| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1375316 | 81 (0.910) | 7 (0.080) | 4/238 | NT | 7.7% | coding (930/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup |
| ? | NC_002947 | = 1375348 | 89 (1.040) | coding (962/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TGGTTCATCCTGGTGCTCCCGGCGCTGGTGCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCT > NC_002947/1375167‑1375465 | tGGTTCATCCTGGTGCTCCCGGCGCTGGTGCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCC > 1:624187‑M1/1‑150 (MQ=255) gTTCATCCTGGTGCTCCCGGCGCTGGTGCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCAc > 1:1905303/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCTCCCGGCGCTGGTGCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATc < 2:1169344/150‑1 (MQ=255) tGCTCCCGGCGCTGGTGCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCt > 2:736942/1‑150 (MQ=255) tCCCGGCGCTGGTGCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGc > 2:54560/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTg < 1:491004/150‑1 (MQ=255) tGGTGCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCAGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGa < 2:1666466/150‑1 (MQ=255) gTGCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGAtt > 2:488174/1‑150 (MQ=255) gCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTc > 1:185828/1‑150 (MQ=255) cgaTTACTTCGGCCAGGGTGCACTGCTGCTCCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCCATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCGGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCTTGCCAACGGTTTGCGCCTCGCAGGCGGTCATTTCCgg < 1:694384/148‑1 (MQ=255) aaTTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGg < 1:487165‑M2/150‑2 (MQ=255) aaTTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGg > 1:54560‑M2/1‑149 (MQ=255) aaTTACTTCGGCCAGGATGCATTTCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCCCGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGg < 2:216976‑M2/150‑2 (MQ=255) ttACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggc < 2:767956‑M2/150‑4 (MQ=255) aCTTCGGCCAGGGTGCAGTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCccggaaatcaccgcctgcgaggcgataaccgtggcca < 1:1372233‑M1/150‑38 (MQ=255) attCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCtt > 2:1653227/2‑150 (MQ=255) ttCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTtc > 1:895043/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTtc > 2:921478/1‑150 (MQ=255) 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accaTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAAc > 2:1600266/1‑150 (MQ=255) ccaTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACt < 1:1600266/150‑1 (MQ=255) ccaTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCAGGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACt > 1:31575/1‑150 (MQ=255) caTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaat > 2:1682776‑M2/1‑39 (MQ=255) caTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaat < 1:1682776‑M2/136‑98 (MQ=255) caTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacg < 1:2262083‑M2/101‑63 (MQ=255) caTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacg > 2:2262083‑M2/1‑39 (MQ=255) caTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGATAA‑‑‑CCGTggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcaga < 2:662760‑M2/91‑56 (MQ=255) caTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGATAA‑‑‑CCGTggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcaga > 1:662760‑M2/1‑36 (MQ=255) aTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGt > 1:313288/1‑138 (MQ=255) aTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGt < 2:313288/138‑1 (MQ=255) tGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcactgcaccctggccgaagt < 1:1372233‑M2/150‑114 (MQ=255) ggCCccggaaatcaccgcctgcgaggcgataaccgtggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctcc < 2:1148381‑M1/115‑112 (MQ=255) ggCCccggaaatcaccgcctgcgaggcgataaccgtggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctcc > 1:1148381‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCccggaaatcaccgcctgcgaggcgataaccgtggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaatgcaccctggccgaagtaa < 2:767956‑M1/150‑148 (MQ=255) ccACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGc > 1:2274145/1‑150 (MQ=255) cccggaaatcaccgcctgcgaggcgataaccgtggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaatgcaccctggccgaagtaatt > 1:54560‑M1/1‑1 (MQ=255) cccggaaatcaccgcctgcgaggcgataaccgtggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaatgcaccctggccgaagtaatt < 1:487165‑M1/150‑150 (MQ=255) cccggaaatcaccgcctgcgaggcgataaccggggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagaaatgcatcctggccgaagtaatt < 2:216976‑M1/150‑150 (MQ=255) cACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCt > 1:931430/1‑125 (MQ=255) cACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCt < 2:931430/125‑1 (MQ=255) cACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTg < 2:377993/131‑1 (MQ=255) cACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTg > 1:377993/1‑131 (MQ=255) | TGGTTCATCCTGGTGCTCCCGGCGCTGGTGCTCAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCT > NC_002947/1375167‑1375465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |