New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1419584 | 55 (0.950) | 15 (0.340) | 13/202 | 2.7 | 24.1% | intergenic (‑67/+70) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1419614 | 53 (1.210) | intergenic (‑97/+40) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
AGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGC > NC_002947/1419466‑1419758 | aGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTATTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACc < 1:425802‑M2/150‑2 (MQ=255) gAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAAGTACTGTGCAGTCTGTGACCGCTGCGGTGTCcc < 2:85130‑M2/150‑3 (MQ=255) aaGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcct < 1:420815‑M2/150‑4 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgt > 1:1042189‑M2/1‑145 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgt < 2:1372017‑M2/150‑6 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgt < 1:505327‑M2/150‑6 (MQ=255) cAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtg > 2:1421796‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGACTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTTCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtg > 1:999152‑M2/1‑144 (MQ=255) aGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgg < 1:267565‑M2/150‑8 (MQ=255) gTCTTGCTGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtggga > 2:258365‑M2/1‑141 (MQ=255) cTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagc > 1:1372017‑M2/1‑139 (MQ=255) ttGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcg < 1:444572‑M2/150‑13 (MQ=255) gCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcggg > 1:85130‑M2/1‑136 (MQ=255) 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atttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCCCCCCTGCTCCCCCCGCTGCGGTGCTATGCGTACAGGCTGTAGTGAGCTCGTGGGAGCGTCCGGGCGCGCGAAGGTGCCTGACCTGCTAAAGCTAgcggtgg > 2:823152/2‑144 (MQ=255) tttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCGCACAGGTCCTGTGTAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAg < 1:996181/150‑1 (MQ=255) tttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAg > 2:884212/1‑150 (MQ=255) tttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGc < 1:269743/130‑1 (MQ=255) tttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGc > 2:269743/1‑130 (MQ=255) ttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcggg < 2:679077‑M2/103‑15 (MQ=255) 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cTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTgg < 2:505327/150‑1 (MQ=255) tGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTggg < 2:420815/150‑1 (MQ=255) gATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTaa < 2:569110/125‑1 (MQ=255) gATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTaa > 1:569110/1‑125 (MQ=255) aTTCTGGGTTACCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTaa < 2:568436/150‑1 (MQ=255) gtCTGGGTTGCCTGGGCTGGTCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTaaa < 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ccGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggca < 2:1376816‑M2/150‑108 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccag > 1:62763‑M2/1‑43 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccag < 2:62763‑M2/98‑56 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCGACTGCATCAACGCCGACTCGa > 2:766090/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAAAGCCGACTCgc > 2:1420417/1‑149 (MQ=255) tCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaac > 2:130483‑M2/1‑39 (MQ=255) tCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaac < 1:130483‑M2/100‑62 (MQ=255) cccACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGc > 2:1234912/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTg > 1:476330/1‑150 (MQ=255) gTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaagacctgcttct < 2:1477749‑M2/150‑120 (MQ=255) cTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCg > 1:687543/1‑150 (MQ=255) tgtgCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCa < 1:1177031/137‑1 (MQ=255) tgtgCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCa > 2:1177031/1‑137 (MQ=255) tgtgCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGc > 2:1362801/1‑150 (MQ=255) gCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaa < 1:1340528‑M2/83‑60 (MQ=255) gCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaa > 2:1340528‑M2/1‑24 (MQ=255) gTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgcccaccgacaacacaacagaacccaccacagtcggcaagacctgcttctaccaaggcgaaaac > 1:1376816‑M2/1‑17 (MQ=255) gTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAAt > 2:66882/1‑88 (MQ=255) gTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAAt < 1:66882/88‑1 (MQ=255) 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gttgACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGc < 1:766090/148‑1 (MQ=255) | AGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTC‑GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGC > NC_002947/1419466‑1419758 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |