New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5696404 | 26 (0.820) | 3 (0.100) | 3/238 | NT | 9.7% | coding (1072/1272 nt) | pyrC' | dihydroorotase‑like protein |
? | NC_002947 | = 5696426 | 31 (1.020) | coding (1094/1272 nt) | pyrC' | dihydroorotase‑like protein |
AGCCGCACGAGCGCGACGCCAAGCTGGCCCCGTTCGGCGCCACCGAGCCGGGTATCAGCAGCGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCA > NC_002947/5696255‑5696536 | aGCCGCACGAGCGCGACGCCAAGCTGGCCCCGTTCGGCGCCACCGAGCCGGGTATCAGCAGCGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CC > 1:722480‑M1/1‑150 (MQ=255) gACGCCAAGCTGGCCCCGTTCGGCGCCACCGAGCCGGGTATCAGCAGCGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTg > 2:750136/1‑150 (MQ=255) ccGTTCGGCGCCACCGAGCCGGGTATCAGCAGCGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGCCCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGt < 2:722480/150‑1 (MQ=255) gcCACCGAGCCGGGTATCAGCAGCGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGaaa < 1:30262/150‑1 (MQ=255) ccACCGAGCCGGGTATCAGCAGCGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CC‑GGCAGGCGCAGGGCGGCAGCCgggccgctgctcaggcgg > 1:448759‑M2/1‑132 (MQ=255) aCCGAGCCGGGTATCAGCAGCGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCATGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAgtg > 1:6393/1‑150 (MQ=255) aCCGAGCCGGGTATCAGCAGCGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAgtg > 2:318523/1‑150 (MQ=255) gAGCCGGGTATCAGCAGCGTCGCGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCACGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTAAGCAGGGT‑CCCGGCTTCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAgtgggt < 1:657398/150‑1 (MQ=255) cagcagCGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCCGGGGTGCCGGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGa > 1:743480/1‑150 (MQ=255) gcagcGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGAcc < 2:453546/150‑1 (MQ=255) ctgcCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCg > 1:757894/1‑150 (MQ=255) ccACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCaa < 1:66563/150‑1 (MQ=255) cATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGCCCTAGCTGGCCCGCCTGAGCCGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGCCCTGGTGCTGTTCGACCCGCCAGCGTcctg > 2:308613/1‑148 (MQ=255) cATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCAc > 2:462575/1‑150 (MQ=255) aCCCTGGTGCATGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGtt < 2:6393/150‑1 (MQ=255) cccTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGTTg > 2:536538/1‑150 (MQ=255) cccTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGTTg > 2:752272/1‑150 (MQ=255) gTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGa < 1:595967/91‑1 (MQ=255) gTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGa > 2:595967/1‑91 (MQ=255) aCGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCggcaggcgcagggcggcagccgggc > 2:155453‑M1/1‑48 (MQ=255) aCGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCggcaggcgcagggcggcagccgggc < 1:155453‑M1/73‑26 (MQ=255) cGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATg < 1:318523/150‑1 (MQ=255) ccTTCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGtt > 1:248104/1‑150 (MQ=255) gACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTtctcgcca > 1:404218/1‑146 (MQ=255) aCCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTcc > 2:447595/1‑146 (MQ=255) aCCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTcc < 1:447595/146‑1 (MQ=255) cTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCAGTGAg < 1:660643/66‑1 (MQ=255) cTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCAGTGAg > 2:660643/1‑66 (MQ=255) gACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCAACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGaa > 1:503413/1‑150 (MQ=255) gCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTc > 1:434702/1‑150 (MQ=255) ccGCCTGAGCAGCGGCCCggctgccgccctgcgcctgccggccgctgctcaggcgggccagcaaggtcggcaggtcgagcaggccgtcctgcaccagggtcatggccagtggcagcagcaactcgacgctgctgatacccggctcggtgg > 1:448759‑M1/1‑18 (MQ=255) g‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCggccgctgctcaggcgggccagcaaggtcggcaggtcgagcaggccgt > 2:155453‑M2/1‑25 (MQ=255) g‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCggccgctgctcaggcgggccagcaaggtcggcaggtcgagcaggccgt < 1:155453‑M2/73‑49 (MQ=255) | AGCCGCACGAGCGCGACGCCAAGCTGGCCCCGTTCGGCGCCACCGAGCCGGGTATCAGCAGCGTCGAGTTGCTGCTGCCACTGGCCATGACCCTGGTGCAGGACGGCCTGCTCGACCTGCCGACCTTGCTGGCCCGCCTGAGCAGCGG‑CCCGGCTGCCGCCCTGCGCCTGCCGGCCGGTGAGCTGAAAGTGGGTGGCGCGGCCGACCTGGTGCTGTTCGACCCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCA > NC_002947/5696255‑5696536 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |