New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4350173 = | 93 (1.050) | 12 (0.160) | 10/212 | NT | 13.3% | intergenic (‑181/+56) | galU/PP_3822 | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/cytochrome c family protein |
? | NC_002947 | 4350224 = | 77 (1.010) | intergenic (‑232/+5) | galU/PP_3822 | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/cytochrome c family protein |
AGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4350337‑4350173 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagaggccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGC > NC_002947/4350224‑4350368 AGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAA < 1:2152796/150‑1 ATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCC > 1:1618019/1‑150 ATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCC < 2:1445844/150‑1 ATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTT‑GGCGCG‑TGGGCCCGTCGAAGAGGCCGCCA > 1:204340/1‑150 GAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCG > 2:157105/1‑150 GAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCG > 1:404728/1‑150 AGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCA‑CGCG‑CCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACC < 1:930539/150‑1 CAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAA > 2:959306/1‑83 CAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAA < 1:959306/83‑1 CCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCC < 2:1177568/77‑1 CCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCC > 1:1177568/1‑77 CCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATC > 2:285975/1‑70 CCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATC < 1:285975/70‑1 CTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCC > 1:1284676/1‑150 TT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCT > 1:2062175/1‑150 TT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT < 1:2385226/65‑1 TT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT > 2:2385226/1‑65 GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTAC < 2:930539/150‑1 GCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAA > 2:86295/1‑116 GCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAA < 1:86295/116‑1 ccAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACA > 2:1271243/3‑76 ccAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACA < 1:1271243/74‑1 ttGGCTGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACACCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGC > 2:1552969/3‑150 GCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGC > 2:1211615/1‑150 GCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACA > 2:1049916/1‑70 GCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACA < 1:1049916/70‑1 CGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTC > 2:1572724/1‑150 CGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTC > 1:1761157/1‑150 CGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTC > 2:673465/1‑150 GCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCG > 2:615439/1‑150 GCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTAC > 1:1969015/1‑125 GCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTAC < 2:1969015/125‑1 CCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGT > 1:1077593/1‑150 CACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTG < 2:2152796/150‑1 CCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGC < 1:995406/150‑1 AGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTT‑GGCGCG‑TGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4350337‑4350173 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagaggccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGC > NC_002947/4350224‑4350368 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |