New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1497637 | 33 (1.040) | 4 (0.130) | 3/234 | NT | 10.6% | coding (218/636 nt) | PP_1310 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1497672 | 36 (1.200) | coding (253/636 nt) | PP_1310 | hypothetical protein |
GTGGCGCGGTGCTGATCTGCCACCCCAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCC > NC_002947/1497502‑1497786 | gTGGCGCGGTGCTGATCTGCCACCCCAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGcc < 1:64833/150‑1 (MQ=255) gcgGTGCTGATCTGCCACCCCAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGAc > 1:611779/1‑150 (MQ=255) gaagtGATCAGCCACCCCAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATg > 2:500132/5‑150 (MQ=255) tGCTGATCTGCCACCCCAACCCGGTCCAGGGCGGCAACATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACACTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCCGCAGCCACGACATgg > 2:196690/1‑150 (MQ=255) aTCTGCCACCCCAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCt > 1:553390/1‑150 (MQ=255) tCTGCCACCCCAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTg < 1:72266/150‑1 (MQ=255) tGCCACCCCAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCCTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGc < 2:494737/150‑1 (MQ=255) cccAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGtg < 1:140382‑M2/150‑3 (MQ=255) ggTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGc < 1:756722/150‑1 (MQ=255) aGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAgg > 1:221392/1‑150 (MQ=255) gcggcACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCg > 2:794241/1‑150 (MQ=255) gcggcACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCg > 2:379071/1‑150 (MQ=255) gcggcACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCg > 2:205484/1‑150 (MQ=255) cATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTgcagc > 1:666280/1‑150 (MQ=255) aacaaGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCActtcgccagcgcccatgtcgtggctgccggcgctct > 2:613800‑M1/1‑83 (MQ=255) aacaaGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCActtcgccagcgcccatgtcgtggctgccggcgctct < 1:613800‑M1/119‑37 (MQ=255) aaGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGt < 2:666280/150‑1 (MQ=255) gACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCActtcgccagcgcccatgtcgtggctgccggcgctctgg > 2:325268‑M1/1‑69 (MQ=255) gACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCActtcgccagcgcccatgtcgtggctgccggcgctctcg < 1:325268‑M1/107‑39 (MQ=255) tGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGc > 1:610847/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGc > 2:455025/1‑150 (MQ=255) cAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTa < 2:140382/150‑1 (MQ=255) cacGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCgg > 1:252621/1‑61 (MQ=255) cacGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCgg < 2:252621/61‑1 (MQ=255) gTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGa > 1:516062/1‑150 (MQ=255) gTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCtttt > 1:392536/1‑150 (MQ=255) gtgACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttcgttc > 2:647545/1‑150 (MQ=255) tgACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttcgttcg < 1:794241/150‑1 (MQ=255) tgACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttcgttcg < 1:379071/150‑1 (MQ=255) aCCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGTGCTGGCGAAGt > 1:458383‑M2/1‑67 (MQ=255) aCCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGTGCTGGCGAAGt < 2:458383‑M2/68‑2 (MQ=255) ccTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCggtgg > 2:467913/1‑150 (MQ=255) tttCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttcgttc < 2:720736/139‑1 (MQ=255) tttCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttcgttc > 1:720736/1‑139 (MQ=255) tttCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttc < 1:633701/135‑1 (MQ=255) tttCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttc > 2:633701/1‑135 (MQ=255) ttCAACTACCGTGGCGTCGGGCAGAGCGCCGGCAGCCACGAGTTGGGCGCTGGCGAAGTCGCCGATGGCGAGACCGCTGCAGCATGGCTGCAGGCCAGGCAAACCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTGTCGTTCGGTGGTTTCGtt < 2:316574/150‑1 (MQ=255) aaCTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGtt > 1:371400/1‑147 (MQ=255) aaCTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGtt < 2:371400/147‑1 (MQ=255) aaCTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGcc > 2:504923/1‑150 (MQ=255) cgagagcgCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGtggccgacgccacggtagttgaaacgcagggtcacataaccggcatcacgtgcggtgcgctgcagggtc < 1:325268‑M2/105‑70 (MQ=255) ccAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGtggccgacgccacggtagttgaaacgcagggtcacataaccggcatcacgtgcggtgcgctgcagggtc > 2:325268‑M2/1‑38 (MQ=255) ccAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGgcg > 2:764847/1‑150 (MQ=255) cActtcgccagcgcccatgtcgtggctgccggcgctctggccgacgccacggtagttgaaacgcagggtcacataaccggcatcacgtgcggtgcgctgcagggtcgagaccaccttgttgagcatggtgccgccctggaccgggttggg < 1:140382‑M1/150‑149 (MQ=255) agagCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGtggccgacgccacggtagttgaaacgcagggtcacataaccggcatcacgtgcggtgcgctgcagggtcgagaccaccttgtt > 2:613800‑M2/1‑36 (MQ=255) agagCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGtggccgacgccacggtagttgaaacgcagggtcacataaccggcatcacgtgcggtgcgctgcagggtcgagaccaccttgtt < 1:613800‑M2/119‑84 (MQ=255) agagCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGcc < 1:196690/150‑1 (MQ=255) acttcgccagcacccatgtcgtggctgccggcgctctggccgacgccacggtagttgaaacgcagggt < 2:458383‑M1/68‑68 (MQ=255) acttcgccagcacccatgtcgtggctgccggcgctctggccgacgccacggtagttgaaacgcagggt > 1:458383‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTGGCGCGGTGCTGATCTGCCACCCCAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCC > NC_002947/1497502‑1497786 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |