New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6115179 | 47 (0.890) | 4 (0.080) | 4/224 | NT | 8.6% | coding (564/1287 nt) | PP_5365 | fatty acid methyltransferase |
? | NC_002947 | = 6115207 | 42 (0.880) | coding (536/1287 nt) | PP_5365 | fatty acid methyltransferase |
CTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGTCATGA > NC_002947/6115062‑6115350 | cTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTAACCGGCATCCCGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTgctg < 2:6258‑M2/150‑5 (MQ=255) cTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTgctgcgcctgg < 2:315450‑M2/150‑12 (MQ=255) gggTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGa < 1:522431/150‑1 (MQ=255) gTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGc < 2:853152/150‑1 (MQ=255) gTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGc < 1:512037/150‑1 (MQ=255) aTGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGTTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTa < 2:637011/150‑1 (MQ=255) tGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTAt > 1:1215993/1‑150 (MQ=255) tGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTAt > 2:475856/1‑150 (MQ=255) gCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTAtt < 2:229928/150‑1 (MQ=255) gAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTc < 1:1395245/150‑1 (MQ=255) ttCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGgc > 1:1075034/1‑150 (MQ=255) aCGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCa < 1:1144175/150‑1 (MQ=255) gCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGaa > 2:188852/1‑150 (MQ=255) gCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAg < 2:451215/150‑1 (MQ=255) cGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAgg < 1:709195/150‑1 (MQ=255) gAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGc < 1:475856/150‑1 (MQ=255) gcCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGGGCCTGGTCGACCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGAAGGCGCAGGAATAGGCCATGTcc > 1:1255024/1‑150 (MQ=255) gcCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTcc < 1:188852/150‑1 (MQ=255) cAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTg < 1:1232403/150‑1 (MQ=255) cccAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGcc > 1:128943/1‑150 (MQ=255) ccacagccaACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTc > 1:421280/1‑86 (MQ=255) ccacagccaACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTc < 2:421280/86‑1 (MQ=255) acagccaACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTAGTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGAGGCAGCCAAAGCTg > 1:293534/1‑150 (MQ=255) caACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGa > 2:345643/1‑150 (MQ=255) aaCATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGaa > 1:600424/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCGTGGTCGAGCGTTTTGTCCGGCTAACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCGATGTCCTGGTCCAGCCAAAGTTGGTAGAACGCGtt > 2:605822/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGtt > 2:605891/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGtt < 2:1075034/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTg < 2:610574/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTg > 1:887741/1‑150 (MQ=255) aGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTg < 2:600424/150‑1 (MQ=255) cAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGa < 1:426871/150‑1 (MQ=255) cAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGa < 2:856528/150‑1 (MQ=255) gTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTgg > 2:1344439/1‑133 (MQ=255) gTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTgg < 1:1344439/133‑1 (MQ=255) aTCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTgctgcgcctggatgccggtgactacctgctcgatgttggctgtggctggggcgggctggcgcg > 1:69162‑M2/1‑41 (MQ=255) aTCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTgctgcgcctggatgccggtgactacctgctcgatgttggctgtggctggggcgggctggcgcg < 2:69162‑M2/104‑64 (MQ=255) ccAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCa > 2:290676/1‑96 (MQ=255) ccAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCa < 1:290676/96‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGATACCCCGGTTCGAGCGTCTTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGga > 2:49334/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTgctgcgcctggatgccggtgactacctgctcgatgttggctgtggctggggcgggctggcgcggttcgctgcccgtgaa > 1:619447‑M2/1‑35 (MQ=255) gcgcAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTgctgcgcctggatgccggtgactacctgctcgatgttggctgtggctggggcgggctggcgcggttcgctgcccgtgaa < 2:619447‑M2/114‑80 (MQ=255) cgcAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGAtt < 1:315450/150‑1 (MQ=255) gtCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCgg > 2:363518/1‑143 (MQ=255) gtCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCgg < 1:363518/143‑1 (MQ=255) tCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTGGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTg > 1:590087/1‑150 (MQ=255) tCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGCCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTGGGCGTCGGTGGTCTTg > 2:407118/1‑150 (MQ=255) cGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGt < 2:1215993/150‑1 (MQ=255) aCTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTa > 1:41948/1‑91 (MQ=255) aCTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTa < 2:41948/91‑1 (MQ=255) ttGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGTCATga < 2:887741/150‑1 (MQ=255) | CTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGTCATGA > NC_002947/6115062‑6115350 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |