New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2876327 = | 39 (1.230) | 4 (0.130) | 4/236 | NT | 11.1% | coding (77/258 nt) | PP_2530 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2876371 = | 27 (0.900) | coding (33/258 nt) | PP_2530 | hypothetical protein |
CATGCCGCCGGGAGGTGGCGGTGGTCATGGTGGGGGTGGCCACGGCGGTGGTTTTGGTGGCCATCAGGGTGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAGGCGAGCGCACTCTGTTCGCCACCCCAAACGGTACATG > NC_002947/2876223‑2876520 | ccgacgtgaagcaggatcaactgccgatcagcgcatcatcctgcatgccctaaggcgcaaacaccggcgctgtgccacgcgcggttcgggcgaccaatgtgcatGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCAt > 2:602173‑M1/105‑150 (MQ=255) ccgGGAGGTGGCGGTGGTCATGGTGGGGGTGGCCACGGCGGTGGTTTTGGTGGCCATCAGGGTGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACAtt < 1:471011/150‑1 (MQ=255) aTGGTGGGGGTGGCCACGGCGGTGGTTTTGGTGGCCATCAGGGTGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGt > 1:25584/1‑150 (MQ=255) ggtggGGGTGGCCACGGCGGTGGTTTTGGTGGCCATCAGGGTGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTgg > 1:133077/1‑150 (MQ=255) cggTGGTTTTGGTGGCCATCAGGGTGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTg < 1:175999/150‑1 (MQ=255) tggtTTTGGTGGCCATCAGGGTGGCGGCCCGCGCTACGGTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTgcgc < 1:45731/150‑1 (MQ=255) ttttGGTGGCCATCAGGGTGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCtt > 1:236132/1‑150 (MQ=255) tggCCATCAGGGTGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCa > 1:415414/1‑150 (MQ=255) ggCCATCAGGGTGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCAt > 1:772994/1‑150 (MQ=255) aaacaccggcgctgtgccacgcgcggttcgggcgaccaatgtgcatGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGca < 2:690099‑M1/49‑1 (MQ=255) aaacaccggcgctgtgccacgcgcggttcgggcgaccaatgtgcatGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGca > 1:690099‑M1/47‑95 (MQ=255) tGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGgt > 1:163855/1‑121 (MQ=255) tGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGgt < 2:163855/121‑1 (MQ=255) tGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGatgatg < 2:236132/150‑1 (MQ=255) ggcCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCa < 1:414570/76‑1 (MQ=255) ggcCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCa > 2:414570/1‑76 (MQ=255) cgcTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGatgatg < 1:825989/140‑1 (MQ=255) cgcTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGatgatg > 2:825989/1‑140 (MQ=255) aGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGtt < 2:509321/150‑1 (MQ=255) gACCCCTCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTCGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTTTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATc < 2:420992/150‑1 (MQ=255) aCCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGca < 1:325847/64‑1 (MQ=255) aCCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGca > 2:325847/1‑64 (MQ=255) cccGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCCTGCAGCCTGATGCGCTGATCCGCAGTTGATCCTg > 2:67168/1‑150 (MQ=255) ccGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGc < 1:67168/150‑1 (MQ=255) gcgATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCtt < 2:133077/150‑1 (MQ=255) tgcatgcgcccgtgccgggtacgcgcttgcaacccggccgagagggcgcATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGttt < 2:690099‑M2/46‑1 (MQ=255) tgcatgcgcccgtgccgggtacgcgcttgcaacccggccgagagggcgcATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGttt > 1:690099‑M2/50‑95 (MQ=255) atgcgcccgtgccgggtacgcgcttgcaacccggccgagagggcgcATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCgg > 2:602173‑M2/47‑150 (MQ=255) gcgcccgtgccgggtacgcgcttgcaacccggccgagagggcgcATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGt < 1:602173‑M2/106‑1 (MQ=255) CTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTg < 1:63415‑M1/150‑1 (MQ=255) tctcGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGa > 1:295831/1‑150 (MQ=255) ctcGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAg < 2:415414/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGAACGCGCGCATGTACATTTGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAGGCGa < 1:695864/150‑1 (MQ=255) cGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAGGCGAgc < 2:63415/150‑1 (MQ=255) aaGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAGGCGAGCGCACTCTg > 2:420869/1‑150 (MQ=255) aaGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAGGCGAGCGCACTCTg > 1:528201/1‑150 (MQ=255) cgcgTAGCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAGGCGAGCGCACTCTGTTc < 2:231166/150‑1 (MQ=255) aCCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAGGCGAGCGCACTCTGTTCGCCAc > 1:452245/1‑150 (MQ=255) ccGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAGGCGAGCGCACTCTGTTCGCCAccc > 2:74656/1‑150 (MQ=255) gcgcATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGc < 1:722301‑M2/108‑1 (MQ=255) gcgcATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGc > 2:722301‑M2/5‑112 (MQ=255) aTGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAGGCGAGCGCACTCTGTTCGCCACCCCAAACGGTACATg > 2:794667/1‑150 (MQ=255) | CATGCCGCCGGGAGGTGGCGGTGGTCATGGTGGGGGTGGCCACGGCGGTGGTTTTGGTGGCCATCAGGGTGGCGGCCCGCGCTAAGCTGACCCCGCGATGGACCGCGCCCTCTCGGCCGGGTTGCAAGCGCGTACCCGGCACGGGCGCATGCACATTGGTCGCCCGAACCGCGCGTGGCACAGCGCCGGTGTTTGCGCCTTAGGGCATGCAGGATGATGCGCTGATCGGCAGTTGATCCTGCTTCACGTCGGGTGCCTGAGGCGAGCGCACTCTGTTCGCCACCCCAAACGGTACATG > NC_002947/2876223‑2876520 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |