| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1156328 = | 50 (0.560) | 18 (0.260) | 13/196 | NT | 33.1% | intergenic (+25/‑191) | PP_1013/yihS | sensor histidine kinase/aldose‑ketose isomerase |
| ? | NC_002947 | 1156401 = | 33 (0.470) | intergenic (+98/‑118) | PP_1013/yihS | sensor histidine kinase/aldose‑ketose isomerase | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ATGGGCTGGGGTTGGGCATTGCGCGCAACATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGACC > NC_002947/1156182‑1156472 | tgttcacatacaggttgaggggggtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCtt < 1:1300296‑M1/4‑1 (MQ=255)tgttcacatacaggttgaggggggtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCtt < 1:1293400‑M1/4‑1 (MQ=255) tGGGCTGGGGTTGGGCATTGCGCGCAACATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCttcttc < 1:514950/150‑1 (MQ=255) 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atacaggttgaggggggtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCGGGt < 1:1906968‑M1/11‑1 (MQ=255) atacaggttgaggggggtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggggcctgtgcgggccTCTTCGCGGGt > 1:572510‑M1/140‑150 (MQ=255) atacaggctgcggggggtcctgggccagcttgaaccttgccagtcgtgtgcgagttctagccagccgggtcgtggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgccattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGcgggg < 2:1837591‑M1/11‑2 (MQ=255) ttGGGCATTGCGCGCAACATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAAc < 2:644266/150‑1 (MQ=255) aggttgaggggggtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCGGGTGAAc < 1:599082‑M1/15‑1 (MQ=255) gttgaggggggtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCAGgggaagcc < 2:1942493‑M1/17‑4 (MQ=255) gCATTGCGCGCAACATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGc > 2:1216232/1‑150 (MQ=255) ggggtgtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCGGGTTCACccgcgaa > 1:828677‑M1/129‑147 (MQ=255) ggggtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCgg < 1:984759‑M1/9‑1 (MQ=255) ggggtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCgg > 2:984759‑M1/127‑135 (MQ=255) ggggtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTa > 2:1293400‑M1/127‑150 (MQ=255) gggtcatgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTAc > 1:107660‑M1/126‑150 (MQ=255) aaCATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATCGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGa > 1:1837591/1‑150 (MQ=255) tgggccagcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCgg > 2:1168377‑M1/120‑128 (MQ=255) tgggccagcttgatccttgccagacgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCgg < 1:1168377‑M1/9‑1 (MQ=255) tcgcccccATGGCTATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGAc < 2:195769/144‑1 (MQ=255) tcgcccccATGGCTATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGAc > 1:195769/6‑149 (MQ=255) aTCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTacgacgcaaa < 1:175182/150‑5 (MQ=255) tCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGa > 1:217375/1‑150 (MQ=255) gcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCGGGTGAAcc < 1:1357961‑M1/16‑1 (MQ=255) gcttgatccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCGGGTGAAcc > 2:1357961‑M1/113‑128 (MQ=255) ccATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCa > 2:435118/1‑150 (MQ=255) aTAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGa > 1:1801970/1‑144 (MQ=255) aTAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGa < 2:1801970/144‑1 (MQ=255) tccttgccagtcgtttgcgaattctagccagcggggtcatggcggatgtcacgaaggacgacgggattgtcaccgggcagtgacattttgggtgcctgtgcgggccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTg < 1:2091465‑M1/44‑1 (MQ=255) tGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGcgt < 2:2159035/150‑1 (MQ=255) 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1:624859‑M1/27‑35 (MQ=255) tttttGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGGGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGGGCGGGATCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGAGACCATCCCGTCGTCCTTc > 1:1038760/1‑150 (MQ=39) gtgcctgtgcgggccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCggg > 2:255604‑M1/16‑74 (MQ=255) gtgcctgtgcgggccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCggg < 1:255604‑M1/59‑1 (MQ=255) gTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATc > 1:627478/1‑150 (MQ=255) ctgtgcgggccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGa < 1:1093142‑M1/54‑1 (MQ=255) ctgtgcgggccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGa > 2:1093142‑M1/12‑65 (MQ=255) tgtgCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCa < 1:2162701/150‑1 (MQ=255) gggCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGAcc > 2:1092931/1‑150 (MQ=255) gggCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGAcc > 2:1705336/1‑150 (MQ=255) gCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAg > 2:431430/1‑87 (MQ=255) gCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAg < 1:431430/87‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGt < 2:1992614/109‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGt < 2:796701/109‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGt > 1:796701/1‑109 (MQ=255) | ATGGGCTGGGGTTGGGCATTGCGCGCAACATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGACC > NC_002947/1156182‑1156472 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |