| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5395374 | 32 (1.010) | 3 (0.100) | 3/228 | NT | 8.8% | coding (2268/2364 nt) | hsdR | type I restriction modification system endonuclease |
| ? | NC_002947 | = 5395392 | 33 (1.130) | coding (2286/2364 nt) | hsdR | type I restriction modification system endonuclease | |||||
AGTGAAAAAGCGTAACTACTTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCA > NC_002947/5395236‑5395520 | aGTGAAAAAGCGTAACTACTTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACCTCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCAcc < 2:631927/150‑1 (MQ=255) cgcaaCTACTTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCATCTGCTGGAAGCACTGCTGGATAAATACGCCGACACCCGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTg < 2:307822/147‑1 (MQ=255) gTAACTACTTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAActgg < 2:683154‑M2/150‑5 (MQ=255) aaTACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGTTCGATGGGTGCACCGAGctggttaaagggatcgagc > 2:369609‑M2/1‑131 (MQ=255) ggTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCt < 1:628143/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAActggttaaa > 1:111148‑M2/1‑122 (MQ=255) gTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAActggttaaa < 2:111148‑M2/131‑10 (MQ=255) gTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGACAAAGCTg > 1:752895/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGACAAAGCTgg < 2:752895/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGc < 2:623989/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGc < 2:284369/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTggcgg > 2:452789/1‑137 (MQ=255) gcgcgcCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTggcgg < 1:452789/137‑1 (MQ=255) cgcgcCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTaca > 1:732132/1‑150 (MQ=255) cgcCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTacaac < 2:844649/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGttcgatgggtgcaccgagctggttaaaggga > 2:712027‑M1/1‑93 (MQ=255) cAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGttcgatgggtgcaccgagctggttaaaggga < 1:712027‑M1/124‑32 (MQ=255) cAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACaaa > 2:118397/1‑150 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCAt < 2:708722/150‑1 (MQ=255) gAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCAt < 1:779854/150‑1 (MQ=255) ggATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCGGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGa > 2:337739/1‑150 (MQ=255) acacCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCa < 1:339904/150‑1 (MQ=255) acacCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCa < 2:744161/150‑1 (MQ=255) acacCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCa < 2:247610/150‑1 (MQ=255) cGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTa > 2:736365/1‑150 (MQ=255) cGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTa > 2:149747/1‑150 (MQ=255) aGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGctc > 1:771755/1‑150 (MQ=255) acaTCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGtt > 2:292783/1‑138 (MQ=255) acaTCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGtt < 1:292783/138‑1 (MQ=255) aGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTtg < 1:118397/150‑1 (MQ=255) aTCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTtgggtg < 1:371050/149‑1 (MQ=255) aTCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTtgggtg > 2:371050/1‑149 (MQ=255) cctccAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAAcggc < 1:736365/150‑1 (MQ=255) gCTCGATCCCTTTAACCAGctcggtgcacccatcgaactggttaaagggatcgagctggaggattttgatgtcctcgatgtgctcaatgccggtgtcggcgtatttatccagcagcgcttccagcacctggcgcgctgcaccggagtatt > 2:369609‑M1/1‑19 (MQ=255) gCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGcc < 2:732132/150‑1 (MQ=255) tCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCtt < 1:683154/150‑1 (MQ=255) gATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGt < 1:337739/150‑1 (MQ=255) tCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAActggttaaagggatcgagctggaggattttgatgtcctcgatgtgctcaatgccggtgtcggcgtatttatccagcagcgcttccagcacctg < 1:712027‑M2/124‑94 (MQ=255) tCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAActggttaaagggatcgagctggaggattttgatgtcctcgatgtgctcaatgccggtgtcggcgtatttatccagcagcgcttccagcacctg > 2:712027‑M2/1‑31 (MQ=255) tCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTcc > 1:129770/1‑150 (MQ=255) cTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCAcc > 1:807744/1‑150 (MQ=255) tttAACCAGttcgatgggtgcaccgagctggttaaagggatcgagctggaggattttgatgtcctcgatgtgctcaatgccggtgtcggcgtatttatccagcagcgcttccagcacctggcgcgctgcac < 2:111148‑M1/131‑123 (MQ=255) tttAACCAGttcgatgggtgcaccgagctggttaaagggatcgagctggaggattttgatgtcctcgatgtgctcaatgccggtgtcggcgtatttatccagcagcgcttccagcacctggcgcgctgcac > 1:111148‑M1/1‑9 (MQ=255) aCCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAagc > 1:570162/1‑150 (MQ=255) ccAGttcgatgggtgcaccgagctggttaaagggatcgagctggaggattttgatgtcctcgatgtgctcaatgccggtgtcggcgtatttatccagcagcgcttccagcacctggcgcgctgcaccggagtatttggcgaagtagttac < 2:683154‑M1/150‑147 (MQ=255) | AGTGAAAAAGCGTAACTACTTCGCCAAATACTCCGGTGCAGCGCGCCAGGTGCTGGAAGCGCTGCTGGATAAATACGCCGACACCGGCATTGAGCACATCGAGGACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCCTTGTCCACCTAAGCA > NC_002947/5395236‑5395520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |