New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1798193 = | 47 (1.080) | 14 (0.330) | 12/260 | 2.7 | 23.1% | coding (74/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase |
? | NC_002947 | 1798250 = | 47 (1.090) | coding (131/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase |
GCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATCGG > NC_002947/1798102‑1798397 | ttgagcagttcgcgcaggcgccccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgccggccctcggcctCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAg > 1:902922‑M1/92‑150 (MQ=255) gcgGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGCAGCATGTGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCACGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAg < 1:57422/150‑1 (MQ=255) ggCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGc > 1:656829/1‑150 (MQ=255) gcagttcgcgcaggcgccccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctCCATCAAGGGGCCGCCCACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGc < 2:229029‑M1/63‑1 (MQ=255) tCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTAACCCAGC‑GAG‑TGCGAGAGCATG‑GTGTCATTGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAg > 1:521662/1‑150 (MQ=255) ttcgcgcaggcgccccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGa < 1:793056‑M1/58‑1 (MQ=255) ttcgcgcaggcgccccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGa > 2:793056‑M1/84‑141 (MQ=255) tcgcgcaggcgccccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctCCATCAAGGGGCCGCCCACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAgg > 1:229029‑M1/83‑150 (MQ=255) gcgcTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGcc < 2:796352/150‑1 (MQ=255) tGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCa > 2:87534/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGAGGCGATATCCTTGATTAAGCCTGGATGCGTGCCCGCAAGATTC‑GCG‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAttt > 1:134771/1‑150 (MQ=255) gCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTccc > 1:646334/1‑150 (MQ=255) cGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGa < 1:22978/150‑1 (MQ=255) cGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGa < 2:656829/150‑1 (MQ=255) ccGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GGC‑ACCCCGA‑CGTTCGTTTCTTCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCa < 1:78014/150‑1 (MQ=255) tGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATggg < 1:858780/150‑1 (MQ=255) tGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGa < 1:87534/150‑1 (MQ=255) gCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAgg > 1:303330/1‑150 (MQ=255) gATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGcc > 1:137993/1‑129 (MQ=255) gATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGcc < 2:137993/129‑1 (MQ=255) atCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTg < 1:675466/150‑1 (MQ=255) ccTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTTCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTggg < 2:608615/150‑1 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAgcgc < 1:964925/117‑1 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAgcgc > 2:964925/1‑117 (MQ=255) ttGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGgc > 1:559711/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAgg < 1:654350/83‑1 (MQ=255) ttCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAgg > 2:654350/1‑83 (MQ=255) cAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTgc < 1:824001/150‑1 (MQ=255) gCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGcgcg > 1:715603/1‑150 (MQ=255) ttGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGaa < 1:123084/150‑1 (MQ=255) ttGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGaa > 2:890291/1‑150 (MQ=255) cctcggcctccatcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtgggcggccccttgatggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGa > 1:229029‑M2/69‑150 (MQ=255) tGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGc < 2:1027954/150‑1 (MQ=255) gcctccatcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtgggcggccccttgatggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGc < 2:229029‑M2/87‑1 (MQ=255) ctccatcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgagggAGGCCGAGGGCCGGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCaa > 1:902922‑M2/60‑150 (MQ=255) tccatcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgagggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGaa < 1:793056‑M2/83‑1 (MQ=255) tccatcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgagggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGaa > 2:793056‑M2/59‑141 (MQ=255) catcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggttggcggccccttgatggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATCTCCCCATGGAGCGCCTgg > 2:733068‑M2/59‑100 (MQ=255) catcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggttggcggccccttgatggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATCTCCCCATGGAGCGCCTgg < 1:733068‑M2/42‑1 (MQ=255) cTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAgcgc < 2:715603/150‑1 (MQ=255) tCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGcgcc > 1:457879/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGcgcc > 2:495814/1‑150 (MQ=255) atcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgatggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAgcgc > 1:656524‑M2/56‑150 (MQ=255) ggCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCaa > 1:805609/1‑150 (MQ=255) ggCGC‑GCC‑A‑CCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAg > 1:868417/1‑150 (MQ=255) ggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcggccccttgatggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGCGGAGGTACTGGGGCGGCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCa > 1:170188‑M2/52‑150 (MQ=255) ggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcggccccttgatggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGATAGACTAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCa > 1:170146‑M2/52‑150 (MQ=255) gc‑gcC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCCCCACCCCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAgct < 1:307768/150‑1 (MQ=255) c‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGTTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGctgctg > 2:811600/1‑150 (MQ=255) gccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgagggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGaa > 1:780030‑M2/45‑127 (MQ=255) gccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgagggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGaa < 2:780030‑M2/83‑1 (MQ=255) cacccGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGa < 2:868417/148‑1 (MQ=255) gatgaaacgcacgtcggggtggcgcgctttgatggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGTGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGAc < 2:656524‑M2/115‑1 (MQ=255) cGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGAc < 2:457879/150‑1 (MQ=255) tttCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGAccc > 2:90074/1‑146 (MQ=255) tttCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGAccc < 1:90074/146‑1 (MQ=255) tttCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGAt > 1:481716/1‑150 (MQ=255) aTCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCgaa < 2:481716/150‑1 (MQ=255) aTCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCgaa < 2:303330/150‑1 (MQ=255) aTCGGGGATGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTGATGAGGCTAGGCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCAGAGTGCTCAAGGGCCGCAAGCTGCTTATCCGCACCCTGATCgaa > 2:80288/1‑150 (MQ=255) ggTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGaaaa < 1:1087347/150‑1 (MQ=255) gcggcCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCg > 1:1091886/1‑150 (MQ=255) cgcgccttgagggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGAc < 2:902922‑M2/137‑1 (MQ=255) cTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCgaa < 1:829315/133‑1 (MQ=255) cTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCAGGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCgaa > 2:829315/1‑133 (MQ=255) tGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATCg < 1:890291/150‑1 (MQ=255) ggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATCgg > 1:648393‑M2/3‑150 (MQ=255) | GCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCC‑ACCCCGA‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATCGG > NC_002947/1798102‑1798397 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |