New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 254680 = | 32 (1.010) | 8 (0.270) | 7/236 | NT | 22.1% | coding (437/1731 nt) | PP_0203 | dipeptidase |
? | NC_002947 | 254712 = | 26 (0.860) | coding (405/1731 nt) | PP_0203 | dipeptidase |
TGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTG > NC_002947/254534‑254829 | accgcctgctcggcctgtatacccgcatcaagtatggcaaagccgctaccgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAagg > 2:843148‑M1/147‑150 (MQ=255) ccgcctgctcggcctgtatacccgcatcaagtatggcaaagccgctaccgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgccgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAaggc < 1:189005‑M1/5‑1 (MQ=255) cTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAaggcca‑g > 2:627773/1‑150 (MQ=255) tGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAaggcca‑ggc < 2:832115/150‑1 (MQ=255) tGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGAATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAaggcca‑ggc < 1:660726/150‑1 (MQ=255) cctgtatacccgcatcaagtatggcaaagccgctaccgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAAGGCCA‑GGCCGAAGCg < 1:646051‑M1/17‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGt < 2:301031/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCACAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTCCGGACGGACA‑GGCCCAAGCGGTc < 2:33402/150‑1 (MQ=255) tACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAgg > 1:695938/1‑150 (MQ=255) gcatcaagtatggcaaagccgctaccgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgcgggtatgacgcagtacgaaaacccgcaattcctcaagatcgccgacaagatcAAGGCCTTGGCCGAAGCGGTCGGCCAAg > 1:744364‑M1/123‑150 (MQ=255) atcaagtatggcaaagccgctaccgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGcc > 2:115310‑M1/121‑150 (MQ=255) caagtatggcaaagccgctaccgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCtt > 2:646051‑M1/119‑150 (MQ=255) gTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGAt > 1:801934/1‑150 (MQ=255) cgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTg < 1:324920‑M1/33‑1 (MQ=255) cgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTg > 2:324920‑M1/98‑130 (MQ=255) cGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAg < 1:801951/150‑1 (MQ=255) ttGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAAt > 1:687714/1‑150 (MQ=255) aCCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGACGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCa < 1:627773/150‑1 (MQ=255) ccGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAg > 1:445750/1‑150 (MQ=255) cGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGcc < 2:429603/112‑1 (MQ=255) cGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGcc > 1:429603/1‑112 (MQ=255) gCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGt > 1:703744/1‑150 (MQ=255) gCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGt > 1:786473/1‑150 (MQ=255) tccgCATGGATGCCGCTCACTTCCTTCCCGCTGCCCACTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCACCGATCTTTACGAATTCAGGGTTTTCGTACTgcggc < 1:415520/147‑1 (MQ=255) gCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGAc > 2:245364/1‑150 (MQ=255) tCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGa > 1:291208/1‑150 (MQ=255) ccttccCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTgg < 2:786473/150‑1 (MQ=255) cttccCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTggg < 1:245364/150‑1 (MQ=255) cGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTNAGGGTTNTCGTACTGCGGCNTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATgg < 1:759896/150‑1 (MQ=255) cGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATgg < 2:445750/150‑1 (MQ=255) gcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCtt > 1:540630‑M1/44‑75 (MQ=255) gcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCtt < 2:540630‑M1/32‑1 (MQ=255) gCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAATGCCG‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGc > 2:759896/1‑150 (MQ=255) gCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGc > 1:714522/1‑150 (MQ=255) ccAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCa < 2:695938/150‑1 (MQ=255) ccAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCa < 1:196633/150‑1 (MQ=255) aGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGAGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGCCATTGAAAGTGGGGATGGCTACTAgg > 2:162840/1‑149 (MQ=255) tctcGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCa > 2:498394/1‑150 (MQ=255) ctcGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAg < 2:801934/150‑1 (MQ=255) acCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCg > 2:697923/1‑150 (MQ=255) cGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTa < 2:714522/150‑1 (MQ=255) gATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCttt > 1:47712/1‑150 (MQ=255) AAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTg < 1:772514‑M1/150‑1 (MQ=255) | TGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTG > NC_002947/254534‑254829 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |