New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GACCGTTGCCATCATAGAGATATCCCAGTGTAGATAGTTCCGGGGGATCGTAAATATTGCTGTCATACATGACCGTTGGATGACAGGGAAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCA‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGC > NC_002947/4350075‑4350368 | ttGCCATCATAGAGATATCCCAGTGTAGACAGTTCCGGGGGATCGTAAATATTGCTGTCATACATGACCGTTGGATATGCGGGAAATCAGCGTGTTCCTGGCGAACCTGTCAACCTTCTCA‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCt < 1:1622999/150‑1 (MQ=255) gCCATCATAGAGATATCCCAGTGTAGATAGTTCCGGGGGATCGTAAATATTGCTGTCATACATGACCGTTGGATGACAGGGAAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCA‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCa < 2:1388057/150‑1 (MQ=255) catcatAGAGATATCCCAGTGTAGATAGTTCCGGGGGATCGTAAATATTGCTGTCATACATGACCGTTGGATGACAGGGAAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCA‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGc < 1:2186086/150‑1 (MQ=255) 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tCCCAGTGTAGATAGTTCCGGGGGATCGTAAATATTGCTGTCATACATGACCGTTGGATGACAGGGAAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCA‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTAc < 2:1256371/140‑1 (MQ=255) cAGTGTAGATAGTTCCGGGGGATCGTAAATATTGCTGTCATACATGACCGTTGGATGACAGGGAAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCA‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTcc > 1:1987649/1‑150 (MQ=255) cAGTGTAGATAGTTCCGGGGGATCGTAAATATTGCTGTCATACATGACCGTTGGATGACAGGGAAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCA‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTcc > 2:1561560/1‑150 (MQ=255) tgtAGATAGTTCCGGGGGATCGTAAATATTGCTGTCATACATGACCGTTGGATGACAGGGAAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCA‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAt < 1:446619/150‑1 (MQ=255) gtAGATAGTTCCGGGGGATCGTAAATATTGCTGTCATACATGACCGTTGGATGACAGGGAAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCA‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAg > 2:1891125/1‑129 (MQ=255) 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2:2017311/150‑1 (MQ=255) a‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATcc > 1:80110/1‑134 (MQ=255) a‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGGCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATcc < 2:80110/134‑1 (MQ=255) c‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCtgt < 1:623531/150‑1 (MQ=255) ccagaggccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACa > 2:1271243‑M2/19‑76 (MQ=255) ccagaggccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACa < 1:1271243‑M2/58‑1 (MQ=255) ttggctgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACACCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGc > 2:1552969‑M2/16‑150 (MQ=255) gccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACa > 2:1049916‑M2/13‑70 (MQ=255) gccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACa < 1:1049916‑M2/58‑1 (MQ=255) gccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGc > 2:1211615‑M2/13‑150 (MQ=255) cgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTc > 2:1572724‑M2/11‑150 (MQ=255) cgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTc > 2:673465‑M2/11‑150 (MQ=255) cgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTc > 1:1761157‑M2/11‑150 (MQ=255) gccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTAc > 1:1969015‑M2/10‑125 (MQ=255) gccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTAc < 2:1969015‑M2/116‑1 (MQ=255) gccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCg > 2:615439‑M2/10‑150 (MQ=255) ccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGt > 1:1077593‑M2/9‑150 (MQ=255) caccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTg < 2:2152796‑M2/143‑1 (MQ=255) ttACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGtcttct < 2:153722/100‑1 (MQ=255) ttACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGtcttct > 1:153722/1‑100 (MQ=255) | GACCGTTGCCATCATAGAGATATCCCAGTGTAGATAGTTCCGGGGGATCGTAAATATTGCTGTCATACATGACCGTTGGATGACAGGGAAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCA‑CGCGCC‑AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAT‑CAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGC > NC_002947/4350075‑4350368 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |