| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 304450 | 75 (0.850) | 5 (0.060) | 5/236 | NT | 7.1% | coding (321/621 nt) | PP_0249 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 304473 | 58 (0.680) | coding (298/621 nt) | PP_0249 | hypothetical protein | |||||
GAACTCCACCTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTCGCGCA > NC_002947/304303‑304598 | gAACTCCACCTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAg < 1:1983380/150‑1 (MQ=255) aCTCCACCTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGt < 2:2121734/150‑1 (MQ=255) cTCCACCTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTg > 2:1685483/1‑150 (MQ=255) tCCACCTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTgc > 2:1567285/1‑150 (MQ=255) tCCACCTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTgc < 1:2385481/150‑1 (MQ=255) ccACCTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTgcg > 2:1788239/1‑150 (MQ=255) ccACCTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTgcg > 2:111216/1‑150 (MQ=255) cACCTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTgcgc > 1:323345/1‑150 (MQ=255) ccTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAg > 1:1061342/1‑150 (MQ=255) cTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGt > 2:1125843/1‑150 (MQ=255) tCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTCGGCGTGGCCGTTGGAGCTTTTGATGGGTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAggg > 2:333438/1‑148 (MQ=255) cccACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGGGa > 2:727688/1‑150 (MQ=255) ccACACATCAGCGCCCAGCGGCCGTGACGTGCCGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTGCAGCGTCCCCACCGGTGCCTCGCGGGGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGaa < 2:394173/150‑1 (MQ=255) ccACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGaa < 2:1723875/150‑1 (MQ=255) acacacCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGc < 1:1788239/150‑1 (MQ=255) acacacCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGCTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCACCTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGGAGTGAAGc > 1:1040420/1‑150 (MQ=255) acacCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGaa > 2:1135779/1‑146 (MQ=255) acacCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGaa < 1:1135779/146‑1 (MQ=255) 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ccAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAgggct < 2:1157544‑M2/150‑6 (MQ=255) cAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCtgggttcgcttcactgcgcacctgggctcggtggt < 1:1703194‑M1/150‑36 (MQ=255) gCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGaa < 2:323345/150‑1 (MQ=255) gATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTTCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAggg > 2:256021/1‑150 (MQ=255) gACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCCTCGCTACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTc < 2:1270427/150‑1 (MQ=255) 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gTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTc > 2:1732096/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTca < 2:2082874/150‑1 (MQ=255) cggCGCAACTGTACCACCTCGC‑CTAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAggaat < 1:1289576/149‑4 (MQ=255) gcAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAg > 2:27191/1‑142 (MQ=255) gcAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAg < 1:27191/142‑1 (MQ=255) cTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGc < 2:1155498/150‑1 (MQ=255) tGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCATGGCg > 1:2171235/1‑150 (MQ=255) cgccaccGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGAc < 2:111437/148‑1 (MQ=255) accaccGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAATCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTg < 1:1623062/72‑1 (MQ=255) accaccGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaaaccatcaagagctccaacggccacgcccagacccgctacgtcatccgcacgtcactg < 1:1703194‑M2/150‑116 (MQ=255) accaccGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTg > 2:1623062/1‑72 (MQ=255) caccGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCa < 1:111216/150‑1 (MQ=255) caccGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCa > 2:1798915/1‑150 (MQ=255) aGC‑CCtgggttcgcttcactgcgcacctgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaaaccatcaagagctccaacggccacgcccagacccgctacgtcatccgcacgtcactggcgctgg < 2:1157544‑M1/150‑146 (MQ=255) aGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaa > 2:2236777‑M2/1‑28 (MQ=255) aGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaa < 1:2236777‑M2/86‑59 (MQ=255) aGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAgg > 2:1711909/1‑128 (MQ=255) aGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAgg < 1:1711909/128‑1 (MQ=255) c‑ccAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTCgcgc < 1:1317170/150‑1 (MQ=255) cctgggttcgcttcactgcgcacctgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaaaccatcaagagctccaacggccacgcccagacccgctacgtcatccgcacgtcactggcgctgggtg > 1:1125843‑M1/1‑2 (MQ=255) cctgggttcgcttcactgcgcacctgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaaaccatcaagagctccaacggccacgcccagacccgctacgtcatccgcacgtcactggcgctgggtg > 1:589089‑M1/1‑2 (MQ=255) cAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaaaccat < 2:1343925‑M2/87‑64 (MQ=255) cAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaaaccat > 1:1343925‑M2/1‑24 (MQ=255) | GAACTCCACCTCCCACACACCATCACCCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGC‑CCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTCGCGCA > NC_002947/304303‑304598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |