGgt < 2:626547/116‑1 (MQ=255) cAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTg < 1:357701/94‑1 (MQ=255) cAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTg > 2:357701/1‑94 (MQ=255) | TGGAGAATTGCCCGATATTGGCGCGCGAGTCGTTGTACCAGGCATTGATCAGCACGTCGTAGCGCCCTTCACCTACCCCCAGCAACGCACGCGCCCACGGCACCTCTTCATAGCCGCTGGCGTAGCCGGCACGCGCCAGTGCCGTGGTAACGATGCTGGTCGCAAGGCCACCGCCCGGCATCTTGGCATCGGTGAACGGTGGCCAGCTATCGGCCACCAGGCGTAGCTTGGCGTGACCCGGGGCAGGTGTTGCCAGCATCGTTGCCAGCAATCCCAGAAC > NC_002947/5647341‑5647620 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |