| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1195794 | 98 (1.110) | 6 (0.070) | 6/242 | NT | 5.6% | coding (278/426 nt) | xcpP | type II secretion pathway protein XcpP |
| ? | NC_002947 | = 1195830 | 105 (1.210) | coding (314/426 nt) | xcpP | type II secretion pathway protein XcpP | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCGGCTTCAAGCGGCAAGGATGAA > NC_002947/1195645‑1195943 | gCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCG > 1:1090742‑M1/1‑150 (MQ=255) gCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCAc < 1:2136212/150‑1 (MQ=255) cccGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCAcc > 1:57427/1‑150 (MQ=255) gggCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTg > 2:317021/1‑150 (MQ=255) gggCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTg < 2:1074015/150‑1 (MQ=255) aTGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCcgc > 1:935805/1‑150 (MQ=255) tggttggtCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCcgcg < 1:1944615/150‑1 (MQ=255) tggtCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCa < 1:1895661/150‑1 (MQ=255) ggtCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAg < 1:2172919/150‑1 (MQ=255) gtCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGTTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAgc < 1:1950893/150‑1 (MQ=255) tCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAgcg > 1:1214828/1‑150 (MQ=255) aCTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAg < 2:1890573/146‑1 (MQ=255) aCTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAg > 1:1890573/1‑146 (MQ=255) aCTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGcc > 1:2003320/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTc > 2:133541/1‑142 (MQ=255) tGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTc < 1:133541/142‑1 (MQ=255) tGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTg > 1:1764224/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTg > 2:2188455/1‑150 (MQ=255) aGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGgcgc > 1:1593732/1‑150 (MQ=255) gccgccTGACGACCGCGCGATCACCATCTCTCGTCTGCCGCTGTAATACCTCGGCAGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGATACGGCGAGCAAGTGCGcaccctggcgccaggcgctgaccgcgggccagg < 1:877683‑M1/150‑34 (MQ=255) gccgccCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAgg < 2:935805/150‑1 (MQ=255) cgccCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGa < 2:1364888/150‑1 (MQ=255) gccCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTc > 1:1671292/1‑131 (MQ=255) gccCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTc < 2:1671292/131‑1 (MQ=255) gccCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGAt > 2:2228608/1‑150 (MQ=255) cgacgaCGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGt > 2:656765/1‑150 (MQ=255) acgacgGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCCCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGtgc < 1:1034046/150‑1 (MQ=255) cgGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCa < 1:2051365/150‑1 (MQ=255) ggCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAg > 2:793727/1‑150 (MQ=255) ggCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAg < 2:1970049/150‑1 (MQ=255) ggCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAg < 2:2341468/150‑1 (MQ=255) gcgcCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAgg < 1:886624/150‑1 (MQ=255) ccatcaccatcaCTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCcg > 2:1727461/1‑112 (MQ=255) ccatcaccatcaCTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCcg < 1:1727461/112‑1 (MQ=255) atcaccatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATc < 1:1314106/150‑1 (MQ=255) atcaccatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTA‑GGCGAGCAAGTGCGatccctggcgccaggcgctgaccgcgggccagggtgcgcact > 1:2032821‑M1/1‑97 (MQ=255) atcaccatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTA‑GGCGAGCAAGTGCGatccctggcgccaggcgctgaccgcgggccagggtgcgcact < 2:2032821‑M1/139‑43 (MQ=255) tcaccatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCg > 2:1345030/1‑150 (MQ=255) ccatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACa < 2:1614189/150‑1 (MQ=255) catcacTCGCCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAg > 2:1536431/1‑150 (MQ=255) atcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGc < 2:1214828/150‑1 (MQ=255) cTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATg > 2:75120/1‑150 (MQ=255) tagTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATgg > 2:187785/3‑150 (MQ=255) tCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATgg > 2:420908/1‑150 (MQ=255) 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cATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGccct > 1:1516668‑M2/1‑146 (MQ=255) tGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTCAGCGCCTGCCCTGgc < 2:2307886/150‑1 (MQ=255) ccgccAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGAtttt > 2:1137495/1‑112 (MQ=255) ccgccAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGAt < 2:476428/109‑1 (MQ=255) ccgccAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGAt > 1:476428/1‑109 (MQ=255) ccgccAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAGCCAGGTGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGgccgc < 1:2370297/150‑1 (MQ=255) cgccAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGcaggcgctcacgccgcccctggttgtt < 1:1754124‑M1/150‑28 (MQ=255) gtggtgCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCAc < 1:582047/142‑1 (MQ=255) gtggtgCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCAc > 2:582047/1‑142 (MQ=255) gctgcGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGAc < 2:862707/150‑1 (MQ=255) tgcGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCg > 2:1286572/1‑150 (MQ=255) cgcTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCGGc > 1:118152/1‑150 (MQ=255) cgcTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCGGc < 2:118152/150‑1 (MQ=255) tACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGc > 2:1896720/1‑132 (MQ=255) cGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTAAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCGGCTTCAAGCg > 1:2244765/1‑150 (MQ=255) gAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATcgcacttgctcgccgtagcgcagcaccaccacactggcggccaatggctgggccttgaggccgccgaggtattg > 2:903229‑M2/1‑47 (MQ=255) gAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCt > 2:228889/1‑110 (MQ=255) gAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCt < 1:228889/110‑1 (MQ=255) gAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCGGCTTCAAGCgg > 2:1633418/1‑150 (MQ=255) gAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCGGCTTCAAGCgg > 2:934810/1‑150 (MQ=255) gCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCGGCTTCAAGCGGCa > 1:1817646/1‑150 (MQ=255) aGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATcgcacttgctcgcctagcgcagcaccaccacactggcggccaatggctgggccttgaggccgccgaggtattgcagcggcagacgagtgatggtgat < 2:2032821‑M2/139‑98 (MQ=255) gcACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCGGCTTCAAGCGGCAAGGATGaa > 1:221591/1‑150 (MQ=255) gcACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCGGCTTCAAGCGGCAAGGATGaa > 2:169771/1‑150 (MQ=255) gatccctggcgccaggcgctgaccgcgggccagggtgcgcacttgctcgccgtagcgcagcaccaccacactggcggccaatggctgggccttgaggccgccgaggtattgcagcggcagacgagtgatggtgatggcgccgtcgtcggg > 2:993797‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTTCAACAACCAGGGGCGGCGTGAGCGCCTGCCCTGGCCGCCACGCCCCGCCGTGACCGGCTTCAAGCGGCAAGGATGAA > NC_002947/1195645‑1195943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |