New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 703346 | 78 (0.880) | 7 (0.080) | 7/234 | NT | 8.9% | coding (82/660 nt) | PP_0598 | paraquat‑inducible protein A |
? | NC_002947 | = 703362 | 70 (0.830) | coding (98/660 nt) | PP_0598 | paraquat‑inducible protein A |
GCCTCCCATAATTCGAGTCAGAACACTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACGGCCCTTTTGCTGTTCGTGCCGGCCAATTTCCTGCC > NC_002947/703203‑703494 | gCCTCCCATAATTCGAGTCAGAACACTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCa > 1:714926/1‑150 (MQ=255) tCCCATAATTCGAGTCAGAACACTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGc < 1:1482567/150‑1 (MQ=255) cccATAATTCGAGTCAGAACACTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGcc < 2:790979/150‑1 (MQ=255) ccATAATTCGAGTCAGCACACTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGACGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGccc > 2:17625/1‑150 (MQ=255) aTAATTCGAGTCAGAACACTAGAATAGCNCCCACGCANCTCTACAGANGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCACAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGGGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCCAGCCCGt > 1:794306/1‑150 (MQ=255) aTAATTCGAGTCAGAACACTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGt < 2:1196818/150‑1 (MQ=255) cGAGTCAGAACACTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCagcacgggcttgcgcagca < 1:2389696‑M1/150‑20 (MQ=255) tCAGAACACTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCat < 2:2101152/150‑1 (MQ=255) aaCACTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCatgatg > 2:756842/1‑150 (MQ=255) acacTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCAtgatga < 2:330991/150‑1 (MQ=255) tAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGaaa > 2:1301462/1‑150 (MQ=255) gAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGc > 2:1560400/1‑150 (MQ=255) aaTAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGtg > 2:1713467/1‑129 (MQ=255) aaTAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGtg < 1:1713467/129‑1 (MQ=255) aaTAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGcc < 1:1683779/150‑1 (MQ=255) tAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCAtgatga > 1:1679700/1‑141 (MQ=255) tAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGATGCACCAtgatga < 2:1679700/141‑1 (MQ=255) ccccACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGc > 2:678911/1‑150 (MQ=255) cccACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGcc > 2:1966283/1‑150 (MQ=255) ccACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGccc > 1:1140044/1‑150 (MQ=255) cACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCcg > 2:365783/1‑150 (MQ=255) gCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACACTGGCCGAGCTGACGTTGGACGGACAGGTCTCCGGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCgcgc > 1:902499/1‑150 (MQ=255) ccTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGaaa > 1:1112392/1‑132 (MQ=255) ccTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGaaa < 2:1112392/132‑1 (MQ=255) cTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCg > 1:725552/1‑150 (MQ=255) taCAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCt > 2:68931/1‑150 (MQ=255) taCAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCt > 2:38372/1‑150 (MQ=255) aGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACg > 1:2057694/1‑150 (MQ=255) ctctATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAGCCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCagcacgggcttgcgcagcagcaggtc < 1:1917519‑M1/112‑27 (MQ=255) ctctATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCagcacgggcttgcgcagcagcaggtc > 2:1917519‑M1/1‑86 (MQ=255) tCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCAt > 1:1391762/1‑150 (MQ=255) tCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCAt > 2:1051220/1‑150 (MQ=255) tCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCAt > 1:971299/1‑150 (MQ=255) cAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCg < 2:1140044/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCgg > 1:1645699/1‑150 (MQ=255) aTTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGc < 1:465263/150‑1 (MQ=255) aTTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGc < 2:714926/150‑1 (MQ=255) tGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACaa < 2:2057694/150‑1 (MQ=255) gTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCatgat > 2:1603252/1‑96 (MQ=255) gTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCatgat < 1:1603252/96‑1 (MQ=255) gTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAAt < 1:1301462/150‑1 (MQ=255) tCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGccc < 2:351425/80‑1 (MQ=255) tCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGccc > 1:351425/1‑80 (MQ=255) tCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTgca > 2:1344269‑M2/1‑85 (MQ=255) tCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTgca < 1:1344269‑M2/88‑4 (MQ=255) gAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCagcacgggcttgcgcagcagca < 2:971184‑M1/89‑23 (MQ=255) gAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCagcacgggcttgcgcagcagca > 1:971184‑M1/1‑67 (MQ=255) gAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCg > 1:1204826/1‑140 (MQ=255) gAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCg < 2:1204826/140‑1 (MQ=255) aaCCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTgg > 2:1974693/1‑150 (MQ=255) aaCCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTgg < 2:750513/150‑1 (MQ=255) ccTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTc < 1:365783/150‑1 (MQ=255) cTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCa > 2:1770162/1‑150 (MQ=255) cTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCa > 2:160723/1‑150 (MQ=255) cTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCa > 1:1414260/1‑150 (MQ=255) aaaCCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATc < 1:1974693/150‑1 (MQ=255) aaaCCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATc < 2:1414260/150‑1 (MQ=255) aaaCCCTCGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATc < 2:119165/150‑1 (MQ=255) aCCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGc < 1:29866/150‑1 (MQ=255) cccTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGACCTGCTGCTGCagcacgggcttgcgcagcagcag < 2:1530775‑M1/83‑24 (MQ=255) cccTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGACCTGCTGCTGCagcacgggcttgcgcagcagcag > 1:1530775‑M1/1‑60 (MQ=255) cTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGc < 1:756842/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAg > 2:2045776/1‑83 (MQ=255) ccAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAg < 1:2045776/83‑1 (MQ=255) ccAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGc > 1:889787/1‑150 (MQ=255) cTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTg < 2:1391762/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCatgat < 2:2092737/70‑1 (MQ=255) gCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCatgat > 1:2092737/1‑70 (MQ=255) ccGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTg < 1:1051220/150‑1 (MQ=255) ccGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTg < 1:17625/150‑1 (MQ=255) cGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGc < 1:1770162/150‑1 (MQ=255) tGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGa < 1:678911/150‑1 (MQ=255) gACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACg > 2:2303496/1‑150 (MQ=255) gACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACg > 2:2303611/1‑150 (MQ=255) aCGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTg < 1:105787/140‑1 (MQ=255) aCGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTg > 2:105787/1‑140 (MQ=255) gAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTAt > 1:1365529/1‑99 (MQ=255) gAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTAt < 2:1365529/99‑1 (MQ=255) gAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACGGcc > 2:1045578/1‑150 (MQ=255) cTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACGGCCCtt > 1:398973/1‑150 (MQ=255) cTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACGGCCCtt > 1:429676/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACGGCCCTTTTGCTg > 2:161884/1‑150 (MQ=255) cATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAAtgtg < 2:1656455/102‑1 (MQ=255) cATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAAtgtg > 1:1656455/1‑102 (MQ=255) gAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGCGAAATCCCAATGGTCGCGGTGCTGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACGGCCCTTTTGCTGTTCGTGCCg > 2:695698/1‑150 (MQ=255) gAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACGGCCCTTTTGCTGTTCGTGCCg < 2:1645699/150‑1 (MQ=255) gAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTgcagcaggtcgcattcatggcaggcgacaagctcgtccaacggcagctgggccagggtttcaggttcgacagaattggacatagag > 2:1917519‑M2/1‑26 (MQ=255) gAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTgcagcaggtcgcattcatggcaggcgacaagctcgtccaacggcagctgggccagggcttcaggttcgacagaattggacatagag < 1:1917519‑M2/112‑87 (MQ=255) ctgctgctgCGCAAGCCCGTGCTgcagcagcaggtcgcattcatggcaggcgacaagctcgtccaacggcagctgggccaggg < 2:1530775‑M2/83‑61 (MQ=255) ctgctgctgCGCAAGCCCGTGCTgcagcagcaggtcgcattcatggcaggcgacaagctcgtccaacggcagctgggccaggg > 1:1530775‑M2/1‑23 (MQ=255) ctgctgctgCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGAGGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACGGCGCTTTTGCTGTTCGTGCCGGCCAAtttt > 2:820113/1‑149 (MQ=255) tgctgctgcGCAAGCCCGTGCTgcagcaggtcgcattcatggcaggcgacaagctcgtccaacggcagctgggccagggtttcaggttc < 2:971184‑M2/89‑68 (MQ=255) tgctgctgcGCAAGCCCGTGCTgcagcaggtcgcattcatggcaggcgacaagctcgtccaacggcagctgggccagggtttcaggttc > 1:971184‑M2/1‑22 (MQ=255) tgctgcGCAAGCCCGTGCTgcagcaggtcgcattcatggcaggcgacaagctcgtccaacggcagctgggccagggtttcaggttcgacagaattggacatagagcgcttctgtataggtgcgtgggggctattctagtgttctgactcg < 1:2389696‑M2/150‑132 (MQ=255) tgcagcacgggcttgcgcagcagcaggtcgcattcatggcaggcgacaagctcgtccaacggcagctgggccagggtttcaggttcga < 1:1344269‑M1/88‑86 (MQ=255) tgcagcacgggcttgcgcagcagcaggtcgcattcatggcaggcgacaagctcgtccaacggcagctgggccagggtttcaggttcga > 2:1344269‑M1/1‑3 (MQ=255) gctgcGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACGGCCCTTTTGCTGTTCGTGCCGGCCAATttccttcc < 2:398973/150‑1 (MQ=255) gctgcGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGCCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTCGCCTTGGTGCTGACGGCCCTTTTGCTGTTCGTGCCGGCCAATTTCCTGcc < 2:43486/150‑1 (MQ=255) | GCCTCCCATAATTCGAGTCAGAACACTAGAATAGCCCCCACGCACCTATACAGAAGCGCTCTATGTCCAATTCTGTCGAACCTGAAACCCTGGCCCAGCTGCCGTTGGACGAGCTTGTCGCCTGCCATGAATGCGAC‑‑‑CTGCTGCTGCGCAAGCCCGTGCTGCAGCATGATGAGAAAGCCCAATGCCCGCGCTGCGGCTACGAGCTCTATGCCCATCGGCACAATGTGGTCAATCGCAGCCTGGCCTTGGTGCTGACGGCCCTTTTGCTGTTCGTGCCGGCCAATTTCCTGCC > NC_002947/703203‑703494 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |