New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1497637 | 33 (1.040) | 4 (0.130) | 3/234 | NT | 10.6% | coding (218/636 nt) | PP_1310 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1497672 | 36 (1.200) | coding (253/636 nt) | PP_1310 | hypothetical protein |
CCCAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCTTGAAACTGCAGGCGTCGA > NC_002947/1497525‑1497805 | cccAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGtg < 1:140382‑M2/150‑3 (MQ=255) ggTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGc < 1:756722/150‑1 (MQ=255) aGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAgg > 1:221392/1‑150 (MQ=255) gcggcACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCg > 2:794241/1‑150 (MQ=255) gcggcACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCg > 2:379071/1‑150 (MQ=255) gcggcACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCg > 2:205484/1‑150 (MQ=255) cATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTgcagc > 1:666280/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGt < 2:666280/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGc > 2:455025/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGc > 1:610847/1‑150 (MQ=255) cAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTa < 2:140382/150‑1 (MQ=255) gTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGa > 1:516062/1‑150 (MQ=255) gTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCtttt > 1:392536/1‑150 (MQ=255) gtgACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttcgttc > 2:647545/1‑150 (MQ=255) tgACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttcgttcg < 1:794241/150‑1 (MQ=255) tgACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttcgttcg < 1:379071/150‑1 (MQ=255) aCCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGTGCTGGCGAAGt < 2:458383‑M2/68‑2 (MQ=255) aCCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGTGCTGGCGAAGt > 1:458383‑M2/1‑67 (MQ=255) ccTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCggtgg > 2:467913/1‑150 (MQ=255) tttCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttcgttc > 1:720736/1‑139 (MQ=255) tttCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttcgttc < 2:720736/139‑1 (MQ=255) tttCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttc < 1:633701/135‑1 (MQ=255) tttCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTttc > 2:633701/1‑135 (MQ=255) ttCAACTACCGTGGCGTCGGGCAGAGCGCCGGCAGCCACGAGTTGGGCGCTGGCGAAGTCGCCGATGGCGAGACCGCTGCAGCATGGCTGCAGGCCAGGCAAACCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTGTCGTTCGGTGGTTTCGtt < 2:316574/150‑1 (MQ=255) aaCTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGtt > 1:371400/1‑147 (MQ=255) aaCTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGtt < 2:371400/147‑1 (MQ=255) aaCTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGcc > 2:504923/1‑150 (MQ=255) cgagagcgCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGtggccgacgccacggtagttgaaacgcagggtcacataaccggcatcacgtgcggtgcgctgcagggtc < 1:325268‑M2/105‑70 (MQ=255) ccAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGtggccgacgccacggtagttgaaacgcagggtcacataaccggcatcacgtgcggtgcgctgcagggtc > 2:325268‑M2/1‑38 (MQ=255) ccAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGgcg > 2:764847/1‑150 (MQ=255) agagCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGtggccgacgccacggtagttgaaacgcagggtcacataaccggcatcacgtgcggtgcgctgcagggtcgagaccaccttgtt > 2:613800‑M2/1‑36 (MQ=255) agagCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGtggccgacgccacggtagttgaaacgcagggtcacataaccggcatcacgtgcggtgcgctgcagggtcgagaccaccttgtt < 1:613800‑M2/119‑84 (MQ=255) agagCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGcc < 1:196690/150‑1 (MQ=255) agCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCtt < 2:610847/150‑1 (MQ=255) gcgcCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGc < 1:212759/127‑1 (MQ=255) gcgcCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGc > 2:212759/1‑127 (MQ=255) cgcCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCTTGa > 2:14776/1‑150 (MQ=255) gccgacgCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCTTGaaa < 1:182217/144‑1 (MQ=255) cACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCTTGaaa > 2:575666/1‑142 (MQ=255) cACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCTTGaaa < 1:575666/142‑1 (MQ=255) gACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCTTGAAACTGCAGGCGTc < 2:516062/150‑1 (MQ=255) aCATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCTTGAAACTGCAGGCGTCg > 2:102736/1‑150 (MQ=255) cATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCTTGAAACTGCAGGCGTCGa < 1:455025/150‑1 (MQ=255) cATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCTTGAAACTGCAGGCGTCGa < 1:14776/150‑1 (MQ=255) | CCCAACCCGGTCCAGGGCGGCACCATGCTCAACAAGGTGGTCTCGACCCTGCAGCGCACCGCACGTGATGCCGGTTATGTGACCCTGCGTTTCAACTACCGTGGCGTCGGCCAGAGCGCCGGCAGCCACGACATGGGCGCTGGCGAAGTGGCCGATGCCGAGGCCGCTGCAGCATGGCTGCGTGCCAGGCACCCCGGGCTACCGCTGGTGCTGATGGGCTTTTCGTTCGGTGGTTTCGTTGCCACCAGCCTGGCCGGGCGCCTTGAAACTGCAGGCGTCGA > NC_002947/1497525‑1497805 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |