| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5302372 = | 54 (1.710) | 4 (0.130) | 4/240 | NT | 6.9% | coding (1449/3675 nt) | recB | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| ? | NC_002947 | 5302407 = | 55 (1.790) | coding (1414/3675 nt) | recB | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease | |||||
CCAGCATTGCAGGGCTGCACTGACTTCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGCACCACGAAAGGCGTAGATCGCCTGCTTGGGG > NC_002947/5302258‑5302552 | ccgacatctacacctacctagccgcgcgacgcgctaccagcggccgcctgcacagcctggacaccaactaccgctccagcaaagccatggtggcggcggtcaatcaggtgttccTGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAg > 2:327410‑M1/115‑150 (MQ=255) aGCATTGCAGGGCTGCACTGACTTCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGa > 1:606998/1‑150 (MQ=255) aGCATTGCAGGGCTGCACTGACTTCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGa > 2:238774/1‑150 (MQ=255) aGGGCTGCACTGACTTCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGa < 2:482971/150‑1 (MQ=255) aGGGCTGCACTGACTTCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGa < 2:204760/150‑1 (MQ=255) ggCTGCACTGACTTCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGCGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGAtt < 1:57804/150‑1 (MQ=255) aCTGACTTCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGACAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGAccgc > 2:198133/1‑150 (MQ=255) tGACTTCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTCGCGAGCTCCATGATGAATGGCATCGGGTTGGGATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGAccgccg > 1:16292/1‑150 (MQ=255) tGACTTCACCGTCAATCAGCAGCTATTCGGAAAACCCTTTAGGGCGCACCTCTATGAATGGCAGCGGGTTTGCATCGGCCTTGCGGTACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAAAAACTGATTGAccgccg > 1:488398/1‑150 (MQ=255) aCTTCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGCTTGACCgccgcc > 2:305995/1‑150 (MQ=255) ttCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGccac > 1:180102/1‑150 (MQ=255) cGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATgg > 2:14355/1‑150 (MQ=255) cGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATgg < 2:85255/150‑1 (MQ=255) cAATCAGCAGCTGTTCGCCTCGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACAACTGATTGACCGCCGCCACCATGGCtt < 1:840418/150‑1 (MQ=255) aaTCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCttt < 2:243897/150‑1 (MQ=255) aaTCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCttt > 1:532105/1‑150 (MQ=255) tCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTgt < 1:670438/150‑2 (MQ=255) cagcTCTTTGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGa < 1:464346/150‑1 (MQ=255) gcTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGc < 1:90857/150‑1 (MQ=255) tGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCgg < 2:180102/150‑1 (MQ=255) ccACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGAccgcc < 1:431566/120‑1 (MQ=255) ccACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGAccgcc > 2:431566/1‑120 (MQ=255) ccACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGACTCGAGGAACAGCAATGCACCCCGCCCCGATTCAACCGCGTCGGTCTCCATGATGACGTGATTGACGGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTg < 1:16415/150‑1 (MQ=255) cccTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCTCGGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTcc > 1:451398/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAg < 1:708863/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGACTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAgg > 2:726796/1‑150 (MQ=255) cgcgcACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCtgt < 2:464389/150‑1 (MQ=255) cgcgcACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCtgt < 2:488398/150‑1 (MQ=255) gcgcACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCtgtg > 2:594474/1‑150 (MQ=255) cACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAg < 1:14355/150‑1 (MQ=255) cTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGAcc < 2:318173/97‑1 (MQ=255) cTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGAcc > 1:318173/1‑97 (MQ=255) tGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGACTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGc < 1:726796/150‑1 (MQ=255) aTGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTgg < 2:764643/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGt > 1:105822/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGa < 2:470689/67‑1 (MQ=255) aTCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGa > 1:470689/1‑67 (MQ=255) ggCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCtag < 1:198133/150‑1 (MQ=255) ggCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCtag > 1:655749/1‑150 (MQ=255) ccTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCtaggt < 2:105822/150‑1 (MQ=255) cTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCtaggta > 1:459636/1‑150 (MQ=255) cTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCACGCTCGTCAGGCTGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCtaggta > 1:262231/1‑150 (MQ=255) gcgGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAAGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTaggtaggt > 1:722231/1‑150 (MQ=255) aGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATg > 2:107343/1‑150 (MQ=255) gAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCa < 1:562195/95‑1 (MQ=255) gAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCa > 2:562195/1‑95 (MQ=255) ctgcaggccgaggcgcgtgaagcggggcggggtgcaGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCgg > 2:327410‑M2/37‑150 (MQ=255) aTGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCgg < 1:107343/150‑1 (MQ=255) tgcaggccgaggcgcgtgaagcggggcggggtgcaGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTa > 1:566493‑M2/36‑141 (MQ=255) tgcaggccgaggcgcgtgaagcggggcggggtgcaGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTa < 2:566493‑M2/106‑1 (MQ=255) cccgccccgcTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCa > 1:350609/1‑87 (MQ=255) cccgccccgcTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCa < 2:350609/87‑1 (MQ=255) cccgccccgcTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAg > 2:92439/1‑88 (MQ=255) cccgccccgcTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAg < 1:92439/88‑1 (MQ=255) cccgccccgcTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGcagcac > 2:138885/1‑150 (MQ=255) cccgccccgcTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGcaccac > 1:848974/1‑150 (MQ=255) gccccgcTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGCACCACGaa < 2:532105/150‑1 (MQ=255) ccccgcTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGCACCACGaaa < 1:714086/150‑1 (MQ=255) ttCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGCACCACGAAAGGCGTa < 1:594474/150‑1 (MQ=255) gtgaagcggggcggggtgcaGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGCACCACGAAAGGCGTa < 1:327410‑M2/130‑1 (MQ=255) cgcCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGCACCACGAAAGGCGTAGATCGc < 2:16292/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGCACCACGAAAGGCGTAGATCGCCTGc > 1:749233/1‑150 (MQ=255) tgcaGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGCACCTCGAAAGGCGTAGATCGCCTGCTTgggg < 2:459636‑M2/146‑1 (MQ=255) | CCAGCATTGCAGGGCTGCACTGACTTCACCGTCAATCAGCAGCTGTTCGCCACGCCCCTTGGCGCGCACCTCGATGAATGGCAGCGGGTTGTCATCGGCCTCGCGGAACAGGAATGCACCCCGCCCCGCTTCACGCGCCTCGGCCTGCAGGAACACCTGATTGACCGCCGCCACCATGGCTTTGCTGGAGCGGTAGTTGGTGTCCAGGCTGTGCAGGCGGCCGCTGGTAGCGCGTCGCGCGGCTAGGTAGGTGTAGATGTCGGCACCACGAAAGGCGTAGATCGCCTGCTTGGGG > NC_002947/5302258‑5302552 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |