New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
AGCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCATTGCCGCTTGCGTCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGTTCGCCCGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCATTGGCATCACGCACGTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCACTCAGGGCCGTGCCACCTGGGCCGACCAGGATGTCGGTGACCGCCTCGGGCGGTGTGATATCCGGGGCTGTGAACTCCAGCGGTATCGAACTGTTGCCGGCGGC > NC_002947/941558‑941856 | aGCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCATTGCCGCTTGCGTCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGTTCGCCCGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCA > 1:1578978‑M1/1‑150 (MQ=255) gCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCATTGCCGCTTGCGTCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGTTCGCCCGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCAt > 2:1984393/1‑150 (MQ=255) gggACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCATTGCCGCTTGCGTCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGTTCGCCCGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCATTg < 2:725981/150‑1 (MQ=255) 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1:1168162‑M2/1‑27 (MQ=255) gCCActgtcgacgtgcgtgatgccaatggcaccgtgatcggcacgggtgtggtcggtgccaacggcaccttcctgatcgatctcgccccggccgctcagccgggcgaacaattgagcctggtgcagaccgacgcaagcggcaatgcttcc < 1:865278‑M1/150‑147 (MQ=255) gCCActgtcgacgtgcgtgatgccaatggcaccgtgatcggcacgggtgtggtcggtgccaacggcaccttcctgatcgatctcgccccggccgctcagccgggcgaacaattgagcctggtgcagaccgacgcaagcggcaatgcttcc < 2:2229543‑M1/150‑147 (MQ=255) cActgtcgacgtgcgtgatgccaatggcaccgtgatcggcacgggtgtggtcggtgccaacggcaccttcctgatcgatctcgccccggccgctcagccgggcgaacaattgagcctggtgcagaccgactcaagcggcaatgcttcctc > 2:1590418‑M1/1‑2 (MQ=255) cActgtcgacgtgcgtgatgccaatggcaccgtgatcggcacgggtgtggtcggtgccaacggcaccttcctgatcgatctcgccccggccgctcagccgggcgaacaattgagcctggtgcagaccgacgcaagcggcaatgcttcctc > 1:877174‑M1/1‑2 (MQ=255) cActgtcgacgtgcgtgatgccaatggcaccgtgatcggcacgggtgtggtcggtgccaacggcaccttcctgatcgatctcgccccggccgctcagccgggcgaacaattgagcctggtgcagaccgacgcaagcggcaatgcttcctc > 2:1911470‑M1/1‑2 (MQ=255) 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aTTGGCATCACGCACGTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCACTCAGGGCCGTGCCACCTGGGCCGACCAGGATGTCGGTGACCGCCTCGGGCGGTGTGATATCCGGGGCTGTGAACTCCAGCGGTATc < 2:116028/133‑1 (MQ=255) aTTGGCATCACGCACGTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCACTCAGGGCCGTGCCACCTGGGCCGACCAGGATGTCGGTGACCGCCTCGGGCGGTGTGATATCCGGGGCTGTGAACTCCAGCGGTATc > 1:116028/1‑133 (MQ=255) aTTGGCATCACGCACGTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCACTCAGGGCCGTGCCACCTGGGCCGACCAGGATGTCGGTGACCGCCTCGGGCGGTGTGATATCCGGGGCTGTGAACTCCAGCGGTATCGAACTGTTGCCggcggc > 1:193627/1‑150 (MQ=255) | AGCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCATTGCCGCTTGCGTCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGTTCGCCCGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCATTGGCATCACGCACGTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCACTCAGGGCCGTGCCACCTGGGCCGACCAGGATGTCGGTGACCGCCTCGGGCGGTGTGATATCCGGGGCTGTGAACTCCAGCGGTATCGAACTGTTGCCGGCGGC > NC_002947/941558‑941856 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |