New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1026146 | 45 (1.420) | 7 (0.230) | 6/242 | NT | 14.0% | coding (825/1593 nt) | dppA‑II | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 1026163 | 42 (1.360) | coding (808/1593 nt) | dppA‑II | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
GGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGATCGAGAACACCAGGTTGTCGATCTTCACCTCGTTCGCTGCCCAATAGTCCTTGTTGCC > NC_002947/1026016‑1026304 | ggATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGca > 1:777379‑M2/1‑148 (MQ=255) cTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCgg > 2:309026/1‑150 (MQ=255) tgttgACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGc < 2:326011/150‑1 (MQ=255) gttgACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCg > 2:677350/1‑150 (MQ=255) tgACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGACGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTg < 1:513076/150‑1 (MQ=255) cGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGATGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGCCGGCGCTCAAG‑GCCGAcagcacgctgcaggtgctcca > 2:484117‑M2/1‑129 (MQ=255) ccATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCa < 1:677350/150‑1 (MQ=255) tCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTc < 2:452035/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGCCGGCCGGGCGTGGGCGCAgggccccc > 2:825810/1‑145 (MQ=255) ttGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCt < 2:756284/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCt > 1:756284/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTCGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGc > 1:575476/1‑150 (MQ=255) tGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGcat > 2:227605/1‑150 (MQ=255) aCTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTg < 2:575476/150‑1 (MQ=255) ggTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCt > 2:48362/1‑150 (MQ=255) ggTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCt > 1:829527/1‑150 (MQ=255) gTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCtt > 2:474688/1‑150 (MQ=255) tCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGTAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTc < 1:346784/150‑1 (MQ=255) gAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTg < 2:614864/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGCTGGGTGTGGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCCTTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATAc < 1:825810/150‑1 (MQ=255) gggTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGc < 1:474688/150‑1 (MQ=255) tGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGACACTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCAcc > 2:391666/1‑150 (MQ=255) aGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACACACCGACGGGTCGGTAt < 2:829527/150‑1 (MQ=255) gATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGAt < 1:491367/150‑1 (MQ=255) gATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGAt > 2:83183/1‑150 (MQ=255) gTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGATCga < 1:114260/150‑1 (MQ=255) ccGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGAATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGt < 1:93151/137‑1 (MQ=255) ccGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGAATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGt > 2:93151/1‑137 (MQ=255) ttGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGATCGAGAACACCAgg < 1:83183/150‑1 (MQ=255) gAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCAcc < 2:563571/82‑1 (MQ=255) gAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCAcc > 1:563571/1‑82 (MQ=255) gAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGAGTGCTGTCGGC‑GTTGAGCGCTGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGGCAGCTGGAATTCAGTGCGGCGGAGCTTCTGGGTACGTACGGACGGGTCGGTATTGATCGAGAACACCCGGtt > 2:242041/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGTCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGATCGAGAACACCAGGTTGTCGa < 1:697380/150‑1 (MQ=255) tGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGc > 1:601187/1‑54 (MQ=255) tGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGc < 2:601187/54‑1 (MQ=255) gTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGA‑ATTGAGCGCCGGCCAGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGATGACCAGGCATTCAGTGCGGTTGAGCGTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGATCGAGAACACCAGGTTGTCGATCt > 2:313281/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGATCGAGAACACCAGGTTGTCGATCtt > 2:261526/1‑150 (MQ=255) cTGGAGCACCTGCCGCGTGGTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGTTGCCGGGTCACCTGGCATTCATTGTAGCGCAGCTTCTTGATTCGCGCCCACGCGTCCGTATTGATCGAGAACACCAGGTTGTCGATCTTCAc < 2:248874/150‑1 (MQ=255) gCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCAc > 1:793109/1‑100 (MQ=255) gCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCAc < 2:793109/100‑1 (MQ=255) cTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGt > 1:810665/1‑104 (MQ=255) cTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGt < 2:810665/104‑1 (MQ=255) tGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGATCGAGAACACCAGGTTGTCGATCTTCACCTCGTTCGCt < 1:309026/150‑1 (MQ=255) tGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGcagcacgctgcaggtgctccagcaaccaggcttcaacctcggctacatcgcctacaacacccagcacccgccattcgacc < 2:11759‑M2/99‑81 (MQ=255) tGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGcagcacgctgcaggtgctccagcaaccaggcttcaacctcggctacatcgcctacaacacccagcacccgccattcgacc > 1:11759‑M2/1‑19 (MQ=255) tGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGcagcacgctgcaggtgctccagcaaccaggcttcaac > 2:676417‑M2/1‑19 (MQ=255) tGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGcagcacgctgcaggtgctccagcaaccaggcttcaac < 1:676417‑M2/56‑38 (MQ=255) tCGGC‑CTTGAGCGCCGGcagcacgctgcaggtgctccagcaaccaggcttcaacctcggctacatcgcctacaacacccagcacccgccattcgaccgcctggaagtgcgccaggcaatggacatggcggtcaacaaggaagcc > 1:765146‑M2/1‑17 (MQ=255) tCGGC‑CTTGAGCGCCGGcagcacgctgcaggtgctccagcaaccaggcttcaacctcggctacatcgcctacaacacccagcacccgccattcgaccgcctggaagtgcgccaggcaatggacatggcggtcaacaaggaagcc < 2:765146‑M2/144‑128 (MQ=255) gAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGATCGAGAACACCAGGTTGTCGATCTTCACCTCGTTCGCTGCCCAATAGTCCTTGTTGcc < 1:48362/150‑1 (MQ=255) | GGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCCTGGTTGCTGGAGCACCTGCAGCGTGCTGTCGGC‑CTTGAGCGCCGGCAGGTCGGCCGGGCGTGGGTGCAGGGTCACCTGGCATTCATTGCGGCGCAGCTTCTGGATACGCACCGACGGGTCGGTATTGATCGAGAACACCAGGTTGTCGATCTTCACCTCGTTCGCTGCCCAATAGTCCTTGTTGCC > NC_002947/1026016‑1026304 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |