New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1219798 = | 92 (1.040) | 5 (0.060) | 5/230 | NT | 5.7% | coding (162/336 nt) | glmP | alginate biosynthesis membrane protein |
? | NC_002947 | 1219825 = | 79 (0.950) | coding (135/336 nt) | glmP | alginate biosynthesis membrane protein |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ACCAGCACGGTCGCGGCGATCAGCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGCCTGCGCCCAGGGCCGCTTTGAA > NC_002947/1219649‑1219947 | aCCAGCACGGTCGCGGCGATCAGCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAgg > 1:1813123/1‑150 (MQ=255) ccAGCACGGTCGCGGCGATCAGCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGt > 2:1589889/1‑150 (MQ=255) cAGCACGGTCGCGGCGATCAGCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTc > 2:1361963/1‑150 (MQ=255) ctggaaaacaacgtggacctggtattcaaagcggccctgggcgcaggcgtggtgctgttgctggcagtgctgtcgaaaacgcgcaactactacatcgcagggctggtgccgctgttccccaccttcgccctgattgcccactacatcgtc > 2:1563586‑M1/148‑150 (MQ=255) aGCACGGTCGCGGCGATCAGCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCg < 1:1135328/150‑1 (MQ=255) ggTCGCGGCGATCAGCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAAt > 1:247543/1‑150 (MQ=255) cAGCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCtt < 2:2024633/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCGAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGc > 2:581299/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGc < 2:965844/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGc < 2:1813123/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGc > 2:1881623/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGc < 2:866165/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGcc > 1:997006/1‑150 (MQ=255) aGGGCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCcga > 2:954122/1‑150 (MQ=255) ggCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCcgac < 2:289281/150‑1 (MQ=255) gCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCcgacg > 2:1888612/1‑150 (MQ=255) ccACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCcgacga < 2:2173405/150‑1 (MQ=255) caaagcggccctgggcgcaggcgtggtgctgttgctggcagtgctgtcgaaaacgcgcaactactacatcgcagggctggtgccgctgttccccaccttcgccctgattgcccactacatcGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCcgacga > 1:1299588‑M1/122‑150 (MQ=255) 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tCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAggg > 2:925293/1‑150 (MQ=255) cTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGt > 1:1311765/1‑150 (MQ=255) tCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCGATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTg > 1:623209/1‑150 (MQ=255) tCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTgg > 2:800696/1‑132 (MQ=255) tCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTgg < 1:800696/132‑1 (MQ=255) 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cGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCaa < 1:925293/150‑1 (MQ=255) gACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAAc < 1:954122/150‑1 (MQ=255) tGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGcacca < 2:575435/150‑1 (MQ=255) gCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGcaccac < 1:457906/150‑1 (MQ=255) cAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGc < 2:557133/150‑1 (MQ=255) aaaCAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGcc < 2:387206/150‑1 (MQ=255) aaCAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGCCt < 1:1111571/150‑1 (MQ=255) aCAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAgg > 2:1772717/1‑65 (MQ=255) aCAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAgg < 1:1772717/65‑1 (MQ=255) aGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGCCTgcg < 2:231447/150‑1 (MQ=255) gATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTCGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGCGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGCCTGCGcc < 1:1361963/150‑1 (MQ=255) tggtggTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGCCTGCGCCCa < 2:538196/150‑1 (MQ=255) ggtggtCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGCCTGCGCCCAg < 1:342910/150‑1 (MQ=255) gtCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCTTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTCATTTCGCCCTGCCATCAACAGCAGCACGCCTGCGCCCAGGGcc > 2:1231742/1‑150 (MQ=255) cTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGCCTGCGCCCAGGGCCGc > 1:1968443/1‑150 (MQ=255) cTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGCCTGCGCCCAGGGCCGc > 2:2336114/1‑150 (MQ=255) aGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAg < 2:569069/122‑1 (MQ=255) aGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAg > 1:569069/1‑122 (MQ=255) GTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGCCTGCGCCCAGGGCCGCTTTGaa < 1:582906‑M1/150‑1 (MQ=255) | ACCAGCACGGTCGCGGCGATCAGCCAGGCCACTGTGGCCAGCGCCATCGAAGCCTCGA‑GGCGCAAGCGGTCGACCAGTACATACAGGGTTGCCAGGTACACGAAATACGGAATGATCGACCACATGCCAAACAGGATGGTGGTCTTGAGGTCGGCAATGCTGCGCCCCTTGCCGACGATGTAGTGGGCAATCAGGGCGAAGGTGGGGAACAGCGGCACCAGCCCTGCGATGTAGTAGTTGCGCGTTTTCGACAGCACTGCCAGCAACAGCACCACGCCTGCGCCCAGGGCCGCTTTGAA > NC_002947/1219649‑1219947 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |