New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2775344 = | 34 (1.070) | 6 (0.200) | 5/236 | NT | 15.7% | coding (211/1353 nt) | PP_5521 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2775369 = | 32 (1.060) | coding (186/1353 nt) | PP_5521 | hypothetical protein |
ATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGACTGCCTGCTGCC > NC_002947/2775196‑2775490 | aTGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTg > 1:138158/1‑150 (MQ=255) tGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTgg > 1:25415/1‑150 (MQ=255) gacaagcaagacccccagcagcagtggcagcaggcagtcatcgcctatgcccaggccgtcaacgactacgtcgcgcagggccgtgcgcacggctgggacaacctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgccTgg > 1:800324‑M1/148‑150 (MQ=255) gggCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGctg < 1:6605/150‑1 (MQ=255) gcagGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTCGctgctttct < 2:426096/150‑6 (MQ=255) aaagCTGCCATCTTCCAACAGCACGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAACAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAg < 2:138158/147‑1 (MQ=255) tGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCATTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGGCGACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAg < 1:368800/150‑1 (MQ=255) gCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGa < 1:182372/150‑1 (MQ=255) gcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGa > 1:317194/1‑150 (MQ=255) aCATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAgg > 1:382148/1‑150 (MQ=255) cctatgcccaggccgtcaacgactacgtcgcgcagggccgtgcgcacggctgggacaacctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgccTGGc < 2:56172‑M1/4‑1 (MQ=255) cctatgcccaggccgtcaacgactacgtcgcgcagggccgtgcgcacggctgggacaacctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgccTGGc > 1:56172‑M1/105‑108 (MQ=255) cTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCgg > 2:242837/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGctc > 1:335858/1‑150 (MQ=255) gAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTc > 1:165995/1‑150 (MQ=255) gtcgcgcagggccgtgcgcacggctgggacaacctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgccTGGCTGCCTGCAGGGCTGACa > 2:217171‑M1/79‑99 (MQ=255) gtcgcgcagggccgtgcgcacggctgggacaacctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgccTGGCTGCCTGCAGGGCTGACa < 1:217171‑M1/21‑1 (MQ=255) cGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGtt > 2:819470/1‑150 (MQ=255) ggtggtGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGt > 2:586696/1‑150 (MQ=255) acggctgggacaacctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgccTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCa > 1:456028‑M1/60‑84 (MQ=255) acggctgggacaacctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgccTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCa < 2:456028‑M1/25‑1 (MQ=255) gCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGGCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACgg < 2:25415/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGctg < 2:317194/150‑3 (MQ=255) gCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGt < 2:360538/104‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGt > 1:360538/1‑104 (MQ=255) gCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGc < 2:125186/106‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGc > 1:125186/1‑106 (MQ=255) ccAGGCATTCCGCAAGGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAgg > 1:652194/1‑121 (MQ=255) ccAGGCATTCCGCAAGGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAgg < 2:652194/121‑1 (MQ=255) ggCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGAc < 2:130990/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGAc < 2:702926/150‑1 (MQ=255) ctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgccTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCa > 1:373916‑M1/46‑70 (MQ=255) ctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgccTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCa < 2:373916‑M1/25‑1 (MQ=255) ttGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCCGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAg > 1:114122/1‑150 (MQ=255) gCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACgg > 2:98730/1‑133 (MQ=255) gCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACgg < 1:98730/133‑1 (MQ=255) gCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTc < 1:242837/150‑1 (MQ=255) ggAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGACGTGCCAACGGCCATGCGCGACGTAGTCGt < 2:480692/150‑1 (MQ=255) gAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGtt < 2:114122/150‑1 (MQ=255) tgTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAg < 1:586696/150‑1 (MQ=255) gACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGAc > 1:159012/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGAct < 2:382148/150‑1 (MQ=255) cAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGActgcct < 1:765818/150‑1 (MQ=255) gACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGAc < 2:318863/121‑1 (MQ=255) gACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGAc > 1:318863/1‑121 (MQ=255) ggTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGACTGCCTGCTGcc < 2:159012/150‑1 (MQ=255) | ATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGACTGCCTGCTGCC > NC_002947/2775196‑2775490 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |