New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1126598 = | 67 (0.760) | 11 (0.150) | 7/204 | NT | 16.7% | intergenic (‑47/+103) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1126656 = | 54 (0.740) | intergenic (‑105/+45) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCAC > NC_002947/1126508‑1126805 | gggCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCGCCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:1852991/1‑150 (MQ=255) gccgatgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 2:118291/1‑150 (MQ=255) aTCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCC > 1:987586‑M1/1‑150 (MQ=255) tCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCC < 1:2081253‑M1/150‑1 (MQ=255) ttGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGC > 2:1441473‑M1/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑C < 1:383271‑M1/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑C > 1:1417606‑M1/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑ccc < 1:1373113/150‑1 (MQ=255) gTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAg > 1:1222339/1‑150 (MQ=255) gAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGcga > 1:1613008/1‑148 (MQ=255) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggt > 1:2368511‑M2/1‑147 (MQ=255) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggt < 1:293726‑M2/150‑4 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCATCATCGCATTCGGGGGTACACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggtggcgg > 2:336332‑M2/1‑142 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggtggcgg > 1:1609073‑M2/1‑142 (MQ=255) cAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggtggcggg > 2:293726‑M2/1‑141 (MQ=255) aGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCgggg > 2:1498176/1‑150 (MQ=255) gTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGa > 1:616372/1‑150 (MQ=255) tgGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATc < 1:975610/150‑1 (MQ=255) 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ctcctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAgg < 2:1948779/148‑1 (MQ=255) ctcctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAAGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAgg > 1:1948779/1‑148 (MQ=255) cccgagaGGTTGTTGGGTGGACACTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTc < 1:1245846/144‑1 (MQ=255) tGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTccc < 1:1441473/150‑2 (MQ=255) tGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCt > 1:1843202/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGAt > 1:1007017/1‑150 (MQ=255) ggTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGGGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑ACGCCTGATAg < 2:732526/150‑1 (MQ=255) gttgttGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGACG‑CCTGATAGc < 1:1819205/150‑1 (MQ=255) tgttgGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGctc < 1:754507/150‑1 (MQ=255) gttgGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGctct < 2:616372/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gcattcgcgggtaaacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggc < 2:1222339‑M2/130‑1 (MQ=255) attcgcgggtaaacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggcgg > 2:2032225‑M2/19‑150 (MQ=255) tcgcgggtaaacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGcc > 2:616518‑M2/17‑150 (MQ=255) gggtaaacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTa < 2:1417606‑M2/138‑1 (MQ=255) gggtaaacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTa < 2:466900‑M2/138‑1 (MQ=255) tttacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACtt < 1:1715784‑M2/141‑1 (MQ=255) aaacccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTg < 2:1986167‑M2/142‑1 (MQ=255) acccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGcc > 2:1305084‑M2/7‑150 (MQ=255) cccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCt > 1:15063‑M2/6‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCaagccaggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctatacctccgcattcgc < 1:339643‑M1/100‑74 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCaagccaggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctatacctccgcattcgc > 2:339643‑M1/1‑27 (MQ=255) ccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTAAACCCTGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCtt > 2:1507693‑M2/5‑150 (MQ=255) gcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTcc > 1:488236‑M2/3‑150 (MQ=255) gcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTcc < 2:1007017‑M2/148‑1 (MQ=255) cTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCa < 2:763302‑M2/149‑1 (MQ=255) tCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTccac < 1:1769176/150‑1 (MQ=255) | GGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCAC > NC_002947/1126508‑1126805 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |