New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GTGCTGATGATCGCCGTCTTGGTCGTGCCAGCGCGCGGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTGGGCATCCGGTGCCGGGGTACCGGCATGGTAATGCCCGCAGCAGGCGTCAAGCAGGTTGC > NC_002947/1283083‑1283381 | gTGCTGATGATCGCCGTCTTGGTCGTGCCAGCGCGCGGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAG < 2:1228462‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGATGATCGCCGTCTTGGTCGTGCCAGCGCGCGGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGcc < 2:369239/150‑1 (MQ=255) gatCGCCGTCTTGGTCGTGCCAGCGCGCGGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCtt > 1:1712825/1‑150 (MQ=255) 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cTTGGTCGTGCCAGCGCGCGGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGcccagcaagccggcctg < 2:210330‑M1/150‑18 (MQ=255) ttGGTCGTGCCAGCGCGCGGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTGCTGGGctgg < 1:314389‑M2/150‑5 (MQ=255) tCGTGCCAGCGCGCGGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAgg < 1:770091/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGCGCGGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGggtg < 1:626219/150‑1 (MQ=255) cAGCGCGCGGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGgtggtg < 2:2212954/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTAc < 2:655119/150‑1 (MQ=255) cgGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCa < 2:317015/150‑1 (MQ=255) ggTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAg < 1:1535939/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTa < 1:457787/150‑1 (MQ=255) aGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTgctgg < 2:1156104/122‑1 (MQ=255) aGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTgctgg > 1:1156104/1‑122 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1:1169303‑M1/1‑5 (MQ=255) tCCAGGCCGGCTTGCTGGGctggaccgtgccgccatggccgactggagtgcacagagcacctggctgggcctggaggtggaaagcgcagaagtgctgggcggccaacccga > 2:1169303‑M2/1‑19 (MQ=255) tCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAgcgc > 1:1348471/1‑84 (MQ=255) tCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTGGGCATCCGGTGCCGGGGTACCGGCATGGTAATGCCCGCAGCAGGCGTCAAGCAgg > 2:356658/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTGGGCATCCGGTGCCGGGGTACCGGCATGGTAATGCCCGCAGCAGGCGTCAAGCAgg < 1:2048406/150‑1 (MQ=255) ccagcccagcaagccggcctggaccgtgctgccatggccgactggagtgcacagagcacctggctgggcctggaggtggaaagcgcagaagtgctgggcggccaacccgagcacagcttcgtcaccttcaccgcgcgctggcacgaccaa < 1:314389‑M1/150‑147 (MQ=255) cAGGCCGGCTTGCTGGGctggaccgtgctgccatggccgactggagtgcacagagcacctggctgggcctggaggtggaaagcgcagaagtgctgggcggccaacccgagcacagcttcgtcaccttcaccgcgcgctggcacgaccaag < 2:210330‑M2/150‑134 (MQ=255) cAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTgg < 2:108626/94‑1 (MQ=255) cAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTgg > 1:108626/1‑94 (MQ=255) cAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTGGGCATCCGGTGCCGGGGTACCGGCAttacc < 1:1404569/123‑5 (MQ=255) cAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTGGGCATCCGGTGCCGGGGTACCGGCAttacc > 2:1404569/1‑119 (MQ=255) cAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTGGGCATCCGGTGCCGGGGTACCGGCATGGTAATGCCCGCAGCAGGCGTCAAGCAGGtt < 1:1788406/150‑1 (MQ=255) agcccagcaagccggcctggaccgtgctgccatggccgactggagtgcacagagcacctggctgggcctggaggtggaaagcgcagaagtgctgggcggccaacccgagcacagcttcgtcaccttcaccgcgcgctggcacgaccaaga > 1:115367‑M1/1‑2 (MQ=255) aGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTGGGCATCCGGTGCCGGGGTACCGGCATGGTAATGCCCGCAGCAGGCGTCAAGCAGGTtg > 2:2152145/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTGGGCATCCGGTGCCGGGGTACCGGCATGGTAATGCCCGCAGCAGGCGTCAAGCAGGTtgc < 1:1572426/150‑1 (MQ=255) gcccagcaagccggcctggaccgtgctgccatggccgactggagtgcacagagcacctggctgggcctggaggtggaaagcgcagaagtgctgggcggccaacccgagcacagcttcgtcaccttcaccgcgcgctggcacgaccaagac < 2:949892‑M1/150‑150 (MQ=255) gcccagcaagccggcctggaccgtgctgccatgaacatttggagtgcacagagcacctggctgggcctggagatggaaagcgcagaagtgctgggcggccaacccgagcacagcttcgtcaccttcaccgcgcgctggcacgaccaagac > 1:1999845‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTGCTGATGATCGCCGTCTTGGTCGTGCCAGCGCGCGGTGAAGGTGACGAAGCTGTGCTCGGGTTGGCCGCCCAGCACTTCTGCGCTTTCCACCTCCAGGCCCAGCCAGGTGCTCTGTGCACTCCAGTCGGCCATGGCAGCACGGTCCAGGCCGGCTTGCTGGGCTGGTAGGGTGGTGGCTACCAGGTAGTCGACCAGGCCCAGCACGTAGGCACTGTAGCGTGAGCGCATCAGGGCCTGGGCATCCGGTGCCGGGGTACCGGCATGGTAATGCCCGCAGCAGGCGTCAAGCAGGTTGC > NC_002947/1283083‑1283381 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |