Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_002947 | 3,866,735 | Δ8 bp | coding (180‑187/1020 nt) | PP_3415 ← | LacI family transcriptional regulator |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_002947 | 3866735 | 3866742 | 8 | 436 [0] | [0] 435 | PP_3415 | LacI family transcriptional regulator |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | 3866743 = | 0 (0.000) | coding (179/1020 nt) | PP_3415 | LacI family transcriptional regulator |
Only 100 of 435 total aligned reads displayed.
GTAATGATAGTTGCCGATCAGCACCTCTAGCCCACGAGGGCGCATGACCTCGTGAATGGCCTCCAGGGTGTCGATGAACAGTTGGTTGGACAACGACGGGATCAACACCACCACCGACTGGCTGCGTGCCGAGGCCAGCGCCCGGGCGGCCGGGTTGGCCACATAGCCAAGGTTCGCCGCTGCGGCGATGACCTTTTCCACCAGGTCAGGCGCAACGGTGCTGACCCCACGCAAGGCGCGCGAAGCGGTAATCGGGGAAACCCCGGAAAGCCTGGCAACTTCGGCCAGGGTGGGA > NC_002947/3866595‑3866889 | gcaaggtcgtaatgatagttgccgatcagcacctctagcccacgagggcgcatgacctcgtgaatggcctccagggtgtcgatgaacagttggttggacaacgacgggatcaacaccaccaccgactggctgcgtgccgaggccagcgGc > 1:4012013‑M2/149‑150 (MQ=255) caaggtcgtaatgatagttgccgatcagcacctctagcccacgagggcgcatgacctcgtgaatggcctccagggtgtcgatgaacagttggttggacaacgacgggatcaacaccaccaccgactggctgcgtgccgaggccagcgGcc < 2:2279890‑M2/3‑1 (MQ=255) caaggtcgtaatgatagttgccgatcagcacctctagcccacgagggcgcatgacctcgtgaatggcctccagggtgtcgatgaacagttggttggacaacgacgggatcaacaccaccaccgactggctgcgtgccgaggccagcgGcc < 2:6802987‑M2/3‑1 (MQ=255) aggtcgtaatgatagttgccgatcagcacctctagcccacgagggcgcatgacctcgtgaatggcctccagggtgtcgatgaacagttggttggacaacgacgggatcaacaccaccaccgactggctgcgtgccgaggccagcgGCCgg < 1:3462918‑M2/5‑1 (MQ=255) ggtcgtaatgatagttgccgatcagcacctctagcccacgagggcgcatgacctcgtgaatggcctccagggtgtcgatgaacagttggttggacaacgacgggatcaacaccaccaccgactggctgcgtgccgaggccagcgGCCggg < 1:3640722‑M2/6‑1 (MQ=255) tcgtaatgatagttgccgatcagcacctctagcccacgagggcgcatgacctcgtgaatggcctccagggtgtcgatgaacagttggttggacaacgacgggatcaacaccaccaccgactggctgcgtgccgaggccagcgGCCGGGtt > 2:3179082‑M2/143‑150 (MQ=255) gtaatgatagttgccgatcagcacctctagcccacgagggcgcatgacctcgtgaatggcctcccgggtgtcgatgaacagttggttggacaacgacgggatcaacaccaccaccgactggctgcgtgccgaggccagcgGCCGGGTTgg < 1:6979959‑M2/10‑1 (MQ=255) gtaatgatagttgccgatcagcacctctagcccacgagggcgcatgacctcgtgaatggcctccagggtgtcgatgaacagttggttggacaacgacgggatcaacaccaccaccgactggctgcgtgccgaggccagcgGCCGGGTTgg > 2:5889564‑M2/141‑150 (MQ=255) 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accaccgactggctgcgtgccgaggccagcgGCCGGGTTGGCCACATAGCCAAGGTTCGCCGCTGCGGCGATGACCTTTTCCACCAGGTCAGGCGCAACGGTGCTGACCCCACGCAAGGCGCGCGAAGCGGTAATCGGGGAAACCCCGGa > 1:3693301‑M2/32‑150 (MQ=255) ccaccgactggctgcgtgccgaggccagcgGCCGGGTTGGCCACATAGCCAAGGTTCGCCGCTGCGGCGATGACCTTTTCCACCAGGTCAGGCGCAACGGTGCTGACCCCACGCAAGGCGCGCGAAGCGGTAATCGGGGAAACCCCGGaa < 2:2051336‑M2/120‑1 (MQ=255) gccgactggctgcgtgccgaggccagcgGCCGGGTTGGCCACATAGCCAAGGTTCGCCGCTGCGGCGATGACCTTTTCCACCAGGTCAGGCGCAACGGTGCTGACCCCACGCAAGGCGCGCGAAGCGGTAATCGGGGAAACCCCGGAAAg > 2:1506647‑M2/29‑150 (MQ=255) accgactggctgcgtgccgaggccagcgGCCGGGTTGGCCACATAGCCAAGGTTCGCCGCTGCGGCGATGACCTTTTCCACCAGGTCAGGCGCAACGGTGCTGACCCCACGCAAGGCGCGCGAAGCGGTAATCGGGGAAACCCCGGAAAg > 2:545219‑M2/29‑150 (MQ=255) gactggctgcgtgccgaggccagcgGCCGGGTTGGCCACATAGCCAAGGTTCGCCGCTGCGGCGATGACCTTTTCCACCAGGTCAGGCGCAACGGTGCTGACCCCACGCAAGGCGCGCGAAGCGGTCATCGGGGAAACCCCGGAAAGCCt > 2:7259447‑M2/26‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |