New junction evidence | |||||||||||
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GTCGTACCAGAGCACCGGTGAGTCGATGACCCACTGCCCGTCGGCTTTGCGCTTGAGCGGTTGCTGCAGATAGGCATCTGGCTGGTCAGGGTCAATGGCTCGCCAGCGGTAGCCGTCGAAGCTGACCTGGTAGTAGCGGTTGTCGCTGTCCTTGACGAAATACAGCGACAGCCCACCAAACGCCGAGCTTTGCTCGTATACACCCTCACCGTAGATACCGTCTATGCGATACCGGAGGCTGCTGCTGTCCGGTTGCGCCTGGAAGCGTGCGGGCAGTGGCAGTGGCGGTTGTTTGG > NC_002947/421482‑421777 | gtcgtACCAGAGCACCGGTGAGTCGATGACCCACTGCCCGTCGGCTTTGCGCTTGAGCGGTTGCTGCAGATAGGCATCTGGCTGGTCAGGGTCAATGGCTCGCCAGCGGTAGCCGTCGAAGCTGACCTGGTAGTAGCGGTTGTCGCTGTc < 1:1605488/150‑1 (MQ=255) tcgtACCAGAGCACCGGTGAGTCGATGACCCACTGCCCGTCGGCTTTGCGCTTGAGCGGTTGCTGCAGATAGGCATCTGGCTGGTCAGGGTCAATGGCTCGCCAGCGGTAGCCGTCGAAGCTGACCTGGTAGTAGCGGTTGTCGCTGTcc < 2:1806528/150‑1 (MQ=255) aCCAGAGCACCGGTGAGTCGATGACCCACTGCCCGTCGGCTTTGCGCTTGAGCGGTTGCTGCAGATAGGCATCTGGCTGGTCAGGGTCAATGGCTCGCCAGCGGTAGCCGTCGAAGCTGACCTGGTAGTAGCGGTTGTCGCTGTCCTTGa > 1:242068/1‑150 (MQ=255) 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1:585973/150‑1 (MQ=255) ggTTGTCGCTGTCCTTGACGAAATACAGCGACAGCCCACCAAACGCCGAGCTTTGCTCGTATACACCCTCACCGTAGATACCGTCTATGCGATACCGGAGGCTGCTGCTGTCCGGTTGCGCCTGGAAGCGTGCGGGCAGTGGCAGTGGCg > 2:1457932/1‑150 (MQ=255) gTTGTCGCTGTCCTTGACGAAATacagcgacaaccgctactaccaggtcagcttcgacggctaccgctggcgagccattgaccctgaccagccagatgc > 2:850113‑M2/1‑23 (MQ=255) gTTGTCGCTGTCCTTGACGAAATacagcgacaaccgctactaccaggtcagcttcgacggctaccgctggcgagccattgaccctgaccagccagatgc < 1:850113‑M2/99‑77 (MQ=255) gTTGTCGCTGTCCTTGACGAAATACAGCGACAGCCCACCAAACGCCGAGCTTTGCTCGTATACACCCTCACCGTAGATACCGTCTATGCGATACCGGAGGCTGCTGCTGTCCGGTTGCGCCTGGAAGCGTGCGGGCAGTGGCAGTGGCgg < 1:762867/150‑1 (MQ=255) tCGCTGTatttcgtcaaggacagcgacaaccgctactaccaggtcagcttcgacggctaccgctggcgagccattgaccctgaccagccagatgcctatctgcagcaaccgctcaagcgcaaagccgacgggcagtgggtcatcgactca < 1:1243328‑M1/150‑144 (MQ=255) gCTGTCCTTGACGAAATacagcgacaaccgctactaccaggtcagcttcgacggctaccgctggcga < 1:1963939‑M2/67‑51 (MQ=255) gCTGTCCTTGACGAAATacagcgacaaccgctactaccaggtcagcttcgacggctaccgctggcga > 2:1963939‑M2/1‑17 (MQ=255) cTGTatttcgtcaaggacagcgacaaccgctactaccaggtcagcttcgacggctaccgctggcgagccattgaccctgaccagccagatgcctatctgcagcaaccgctcaagcgcaaagccgacgggcagtgggtcatcgactcaccg < 1:1302278‑M1/150‑147 (MQ=255) cTGTatttcgtcaaggacagcgacaaccgctactaccaggtcagcttcgacggctaccgctggcgagccattgaccctgaccagccagatgcctatctgcagcaaccgc < 2:934289‑M1/109‑106 (MQ=255) cTGTatttcgtcaaggacagcgacaaccgctactaccaggtcagcttcgacggctaccgctggcgagccattgaccctgaccagccagatgcctatctgcagcaaccgc > 1:934289‑M1/1‑4 (MQ=255) cTGTatttcgtcaaggacagcgacaaccgctactaccaggtcagcttcgacggctaccgctggcgagccattgaccctgaccagccagatgcctat > 1:1245041‑M1/1‑4 (MQ=255) cTGTatttcgtcaaggacagcgacaaccgctactaccaggtcagcttcgacggctaccgctggcgagccattgaccctgaccagccagatgcctat < 2:1245041‑M1/96‑93 (MQ=255) cTGTCCTTGACGAAATACAGCGACAGCCCACCAAACGCCGAGCTTTGCTCGTATACACCCTCACCGTAGATACCGTCTATGCGATACCGGAGGCTGCTGCTGTCCGGTTGCGCCTGGAAGCGTGCGGGCAGTGGCAGTGGCGGTTGTTTg < 2:242068/150‑1 (MQ=255) tGTCCTTGACGAAATACAGCGACAGCCCACCAAACGCCGAGCTTTGCTCGTATACACCCTCACCGTAGATACCGTCTATGCGATACCGGAGGCTGCTGCTGTCCGGTTGCGCCTGGAAGCGTGCgg > 2:1976146/1‑126 (MQ=255) tGTCCTTGACGAAATACAGCGACAGCCCACCAAACGCCGAGCTTTGCTCGTATACACCCTCACCGTAGATACCGTCTATGCGATACCGGAGGCTGCTGCTGTCCGGTTGCGCCTGGAAGCGTGCgg < 1:1976146/126‑1 (MQ=255) tGTCCTTGACGAAATACAGCGACAGCCCACCAAACGCCGAGCTTTGCTCGTATACACCCTCACCGTAGATACCGTCTATGCGATACCGGAGGCTGCTGCTGTCCGGTTGCGCCTGGAAGCGTGCGGGCAGTGGCAGTGGCGGTTGTTTgg > 1:926323/1‑150 (MQ=255) tCCTTGACGAAATACAGCGACAGCCCACCAAACGCCGAGCTTTGCTCGTATACACCCTCACCGTAGATACCGTCTATGCGATACCGGAGGCTGCTGCTGTCCGGTTGCGCCTGGAAGCGTGCGGGCAGTGGCAGTGGCGGTTGTTTgg > 2:959271/1‑148 (MQ=255) tCCTTGACGAAATACAGCGACAGCCCACCAAACGCCGAGCTTTGCTCGTATACACCCTCACCGTAGATACCGTCTATGCGATACCGGAGGCTGCTGCTGTCCGGTTGCGCCTGGAAGCGTGCGGGCAGTGGCAGTGGCGGTTGTTTgg < 1:959271/148‑1 (MQ=255) | GTCGTACCAGAGCACCGGTGAGTCGATGACCCACTGCCCGTCGGCTTTGCGCTTGAGCGGTTGCTGCAGATAGGCATCTGGCTGGTCAGGGTCAATGGCTCGCCAGCGGTAGCCGTCGAAGCTGACCTGGTAGTAGCGGTTGTCGCTGTCCTTGACGAAATACAGCGACAGCCCACCAAACGCCGAGCTTTGCTCGTATACACCCTCACCGTAGATACCGTCTATGCGATACCGGAGGCTGCTGCTGTCCGGTTGCGCCTGGAAGCGTGCGGGCAGTGGCAGTGGCGGTTGTTTGG > NC_002947/421482‑421777 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |