New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2298183 = | 27 (0.850) | 4 (0.130) | 4/234 | NT | 13.2% | coding (1982/3645 nt) | sbcC | exonuclease subunit SbcC |
? | NC_002947 | 2298208 = | 27 (0.900) | coding (1957/3645 nt) | sbcC | exonuclease subunit SbcC |
AGGCGACGCAGCTGGCTGTCGAGCCAGGCGCTACGGGCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGCGGCCCAGGCTCTGCAGCAGCGCTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGT > NC_002947/2298036‑2298329 | cctgcccggtctgtggcagcgccgaacaccccttccatcagccagaagcgctgctgcagagcctgggccgccatgaccaggccgaagagcacgccgcccagaagcaggtcgagacgctcaacagcaagctggtggagctgcgtacccAGc < 1:701185‑M1/3‑1 (MQ=255) cctgcccggtctgtggcagcgccgaacaccccttccatcagccagaagcgctgctgcagagcctgggccgccatgaccaggccgaagagcacgccgcccagaagcaggtcgagacgctcaacagcaagctggtggagctgcgtacccAGc < 2:647832‑M1/3‑1 (MQ=255) aGGCGACGCAGCTGGCTGTCGAGCCAGGCGCTACGGGCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCACCTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGc > 1:475779/1‑150 (MQ=255) tgcccggtctgtggcagcgccgaacaccccttccatcagacagaagcgctgctgcagagcctgggccgccatgaccaggccgaagagcacgccgcccagaagcaggtcgagacgctgaacagcaagctggtggagctgcgtacccAGCTg < 2:68602‑M1/5‑1 (MQ=255) gcccggtctgtggcagcgccgaacaccccttccatcagccagaagcgctgctgcagagcctgggccgccatgaccaggccgaagagcacgccgcccagaagcaggtcgagacgctcaacagcaagctggtggagctgcgtacccAGCTgg > 2:569928‑M1/145‑150 (MQ=255) cGACGCAGCTGGCTGTCGAGCCAGGCGCTACGGGCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTgg < 2:126991/150‑1 (MQ=255) cGACGCAGCTGGCTGTCGAGCCAGGCGCTACGGGCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTgg < 2:127483/150‑1 (MQ=255) gCAGCTAGCTGTCGAGCCAGGCGCTACGGGCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCAt > 2:243294/1‑150 (MQ=255) tggcagcgccgaacaccccttccatcagccagaagcgctgctgcagagcctgggccgccatgaccaggccgaagagcacgccgcccagaagcaggtcgagacgctcaacagcaagctggtggagctgcgtacccAGCTgg > 2:468665‑M1/135‑140 (MQ=255) tggcagcgccgaacaccccttccatcagccagaagcgctgctgcagagcctgggccgccatgaccaggccgaagagcacgccgcccagaagcaggtcgagacgctcaacagcaagctggtggagctgcgtacccAGCTgg < 1:468665‑M1/6‑1 (MQ=255) tgTCGAGCCAGGCGCTACGGGCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGAc > 1:286960/1‑145 (MQ=255) tgTCGAGCCAGGCGCTACGGGCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGAc < 2:286960/145‑1 (MQ=255) cAGGCGCTACGGGCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTgg < 2:792514/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTACGGGCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTgg < 1:86256/150‑1 (MQ=255) cccttccatcagccagaagcgctgctgcagagcctgggccgccatgaccaggccgaagagcacgccgcccagaagcaggtcgagacgctcaacagcaagctggtggagctgcgtacccAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACg < 2:391392‑M1/32‑1 (MQ=255) ggCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTTGTTTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGcgc > 1:180380/1‑148 (MQ=255) ccTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGCGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGc < 1:608962/150‑1 (MQ=255) cTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCt < 1:243294/150‑1 (MQ=255) gggCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGa < 1:823093/150‑1 (MQ=255) tgtgtgCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTg > 1:448666/1‑122 (MQ=255) tgtgtgCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTg < 2:448666/122‑1 (MQ=255) gTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGct > 1:225792/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCt > 2:325640/1‑150 (MQ=255) accaGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTgg > 2:701185/1‑150 (MQ=255) caGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGc < 2:326544/121‑1 (MQ=255) caGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGc > 1:326544/1‑121 (MQ=255) ccagaagcaggtcgagacgctcaacagcaagctggtggagctgcgtacccAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTAc < 1:587968‑M1/31‑1 (MQ=255) ccagaagcaggtcgagacgctcaacagcaagctggtggagctgcgtacccAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTAc > 2:587968‑M1/51‑81 (MQ=255) aaCTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGCGGccc > 2:538451/1‑150 (MQ=255) aCTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTGGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGAATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGTGGCCCa < 1:161959/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGCGGCCCAGGct > 1:647832/1‑150 (MQ=255) cGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGCGGCCCAGGCTCTGCagcagc < 1:325640/150‑1 (MQ=255) gctgctgctGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGCGGCCCAGGCTCTGCAGCAgcg > 1:119352/1‑150 (MQ=255) caagctggtggagctgcgtacccAGCTGGGTGTGGTCAATGCCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGCGGCCCAGGCTCTGCAGCAGAGCtt < 1:391392‑M1/127‑1 (MQ=255) gTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGGATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGGTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGCGGCCCAGGCTCTGCAGCAGCGCTTCTGGCt < 2:348395/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGCGGCCCAGGCTCTGCAGCAGCGCTTCTGGCTGATg > 1:308235/1‑150 (MQ=255) tCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATggcggc > 2:667792/1‑112 (MQ=255) tCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATggcggc < 1:667792/112‑1 (MQ=255) ttGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGCGGCCCAGGCTCTGCAGCAGCGCTTCTGGCTGATGGAAGGGgtgt > 1:380795/1‑150 (MQ=255) | AGGCGACGCAGCTGGCTGTCGAGCCAGGCGCTACGGGCCTTGTCGTCCTGCGGGGCGAGGGCTGGCCACAGGCTGTGTGCCTGTACCTGAGCCACCAGCGGTTGCAACTGTTCGCCCAGTCGCTGCTGCTGTTGCTGGAAGTCCTTGAGCTGGGCATTGACCACACCCAGCTGGGTACGCAGCTCCACCAGCTTGCTGTTGAGCGTCTCGACCTGCTTCTGGGCGGCGTGCTCTTCGGCCTGGTCATGGCGGCCCAGGCTCTGCAGCAGCGCTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGT > NC_002947/2298036‑2298329 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |