| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1375316 | 81 (0.910) | 7 (0.080) | 4/238 | NT | 7.7% | coding (930/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup |
| ? | NC_002947 | = 1375348 | 89 (1.040) | coding (962/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCATCG > NC_002947/1375199‑1375494 | cgaTTACTTCGGCCAGGGTGCACTGCTGCTCCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCCATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCGGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCTTGCCAACGGTTTGCGCCTCGCAGGCGGTCATTTCCgg < 1:694384/148‑1 (MQ=255) aaTTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGg < 1:487165‑M2/150‑2 (MQ=255) aaTTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGg > 1:54560‑M2/1‑149 (MQ=255) aaTTACTTCGGCCAGGATGCATTTCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCCCGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGg < 2:216976‑M2/150‑2 (MQ=255) ttACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggc < 2:767956‑M2/150‑4 (MQ=255) ttCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTtc > 2:921478/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTtc > 1:895043/1‑150 (MQ=255) ccAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCt < 2:1761516/150‑1 (MQ=255) cAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGTGCCTTCTCCCTg < 2:1726729/150‑1 (MQ=255) ggTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGAcc < 2:1376279/150‑1 (MQ=255) gctgctgcAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGc < 2:487165/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCGGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCt > 2:1615590/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCAtt > 2:356545/1‑144 (MQ=255) aaaCCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCAtt < 1:356545/145‑2 (MQ=255) aaaCCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCt > 2:2409388/1‑150 (MQ=255) aaCCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCa > 1:1617510/1‑137 (MQ=255) aaCCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCa < 2:1617510/137‑1 (MQ=255) ggAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggcc < 2:1148381‑M2/115‑5 (MQ=255) ggAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggcc > 1:1148381‑M2/1‑111 (MQ=255) 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ccACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGc > 1:2274145/1‑150 (MQ=255) cACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCt > 1:931430/1‑125 (MQ=255) cACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCt < 2:931430/125‑1 (MQ=255) cACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTg > 1:377993/1‑131 (MQ=255) cACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTg < 2:377993/131‑1 (MQ=255) aCGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGt < 1:1675682/137‑1 (MQ=255) aCGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGt > 2:1675682/1‑137 (MQ=255) aCGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTg > 2:1736968/1‑150 (MQ=255) ggTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAg > 2:59694/1‑102 (MQ=255) ggTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAg < 1:59694/102‑1 (MQ=255) ggTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGAt > 2:323641/1‑150 (MQ=255) ggTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGAt < 1:1443079/150‑1 (MQ=255) gTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGAtg < 2:789995/150‑1 (MQ=255) aTCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGCTCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGAtggtg > 1:1047583/1‑150 (MQ=255) gCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGc < 2:972890/150‑1 (MQ=255) ccTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGt > 2:1776052/1‑127 (MQ=255) ccTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGt < 1:1776052/127‑1 (MQ=255) cGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCgtgg < 2:1905303/150‑1 (MQ=255) cGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCgtgg < 1:1066733/150‑1 (MQ=255) tGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTgg < 2:2274145/150‑1 (MQ=255) tGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTgg < 1:992189/150‑1 (MQ=255) tttCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCa > 2:2063359/1‑150 (MQ=255) ccGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCGAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCATCg < 2:2343399/150‑1 (MQ=255) | CAATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCATCG > NC_002947/1375199‑1375494 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |