New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3018222 | 35 (1.110) | 4 (0.140) | 3/232 | NT | 11.8% | coding (2102/2283 nt) | bcsB | cellulose synthase and translocator subunit |
? | NC_002947 | = 3018262 | 27 (0.910) | coding (2142/2283 nt) | bcsB | cellulose synthase and translocator subunit |
GAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCGGGCACTGCGCT > NC_002947/3018083‑3018368 | gAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGc > 2:329103/1‑150 (MQ=255) gcagcGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGGAGCCAGTTCGTCGGCGa > 2:505586/1‑150 (MQ=255) tgtgGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGt < 1:329103/150‑1 (MQ=255) gtgGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTg < 1:191382/150‑1 (MQ=255) tgGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTgg > 2:308532/1‑150 (MQ=255) tctccTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACAGACCAGTGGGGTGGGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTgg < 1:787409/147‑1 (MQ=255) cTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTgggaga > 2:787409/1‑147 (MQ=255) ttGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGgcgcg > 1:396499/1‑150 (MQ=255) tGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGc > 2:555749/1‑150 (MQ=255) gcgacagcgaTTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGtggc > 1:555749‑M2/1‑146 (MQ=255) gacagcgaTTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAccatggcagcgcgcccacgaagtagtgctcgccgacgaactggctg < 1:302551‑M1/150‑47 (MQ=255) gacagcgaTTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTAAGCATCCAcgatagcagcgcgcccacgaagtagtgctcgccgacgaactggctg < 1:16577‑M1/150‑47 (MQ=255) cgaTTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGgctgctgct < 1:308532/150‑1 (MQ=255) aTTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCtgt < 1:724449/150‑1 (MQ=255) aTTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCa > 1:705058/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCATGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCa > 1:271873/1‑150 (MQ=255) ggctgcGCGACATGCTTGTCGATGTAGGCAATCTCGATGCGGTTGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCTTTGGGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACt < 2:119512/149‑1 (MQ=255) tgcGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGt > 2:70298/1‑150 (MQ=255) tgcGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCCAAGTGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGt > 1:708041/1‑150 (MQ=255) gACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGt > 1:171420/1‑136 (MQ=255) gACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGt < 2:171420/136‑1 (MQ=255) ggCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTtcgtc < 2:557518/78‑1 (MQ=255) ggCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTtcgtc > 1:557518/1‑78 (MQ=255) tGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCt > 2:464675/1‑150 (MQ=255) aaGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCt < 1:155101/135‑1 (MQ=255) aaGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCt > 2:155101/1‑135 (MQ=255) aGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCATGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGa < 2:271873/150‑1 (MQ=255) cTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGa > 1:215479/1‑68 (MQ=255) cTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGa < 2:215479/68‑1 (MQ=255) gCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGCCt < 2:362047/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGt > 1:381176/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGttt < 2:359070/150‑1 (MQ=255) gggTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCgt < 2:396499/150‑1 (MQ=255) gTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAccatggcagcgcgcccacgaagtagtgctcgccgacgaactg > 1:210115‑M1/1‑35 (MQ=255) gTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAccatggcagcgcgcccacgaagtagtgctcgccgacgaactg < 2:210115‑M1/77‑43 (MQ=255) gTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCgg > 2:4663/1‑124 (MQ=255) gTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCgg < 1:4663/124‑1 (MQ=255) gCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGc > 1:704154/1‑150 (MQ=255) tGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGGTCGCct > 1:668797/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCg < 1:505586/150‑1 (MQ=255) cagcCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCTATCGtggatgcttacgccactgctgcgtaacagcgttaccgaacccgccaccgcatcgagcttgcctacatcgccaagcatgtcgcgcagcaatgcgtaatcgctgtc < 1:16577‑M2/150‑105 (MQ=255) cagcCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGtggctgctcacgccactgctgcgtaacagcgttaccgaacccgccaccgcatcgagcttgcctacatcgccaagcatgtcgcgcagcaatgcgtaatcgctgtc < 1:302551‑M2/150‑105 (MQ=255) gcCAccatggcagcgcgcccacgaagtagtgctcgccgacgaactggctgctcacgccactgctgcgtaacagcgttaccgaacccgccaccgcatcgagcttgcctacatcgccaagcatgtcgcgcagcaatgcgtaatcgctgtcgc > 1:555749‑M1/1‑4 (MQ=255) cAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGtggctgctcacgccactgctgcgtaacagcgttac < 2:210115‑M2/77‑36 (MQ=255) cAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGtggctgctcacgccactgctgcgtaacagcgttac > 1:210115‑M2/1‑42 (MQ=255) | GAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCGGGCACTGCGCT > NC_002947/3018083‑3018368 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |