| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1419584 | 55 (0.950) | 15 (0.340) | 13/202 | 2.7 | 24.1% | intergenic (‑67/+70) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 1419614 | 53 (1.210) | intergenic (‑97/+40) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTA > NC_002947/1419439‑1419733 | gCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGtgct < 2:1120182‑M1/150‑5 (MQ=255)gCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACt < 2:1437423/150‑1 (MQ=255) tGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCa > 2:418877/1‑150 (MQ=255) aGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGt > 1:1123773/1‑150 (MQ=255) tgttgtTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGc > 1:568436/1‑150 (MQ=255) tgttgtTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCACTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGc > 1:616881/1‑150 (MQ=255) gttgttTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgt > 2:221988‑M1/1‑136 (MQ=255) gttTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcac > 1:1376816‑M1/1‑133 (MQ=255) ttttCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTg < 2:335811/144‑1 (MQ=255) ttttCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTg > 1:335811/1‑144 (MQ=255) cTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtgtg < 1:162312/150‑1 (MQ=255) ttGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTgtgg > 2:899129/1‑150 (MQ=255) aGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTATTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACc < 1:425802‑M2/150‑2 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgt < 2:1372017‑M2/150‑6 (MQ=255) cAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGACTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTTCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtg > 1:999152‑M2/1‑144 (MQ=255) aGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgg < 1:267565‑M2/150‑8 (MQ=255) gTCTTGCTGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtggga > 2:258365‑M2/1‑141 (MQ=255) cTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagc > 1:1372017‑M2/1‑139 (MQ=255) 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tgtgGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGATGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtg > 1:846853‑M2/1‑130 (MQ=255) gtggGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgt < 1:496697‑M2/143‑18 (MQ=255) gggTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaa > 2:444572‑M2/1‑124 (MQ=255) ggTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggc > 1:406835‑M1/1‑93 (MQ=255) gTTCTGTTGCGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGTTTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCGCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaga > 1:806540‑M2/1‑122 (MQ=255) 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gCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccag < 1:983796‑M1/104‑86 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccac > 2:496697‑M1/1‑17 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGAc < 1:494337/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaga < 2:484903‑M1/73‑59 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgaccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcgg < 1:1012459‑M2/150‑106 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacc < 2:406835‑M2/138‑94 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacc > 1:406835‑M2/1‑45 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTc < 1:884212/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggc > 1:85130‑M1/1‑14 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaccaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagccggc < 2:475330‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGTGGAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGTGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGa < 1:294293/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCGACTGCATCAACGCCGACTCGa > 2:766090/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAAAGCCGACTCgc > 2:1420417/1‑149 (MQ=255) gCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaag > 1:1372017‑M1/1‑11 (MQ=255) tCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaac > 2:130483‑M2/1‑39 (MQ=255) tCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaac < 1:130483‑M2/100‑62 (MQ=255) ccACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaagacct < 1:267565‑M1/150‑144 (MQ=255) cacaGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaagacctg > 2:1421796‑M1/1‑6 (MQ=255) cacaGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtggaagcgggcgtgcccgcgaagaggccagtccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaagacctg > 1:999152‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaagacctgc < 1:505327‑M1/150‑146 (MQ=255) acaGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaagacctgc > 1:1042189‑M1/1‑5 (MQ=255) aGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaagacctgctt < 1:420815‑M1/150‑148 (MQ=255) aGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTg > 1:476330/1‑150 (MQ=255) gggacaccgcagcggtcacagactgcacagtacttgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaagacctgcttc < 2:85130‑M1/150‑149 (MQ=255) ggtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaatagaacccaccacagtcggcaagacctgcttct < 1:425802‑M1/150‑150 (MQ=255) gTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaagacctgcttct < 2:1477749‑M2/150‑120 (MQ=255) | GCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTA > NC_002947/1419439‑1419733 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |