| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 1184226 = | 86 (0.970) | 6 (0.070) | 5/238 | NT | 6.2% | coding (165/1458 nt) | mltF | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| ? | NC_002947 | 1184281 = | 97 (1.130) | coding (110/1458 nt) | mltF | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GCAGCCAGTACCGGGCCGGAGGGCTTGCCGAGGGCGTCGTACAGCTCGTCCAGGTTGTCGGCGGTCTCGATCTGCAGCTTTACGCCGAGATCGTCGGCGAAATGCTGGACCAGTTCGTACTCAAAGCCGGTTTCGCCGTTACGGTCCTGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCATCCTCCTTCACGCGCTCGAGGGTGCTGGGTTTTTCAACGCAGGCACCTAGCAGCAGAAAGAGTCCGGTTGCGAGAAGCCATTTGGCGCAACGCTGGCGCAAA > NC_002947/1184077‑1184373 | gcAGCCAGTACCGGGCCGGAGGGCTTGCCGAGGGCGTCGTACAGCTCGTCCAGGTTGTCGGCGGTCTCGATCTGCAGCTTTACGCCGAGATCGTCGGCGAAATGCTGGACCAGTTCGTACTCAAAGCCGGTTTCGCCGTTACGGTCCTgg < 2:2239261/150‑1 (MQ=255) atatggttgggccagtcctttgcgtatactgcaacctatgttcgcccacactgctttgcgccagcgttgcgccaaatggcttctcgcaaccggactctttctgctgctaggtgcctgcgttgaaaaacccagcaccctcgagcgcgtGaa > 2:281755‑M1/148‑150 (MQ=255) tatggttgggccagtcctttgcgtatactgcaacctatgttcgcccacactgctttgcgccagcgttgcgccaaatggcttctcgcaaccggactctttctgctgctaggtgcctgcgttgaaaaacccagcaccctcgagcgcgtGAAg > 1:1779683‑M1/147‑150 (MQ=255) 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gCCGTTACGGTCCTGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCAt < 2:1412837/62‑1 (MQ=255) gCCGTTACGGTCCTGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCAt > 1:1412837/1‑62 (MQ=255) ggTCCTGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCATCCTCCTTCACGCGCTCGAGGGTGCTGGGTTTTTCAACGCAGGCACCTAGCAGCAGAAAGAGTCCGGTTGCGAGAAGCCATTTGGCGCAACGCTGgc > 2:129180/1‑150 (MQ=255) tCCTGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCATCCTCCTTCACGCGCTCGAGGGTGCTGGGTTTTTCAACGCAGGCACCTAGCAGCAGAAAGAGTCCGGTTGCGAGAAGCCATTTGGCGCAACGCTGgcgc > 1:1606429/1‑150 (MQ=255) ccTGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCATCCTCCTTCACGCGCTCGAGGGTGCTGGGTTTTTCAACGCAGGCACCTAGCAGCAGAAAGAGTCCGGTTGCGAGAAGCCATTTGGCGCAACGCTGGCGCa > 2:2136510/1‑150 (MQ=255) cTGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCATCCTCCTTCACGCGCTCGAGGGTGCTGGGTTTTTCAACGCAGGCACCTAGCAGCAGAAAGAGTCCGGTTGCGAGAAGCCATTTGGCGCAACGCTGGCGCaa > 1:1449965/1‑150 (MQ=255) tGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCATCCTCCTTCACGCGCTCGTGGGTGCTGGGTTTTTCAACGCAGGCACCTAGCAGCAGAAAGAGTGCGGTTGCGAGAAGCCATTTGGCGCAACGCTGGCGCaaa < 1:835825/150‑1 (MQ=255) tGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCATCCTCCTTCACGCGCTCGAGGGTGCTGGGTTTTTCAACGCAGGCACCTAGCAGCAGAAAGAGTCCGGTTGCGAGAAGCCATTTGGCGCAACGCTGGCGCaaa > 1:641504/1‑150 (MQ=255) tGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCATCCTCCTTCACGCGCTCGAGGGTGCTGGGTTTTTCAACGCAGGCACCTAGCAGCAGAAAGAGTCCGGTTGCGAGAAGCCATTTGGCGCAACGCTGGCGCaaa > 1:1801270/1‑150 (MQ=255) | GCAGCCAGTACCGGGCCGGAGGGCTTGCCGAGGGCGTCGTACAGCTCGTCCAGGTTGTCGGCGGTCTCGATCTGCAGCTTTACGCCGAGATCGTCGGCGAAATGCTGGACCAGTTCGTACTCAAAGCCGGTTTCGCCGTTACGGTCCTGGAAGTAGGTTGCCGGGCTGTTGCGTGTGATCACGCGCAGCACGCCATCCTCCTTCACGCGCTCGAGGGTGCTGGGTTTTTCAACGCAGGCACCTAGCAGCAGAAAGAGTCCGGTTGCGAGAAGCCATTTGGCGCAACGCTGGCGCAAA > NC_002947/1184077‑1184373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |