New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5775531 = | 49 (0.930) | 4 (0.080) | 4/236 | NT | 8.2% | coding (1342/1473 nt) | betB | NAD‑dependent betaine aldehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5775547 = | 42 (0.830) | coding (1358/1473 nt) | betB | NAD‑dependent betaine aldehyde dehydrogenase |
TGCCAACGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTGGGCGGCTACAACTCGGTTTTCTGAACCCTGTCTAGCCCCGCCCGTGCCAC > NC_002947/5775410‑5775688 | tGCCAACGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACaa < 1:1402192/150‑1 (MQ=255) tGCCAACGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACaa < 1:206226/150‑1 (MQ=255) tGCCAACGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACaa < 2:1061885/150‑1 (MQ=255) tGCCAACGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATAATCCACATGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACaa < 2:409207/150‑1 (MQ=255) cAACGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAg > 2:350309/1‑137 (MQ=255) cAACGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAg < 1:350309/137‑1 (MQ=255) aaCGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAg > 2:721172/1‑150 (MQ=255) aaCGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAg > 1:1354145/1‑150 (MQ=255) aCGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGt < 2:1354145/150‑1 (MQ=255) gaaaaccgagttgtagccgcccagctcgacctggaccgacttgatgcgagtgtattgagccagcgagctgacgccgttttcacggccgacgcccgactgcttgtagccacctaccggccgaaatgccggTAGGTGGCTACAAGCAGTc > 1:1341024‑M2/130‑148 (MQ=255) gaaaaccgagttgtagccgcccagctcgacctggaccgacttgatgcgagtgtattgagccagcgagctgacgccgttttcacggccgacgcccgactgcttgtagccacctaccggccgaaatgccggTAGGTGGCTACAAGCAGTc < 2:1341024‑M2/19‑1 (MQ=255) aCTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTATGAGCAGTCGGGCGTCg < 2:1059545/150‑1 (MQ=255) aCTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCAGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCg > 2:637228/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGt < 1:721172/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTTGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGa > 2:1276301/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGaaaa < 1:1124805/150‑1 (MQ=255) ccgccgGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACg > 2:901503/1‑150 (MQ=255) ccgccgGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACg > 2:585526/1‑150 (MQ=255) gCGTCTGCACCAACGACATCACCCTCGCCTATCGCATCACCCACACGCTCGAAATCGGTACCCCGTGTATCACCCCCTGGGGTCAATCGCCGGCCGAAATGTCAGTAGCGGACCACAAGCAGTCGCCCGGCGGCCGTGAAAACAGCGtaa < 2:592537/150‑3 (MQ=255) cACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCt < 2:816777/150‑1 (MQ=255) ccAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCATCAGCTCGCTgg > 2:129674/1‑150 (MQ=255) cATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTCTGCACAATCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATa < 2:1059004/150‑1 (MQ=255) cACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATacat < 2:930137/150‑2 (MQ=255) cccGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTc < 1:585526/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCCACCGCGTCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGTCGTCGGCCGTGAAAAAGGCGTCCGCTCGCTGGCTCAATACACTcc > 2:142308/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCg > 2:835820/1‑150 (MQ=255) aCCGCATACACCACAGGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGt > 2:59540/1‑150 (MQ=255) cGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATTAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCg > 1:629982/1‑115 (MQ=255) cGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCg < 2:629982/115‑1 (MQ=255) gCATCATCCACAAGCTCGAAGCCAGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCgg < 1:637228/150‑1 (MQ=255) tcCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGTGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAgg > 1:1355073/1‑150 (MQ=255) tcCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACgg > 1:1094562/1‑106 (MQ=255) tcCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACgg < 2:1094562/106‑1 (MQ=255) cacaAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTc > 2:293830/1‑150 (MQ=255) acaAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACGAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAAc < 1:1262751/101‑1 (MQ=255) acaAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACGAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAAc > 2:1262751/1‑101 (MQ=255) acaAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCCGCAGGGCGTCGGCCATGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCg > 1:247044/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTgg < 2:584666/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGTTGggc > 1:832231/1‑150 (MQ=255) gccgacgcccgactgcttgtagccacctaCCGGCCGAAATGCCGGTAg > 2:415325‑M1/30‑48 (MQ=255) gccgacgcccgactgcttgtagccacctaCCGGCCGAAATGCCGGTAg < 1:415325‑M1/19‑1 (MQ=255) tgctgGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTGGGCGGCTACAACTCg > 1:953635/1‑150 (MQ=255) tgctgGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTGGGCGGCTACAACTCg < 1:142308/150‑1 (MQ=255) tCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTGGGCGGCTACAACTCGGTTTTCt < 1:835820/150‑1 (MQ=255) gactgcttgtagccacctaCCGGCATTTCGGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTGGGCGGCTACAACTCGGTTTTc > 1:1341024‑M1/20‑148 (MQ=255) gactgcttgtagccacctaCCGGCATTTCGGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTGGGCGGCTACAACTCGGTTTTc < 2:1341024‑M1/129‑1 (MQ=255) cTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGa < 2:233784/117‑1 (MQ=255) cTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGa > 1:233784/1‑117 (MQ=255) gTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCATGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTGGGCGGCTACAACTCGGTTTTCTGAACCCTGTCTa < 2:247044/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTGGGCGGCTACAACTCGGTTTTCTGAACCCTGTCTAGcccc < 1:129674/150‑1 (MQ=255) ctaccggcatttcggccggTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGc > 2:415325‑M2/20‑48 (MQ=255) ctaccggcatttcggccggTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGc < 1:415325‑M2/29‑1 (MQ=255) aaTGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGACGTGAGCTCACTGGCTCAATACACTAGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTGGGCGGCTACAACTCGGTTTTCTGAACCCTGTCTAGCCCCGCCCGTGCCAc > 1:11413/1‑150 (MQ=255) | TGCCAACGACACCGACTACGGCCTGGCCGCCGGCGTCTGCACCAACGACATCACCCGCGCCCACCGCATCATCCACAAGCTCGAAGCCGGTATCTGCTGGATCAACGCCTGGGGTGAATCGCCGGCCGAAATGCCGGTAGGTGGCTACAAGCAGTCGGGCGTCGGCCGTGAAAACGGCGTCAGCTCGCTGGCTCAATACACTCGCATCAAGTCGGTCCAGGTCGAGCTGGGCGGCTACAACTCGGTTTTCTGAACCCTGTCTAGCCCCGCCCGTGCCAC > NC_002947/5775410‑5775688 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |