| New junction evidence | |||||||||||
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GCGACCGCAGACGTATTGATGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCA > NC_002947/930056‑930353 | gctaCCGCAGACGTATTGCTGCCGTCGGACTGTGTCACTCCCTGTGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGGGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCCCGTCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTg < 1:516959/147‑1 (MQ=255)gcgACCGCAGACGTATTGATGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTg < 1:35710/150‑1 (MQ=255)gcgACCGCAGACGTATTGATGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTg < 2:899642/150‑1 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gATGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCtt > 1:2147742/1‑150 (MQ=255) aTGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTg > 2:1415372/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCAACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGcc < 2:1113699/150‑1 (MQ=255) tgctgacggtggtgtccaccgatgatgccggcaacgcttcggtggctgtcccttaccagaccaacgacacctcgccacccgacctggtgaccaacctggcgatcaacaacaccttcaacgtgctgacTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCa > 2:547568‑M1/128‑150 (MQ=255) gTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCa > 1:1226932/1‑148 (MQ=255) 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acGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGcc > 1:154481/1‑150 (MQ=255) gCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCAc < 2:1865092/150‑1 (MQ=255) gTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGaa < 2:1526517/150‑1 (MQ=255) cGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGt > 1:1754227/1‑150 (MQ=255) tCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGc < 2:1239637/150‑1 (MQ=255) tctcCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg < 2:933452/63‑1 (MQ=255) tctcCGTCGAAGCTGACGGTGACAGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg > 1:933452/1‑63 (MQ=255) ctcCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa > 2:1092492/1‑61 (MQ=255) ctcCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa < 1:1092492/61‑1 (MQ=255) cGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCATTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCgg < 2:1307136/93‑1 (MQ=255) cGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCATTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCgg > 1:1307136/1‑93 (MQ=255) aacaccttcaacgtgctgacTGGCAAGGGCGAAGCCAATGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGa < 1:1158428‑M1/102‑1 (MQ=255) aacaccttcaacgtgctgacTGGCAAGGGCGAAGCCAATGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGa > 2:1158428‑M1/21‑122 (MQ=255) aaGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTg < 2:154481/150‑1 (MQ=255) cTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGCTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGac < 2:132999/150‑1 (MQ=255) gACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTGGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGGCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGacac < 1:1478068/150‑1 (MQ=255) aCGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGt < 2:1772702/97‑1 (MQ=255) aCGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGt > 1:1772702/1‑97 (MQ=255) ggTGACCTTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGAcaccac > 2:1658755/1‑150 (MQ=255) cGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAg > 2:2349084/1‑150 (MQ=255) TGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAg > 1:938912‑M1/1‑80 (MQ=255) TGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAg < 2:938912‑M1/80‑1 (MQ=255) TGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGAGCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCa > 2:1620724‑M1/1‑150 (MQ=255) | GCGACCGCAGACGTATTGATGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCA > NC_002947/930056‑930353 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |