| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 6013891 | 30 (0.540) | 22 (0.500) | 17/202 | 2.0 | 43.3% | intergenic (+40/+70) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| ? | NC_002947 | = 6013919 | 34 (0.770) | intergenic (+68/+42) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > NC_002947/6013749‑6014039 | gctccAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcac > 2:886527‑M1/3‑143 (MQ=255) ttCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGcaca > 2:1394638/1‑150 (MQ=255) tCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGATACGCTGATGTTGCTCAAAGGAGGGCATTTTTTCTGTAGCTTATAGATGTTTCACCTGCTTCGCTTGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAg < 2:1275213/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑Gt < 1:533906/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑Gt < 2:1283528/150‑1 (MQ=255) aGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑Gtc < 2:1060471/150‑1 (MQ=255) gggCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGTacggcacagcgtt > 2:229347‑M1/1‑137 (MQ=255) ggcCGTGCCGCACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGCGCCAGCACCGGCCAACCTGATGTGGTCAACCTCAGCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGa‑a < 1:104469/150‑1 (MQ=255) ggcCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGa‑a < 2:1079671/150‑1 (MQ=255) gcCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑Ac < 1:209821/150‑1 (MQ=255) gTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgcagcacagcgttcgagacct < 2:640879‑M1/150‑22 (MQ=255) gTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCt < 1:810910/150‑1 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcac < 1:1236971‑M1/150‑31 (MQ=255) 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ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGCGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 1:1027258/1‑150 (MQ=255) cacaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcga < 2:268811‑M2/83‑49 (MQ=255) acaGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaa < 1:1425697‑M1/133‑128 (MQ=255) acaGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaa > 2:1425697‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgctcgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaa < 2:251131‑M2/86‑53 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgctcgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaa > 1:251131‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctg < 1:367553‑M2/150‑117 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctg < 1:886527‑M2/150‑117 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaa < 2:1192821‑M2/86‑53 (MQ=255) aGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccatcgtggtcaccctggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtc < 1:993487‑M1/150‑147 (MQ=255) aGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacc < 2:1059937‑M2/115‑84 (MQ=255) aGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacc > 1:1059937‑M2/1‑32 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca < 1:1236971‑M2/150‑121 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGccc > 1:559129/1‑92 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGccc < 2:559129/92‑1 (MQ=255) | GTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > NC_002947/6013749‑6014039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |