New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1126598 = | 67 (0.760) | 11 (0.150) | 7/204 | NT | 16.7% | intergenic (‑47/+103) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1126656 = | 54 (0.740) | intergenic (‑105/+45) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
AACGTGTTCGGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1126766‑1126598 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgcattcgcgggtaaacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCA > NC_002947/1126656‑1126804 AACGTGTTCGGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCG > 1:523155/1‑150 TTCGGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCG > 1:1276339/1‑150 GGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:1130636/150‑1 GGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:426099/150‑1 GGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCCTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:1810877/150‑1 CGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAAC < 2:1920596/150‑1 CGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAAC > 1:785112/1‑150 CGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAAC > 1:1673822/1‑150 CGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAAC < 2:523155/150‑1 ACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGC > 1:1051384/1‑150 TGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAA < 2:1167761/142‑1 TGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAA > 1:1167761/1‑142 ATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:1416613/117‑1 ATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG > 2:1416613/1‑117 AGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGG < 2:800062/114‑1 AGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGG > 1:800062/1‑114 GATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCC < 1:1071717/85‑1 GATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCC > 2:1071717/1‑85 CCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAA < 2:884493/93‑1 CCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAA > 1:884493/1‑93 TTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG > 1:1343206/1‑72 TTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 2:1343206/72‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCC > 1:605781/1‑150 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCC > 2:382029/1‑150 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGC < 1:877286/129‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGC > 2:877286/1‑129 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTC > 2:2257728/1‑112 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTC < 1:2257728/112‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGG > 2:871021/1‑89 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGG < 1:871021/89‑1 AATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACA > 2:1769176/1‑150 ATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACAC < 2:605781/150‑1 GTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGA > 2:1047783/1‑150 CCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGT > 1:2071694/1‑135 CCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGT < 2:2071694/135‑1 GCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGC < 2:1222339/150‑1 GCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGC > 2:417335/1‑150 GCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGAC < 2:841904/137‑1 GCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGAC > 1:841904/1‑137 CATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCG < 1:2046296/150‑1 ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGG > 2:2032225/1‑150 TCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCC > 2:616518/1‑150 GGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTA < 2:1417606/150‑1 GGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTA < 2:466900/150‑1 tttACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTT < 1:1715784/147‑1 AAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTG < 2:1986167/150‑1 ACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCC > 1:763302/1‑150 ACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCC > 2:1305084/1‑150 CCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCT > 1:15063/1‑150 CCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCT > 2:1380313/1‑150 CCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTAAACCCTGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTT > 2:1507693/1‑150 GCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCC > 1:488236/1‑150 GCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCC < 2:1007017/150‑1 CTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCA < 2:763302/150‑1 AACGTGTTCGGCGACCGCAACCTGGTGTGCGCCTGCCCGTCGATCGAGAGCTATCAGGACGCCTGATAGCCCTCCCCGCCACCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1126766‑1126598 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgcattcgcgggtaaacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCA > NC_002947/1126656‑1126804 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |