| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 930204 = | 79 (0.890) | 10 (0.120) | 8/236 | NT | 11.9% | coding (15421/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
| ? | NC_002947 | 930227 = | 72 (0.850) | coding (15398/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein | |||||
GTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCGTTGTTCTGTGCCG > NC_002947/930079‑930374 | gTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCATCGTCTCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGt > 1:1620724/1‑150 (MQ=255) tgacggtggtgtccaccgatgatgccggcaacgcttcggtggctgtcccttaccagaccaacgacacctcgccacccgacctggtgaccaacctggcgatcaacaacaccttcaacgtgctgacTGGCATTGGCTTCGACCTTGCCAGTc > 1:552450‑M1/125‑150 (MQ=255) tCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTc < 1:1415372/150‑1 (MQ=255) gACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGc < 2:1025379/150‑1 (MQ=255) tCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGa > 1:1285054/1‑150 (MQ=255) tCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGa > 2:2206858/1‑150 (MQ=255) aCTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCCACGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg < 1:1234656/150‑1 (MQ=255) aCTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg > 1:1239637/1‑150 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa < 2:865756/147‑1 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa > 1:865756/1‑147 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg < 2:1386435/148‑1 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg < 2:534279/148‑1 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg > 1:1386435/1‑148 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg > 1:534279/1‑148 (MQ=255) gagTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGtgttgt < 2:1285054/150‑1 (MQ=255) tGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGa > 1:189465/1‑150 (MQ=255) tGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTCGCCAGCGCAATCCAACACGCCCGTACAGATCACGTCTCCGTCGAAGCGGATGGCTATCGGTGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGCCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGa > 2:1478068/1‑150 (MQ=255) gagcgagcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg > 2:396830/1‑136 (MQ=255) gagcgagcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg < 1:396830/136‑1 (MQ=255) gagcgagcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGc > 2:2328278/1‑150 (MQ=255) gagcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAgg < 2:2376067/150‑1 (MQ=255) gcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGtt > 2:2088384/1‑150 (MQ=255) gcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGtt < 2:2147742/150‑1 (MQ=255) 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tttGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGATGCCTGCCGCGACGCCGGCGAAGCTGCCAGTGACCGTCGCCTCGGCTACCTGATCGTCAGTCAGCACGATGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGAGACCAGGACGGGGTGCGAgg > 1:2350369/1‑150 (MQ=255) ttGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa < 2:1964095/105‑1 (MQ=255) ttGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa > 1:1964095/1‑105 (MQ=255) ttGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGccggtt < 2:2402359/150‑6 (MQ=255) tcggAAGTTGCCATCTTGATCTACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACTGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGgt < 2:1117961/148‑1 (MQ=255) gTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGtt < 2:1076372/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa > 1:1548531/1‑94 (MQ=255) cAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa < 2:1548531/94‑1 (MQ=255) aGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTTTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTg < 1:1217364/150‑1 (MQ=255) aGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTc < 1:1978669/126‑1 (MQ=255) aGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTc > 2:1978669/1‑126 (MQ=255) cATCCACCCCGCCGGTACCGCTCACGCCTCCGTCGCCGCAGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAg < 2:1330543/150‑1 (MQ=255) 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tggcaagggcgaagccaatgccaGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGt > 1:77285‑M2/24‑133 (MQ=255) tggcaagggcgaagccaatgccaGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCa > 2:547568‑M2/24‑150 (MQ=255) tagcaagggcgaagccaatgccaGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGt < 2:1974401‑M2/64‑1 (MQ=255) tagcaagggcgaagccaatgccaGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGt > 1:1974401‑M2/24‑87 (MQ=255) TGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAg < 2:938912‑M1/80‑1 (MQ=255) TGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAg > 1:938912‑M1/1‑80 (MQ=255) TGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGAGCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCa > 2:1620724‑M1/1‑150 (MQ=255) gcaagggcgaagccaatgccaGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAg > 2:568035‑M2/22‑78 (MQ=255) gcaagggcgaagccaatgccaGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAg < 1:568035‑M2/57‑1 (MQ=255) CATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACt < 1:1608397‑M1/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCgtt < 2:454910/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCgtt > 1:2115340/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCgtt > 1:731677/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGACACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGGGGACACCATCGTCAGTATCTAGCCgtt < 2:1900155/150‑1 (MQ=255) ccTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCGTTGTTCt > 1:1808467/1‑150 (MQ=255) caGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGATGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCGTTGTTCTGTGCCg > 1:1362273‑M2/3‑150 (MQ=255) | GTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCGTTGTTCTGTGCCG > NC_002947/930079‑930374 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |