New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 254680 = | 32 (1.010) | 8 (0.270) | 7/236 | NT | 22.1% | coding (437/1731 nt) | PP_0203 | dipeptidase |
? | NC_002947 | 254712 = | 26 (0.860) | coding (405/1731 nt) | PP_0203 | dipeptidase |
GTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGATGCGGGTATACAGGCCGAGCAGGCGGT > NC_002947/254577‑254857 | gTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGAt > 1:801934/1‑150 (MQ=255) cgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTg < 1:324920‑M1/33‑1 (MQ=255) cgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTg > 2:324920‑M1/98‑130 (MQ=255) cGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAg < 1:801951/150‑1 (MQ=255) ttGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAAt > 1:687714/1‑150 (MQ=255) aCCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGACGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCa < 1:627773/150‑1 (MQ=255) ccGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAg > 1:445750/1‑150 (MQ=255) gCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGt > 1:786473/1‑150 (MQ=255) gCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGt > 1:703744/1‑150 (MQ=255) tccgCATGGATGCCGCTCACTTCCTTCCCGCTGCCCACTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCACCGATCTTTACGAATTCAGGGTTTTCGTACTgcggc < 1:415520/147‑1 (MQ=255) gCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGAc > 2:245364/1‑150 (MQ=255) tCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGa > 1:291208/1‑150 (MQ=255) ccttccCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTgg < 2:786473/150‑1 (MQ=255) cttccCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTggg < 1:245364/150‑1 (MQ=255) cGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTNAGGGTTNTCGTACTGCGGCNTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATgg < 1:759896/150‑1 (MQ=255) cGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATgg < 2:445750/150‑1 (MQ=255) gCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAATGCCGGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGc > 2:759896/1‑150 (MQ=255) gCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGc > 1:714522/1‑150 (MQ=255) ccAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCa < 2:695938/150‑1 (MQ=255) ccAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCa < 1:196633/150‑1 (MQ=255) aGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGAGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGCCATTGAAAGTGGGGATGGCTACTAgg > 2:162840/1‑149 (MQ=255) tctcGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCa > 2:498394/1‑150 (MQ=255) ctcGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAg < 2:801934/150‑1 (MQ=255) acCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCg > 2:697923/1‑150 (MQ=255) cGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTa < 2:714522/150‑1 (MQ=255) gATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCttt > 1:47712/1‑150 (MQ=255) caaggccttggccgaccgcttcggcctggccttGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCg > 2:324920‑M2/34‑130 (MQ=255) caaggccttggccgaccgcttcggcctggccttGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCg < 1:324920‑M2/97‑1 (MQ=255) aaggccttggccgaccgcttcggcctggccttGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTgc > 1:540630‑M2/33‑75 (MQ=255) aaggccttggccgaccgcttcggcctggccttGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTgc < 2:540630‑M2/43‑1 (MQ=255) aaggccttggccgaccgcttcggcctggccttGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTg > 2:646051‑M2/33‑150 (MQ=255) AAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTg < 1:772514‑M1/150‑1 (MQ=255) AGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGa > 1:498394‑M1/1‑150 (MQ=255) ggccttggccgaccgcttcggcctggccttGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGAt > 2:115310‑M2/31‑150 (MQ=255) cttggccgaccgcttcggccaaggccttGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTGCGGGTTTTCGTACTGCGTCATACCCGCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGATGc > 1:744364‑M2/29‑150 (MQ=255) aggccGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGATGCgg < 2:47712/150‑1 (MQ=255) aggccGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGATGCgg < 2:772514/150‑1 (MQ=255) cgcttcggcctggccttGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGATGCGGGTATACAgg < 1:646051‑M2/133‑1 (MQ=255) gCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGATGCGGGTATACAGGCCGAGc < 2:703744/150‑1 (MQ=255) aaGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGATGCGGGTATACAGGCCGAGCAgg < 2:729187/150‑1 (MQ=255) gccttGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGGCATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGATGCGGGTATACAGGCCGAGCAGGCgg < 1:189005‑M2/145‑1 (MQ=255) ccttGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGATGCGGGTATACAGGCCGAGCAGGCGGt > 2:843148‑M2/5‑150 (MQ=255) gATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTg < 1:359610/118‑1 (MQ=255) gATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTg > 2:359610/1‑118 (MQ=255) | GTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCAGGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTTGATGCGGGTATACAGGCCGAGCAGGCGGT > NC_002947/254577‑254857 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |