New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2807755 | 21 (0.660) | 4 (0.130) | 4/238 | NT | 14.8% | coding (68/213 nt) | PP_2461 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2807768 | 26 (0.860) | coding (55/213 nt) | PP_2461 | hypothetical protein |
CTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAAGGAGGAACACCTGACCCTGGTGTTCGATGGAGGCGGGATGCGCTCCACTTC > NC_002947/2807606‑2807903 | cTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCCCCAACCCTGGGGGTGTGTCAG > 2:22076‑M1/1‑150 (MQ=255) gCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAggg > 1:279413/1‑150 (MQ=255) gCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAggg < 1:688102/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTg > 1:238533/1‑150 (MQ=255) aGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGt > 2:117978/1‑150 (MQ=255) ttGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCgg < 2:738329/150‑1 (MQ=255) ttGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCgg < 2:573005/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCGTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGAc < 1:750309/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGAc < 1:547994/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGGGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTg < 2:602072/150‑1 (MQ=255) tAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCa < 2:591319/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGATTTATTGCGATCAGAAACAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATc < 1:278080/150‑1 (MQ=255) cTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGAt < 1:241793/150‑1 (MQ=255) gAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCt < 2:279413/150‑1 (MQ=255) acCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTgg < 2:238533/150‑1 (MQ=255) gccTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGagcgcgtacagccctgg < 1:746388‑M1/84‑18 (MQ=255) gccTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGagcgcgtacagccctgg > 2:746388‑M1/1‑67 (MQ=255) gccTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAg < 1:693589/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACg < 2:544570/150‑1 (MQ=255) tCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAag > 1:388087/1‑150 (MQ=255) cggaCCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTCAGTCGGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAaggag < 1:225505/147‑1 (MQ=255) cgcACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAaggag < 2:713499/150‑1 (MQ=255) cAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGagcgcgtacagccctg > 2:170816‑M1/1‑44 (MQ=255) cAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGagcgcgtacagccctg < 1:170816‑M1/60‑17 (MQ=255) cGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAAGGAGGAACACCTGAccc > 2:123982/1‑150 (MQ=255) aTGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAAGGAGGAACACCTGACCCTg < 1:330814/150‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAAGGAGGAACACCTGACCCTGGTGTTc < 1:117978/150‑1 (MQ=255) gcaACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAAGGAGGAACACCTGACCCTGGTGTTCGATGGAg > 1:665719/1‑150 (MQ=255) gcaACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAAGGAGGAACACCTGACCCTGGTGTTCGATGGAg > 2:621676/1‑150 (MQ=255) gCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGaa > 2:267066/1‑102 (MQ=255) gCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGaa < 1:267066/102‑1 (MQ=255) ccAGGGCTGTACGCGCTctggcacaccggaagagttgctgctgatcgccatcgacctgttggtgcgcgacaacggtgccgaggc < 1:746388‑M2/84‑68 (MQ=255) ccAGGGCTGTACGCGCTctggcacaccggaagagttgctgctgatcgccatcgacctgttggtgcgcgacaacggtgccgaggc > 2:746388‑M2/1‑17 (MQ=255) ccAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAAGGAGGAACACCTGACCCTGgt > 2:102456/1‑122 (MQ=255) ccAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGAGGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAAGGAGGAACACCTGACCCTGgt < 1:102456/122‑1 (MQ=255) cAGGGCTGTACGCGCTctggcacaccggaagagttgctgctgatcgccatcgacctgttg > 2:170816‑M2/1‑16 (MQ=255) cAGGGCTGTACGCGCTctggcacaccggaagagttgctgctgatcgccatcgacctgttg < 1:170816‑M2/60‑45 (MQ=255) aGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACCAAGGAGGAACACCTGACCCTGGTGTTCGATGGAGGCGGGATGCGCTCCActtc < 1:22076/150‑1 (MQ=255) | CTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCTGTACGCGCTCTGGCCCTCGGCCCATTTGACCTTGATGTCGGCATCGATGCTGTGGGTGCTCATGAAAAGCTCTCGCTAGGGGCCCGGAACGAAGGAGGAACACCTGACCCTGGTGTTCGATGGAGGCGGGATGCGCTCCACTTC > NC_002947/2807606‑2807903 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |