New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 1258228 | 90 (1.020) | 9 (0.110) | 7/236 | NT | 9.3% | coding (137/261 nt) | PP_1101 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1258246 | 89 (1.050) | coding (155/261 nt) | PP_1101 | hypothetical protein |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
ACGCCGGTGTGCATGATGTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGCCAGACGC > NC_002947/1258080‑1258375 | aCGCCGGTGTGCATGATGTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCg > 2:2028736/1‑150 (MQ=255) aCGCCGGTGTGCATGATGTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCg > 2:1786527/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGTGCATGATGTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCggg < 2:1220783/150‑1 (MQ=255) gtgtGCATGATGTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGc > 2:78289/1‑150 (MQ=255) cATGATGTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCGCCACTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGGGTGcc > 1:635108/1‑150 (MQ=255) cATGATGTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGcc > 2:327325/1‑150 (MQ=255) atgatgTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCtgatggggcac < 1:1360153‑M1/148‑12 (MQ=255) atgatgTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCtgatggggcac > 2:1360153‑M1/1‑137 (MQ=255) atgatgTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGccc < 1:445824/150‑1 (MQ=255) cATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAgcc > 1:118717‑M2/1‑147 (MQ=255) tCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGCAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAgcctg < 2:1166381‑M2/150‑6 (MQ=255) tCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAgcctg < 1:893964‑M2/150‑6 (MQ=255) tttCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCACGCTGCAAGACCTACATCCCAATCACTAAGTGGTCTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGGCCCATCAGCCTGAcccc > 1:1499105/1‑150 (MQ=255) 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> 1:1499591/1‑150 (MQ=255) aaTGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAAccgcc > 1:884019/1‑150 (MQ=255) aaTGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGACCCATCCGCCTGACCCCGATACCCCGCAAccgcc < 1:1261231/150‑1 (MQ=255) aTGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAAccgccg > 1:2217669/1‑150 (MQ=255) aaCTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAAc > 1:1724606/1‑150 (MQ=255) aCTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTAACAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAAcc > 1:443333/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) ccGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTgaga > 2:1781455/1‑150 (MQ=255) cGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGAc < 2:1542146/150‑1 (MQ=255) gTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATTCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCa < 2:85781/150‑1 (MQ=255) gTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCAGCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCa > 1:597784/1‑150 (MQ=255) tGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCAt > 1:323978/1‑150 (MQ=255) 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cccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCgg > 1:940829/1‑150 (MQ=255) ccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAgcctgcatgggcagcgggtgcgccagcagtgaccagggcaacaacccaacgtgattgggctgcaggcctgccagcttggcactgattgcgggatggagtttcattggctgctcctgacgaaa < 1:1247115‑M2/150‑123 (MQ=255) ccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGTCCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGc < 1:265670/150‑1 (MQ=255) ccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGc < 2:1101398/141‑1 (MQ=255) ccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGc > 1:1101398/1‑141 (MQ=255) ccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGc < 1:1690903/150‑1 (MQ=255) ccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGc > 1:1306240/1‑150 (MQ=255) ccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGc > 2:1690903/1‑150 (MQ=255) ccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGc < 2:152823/150‑1 (MQ=255) ccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGc < 1:834761/150‑1 (MQ=255) ccATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGc > 1:453988/1‑150 (MQ=255) cATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAgcctgcatgggcagcgggtgcgccagcagtgaccagggcaacaacccaacgtgattgggctgcaggcctgccagcttggcactgattgcgg > 2:1920617‑M2/1‑27 (MQ=255) cATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAgcctgcatgggcagcgggtgcgccagcagtgaccagggcaacaacccaacgtgattgggctgcaggcctgccagcttggcactgattgcgg < 1:1920617‑M2/118‑92 (MQ=255) tGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGCCAg > 2:1853713/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGCCAGAc < 1:299641/150‑1 (MQ=255) ggCtgatggggcacgccccccgcctgcatgggcagcgggtgcgccagcagtgaccagggcaacaacccaacgtgattgggctgcaggcctgccagcttggcactgattgcgggatggagtttcattggctgctcctgacgaaagccgatg > 1:118717‑M1/1‑3 (MQ=255) ggCGGGGGGCGTGCCCC‑‑CCgcctgcatgggcagcgggtgcgccagcagtgaccagggcaacaacccaacgtgattgggctgcaggcctgccagcttg > 1:993625‑M2/1‑19 (MQ=255) | ACGCCGGTGTGCATGATGTGCATCGGCTTTCGTCAGGAGCAGCCAATGAAACTCCATCCCGCAATCAGTGCCAAGCTGGCAGGCCTGCAGCCCAATCACGTTGGGTTGTTGCCCTGGTCACTGCTGGCGCACCCGCTGCCCATGCAGGCGGGGGGCGTGCCCCATCAGCCTGACCCCGATACCCCGCAACCGCCGGAACCCGGTGAGACGCCTCCCATGGAGCCGGGTGAGCCGACCTTGCCGGACGAGCCGCCTCCCGCCCCTGTGGCCTGAGCGTCGCTAAAGCGGCCAGACGC > NC_002947/1258080‑1258375 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |